FuNGI

A0A4U0Y180

Protein Details

Accession

A0A4U0Y180

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
184-203	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
489-510	KRRKQVDDKREAGAKRRKLETE

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 9.5, cyto 5.5, nucl 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

AFVFPNARVAPLHTITFAVTSHYGQPAARRTIPDCVFEARLHRLQTPSNQCDEQLNLIWIPYSSQRSQTHRPFRLTETGTMGVPALFRWLSQKYPKIISPVIEEQPREIEGEEVPIDSRGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEEGPPPATEEEMMLAVFEYTERVVKMVRPRKLMMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKQKDDDKEEHLKLLKAQGKLSEEMDKSGAIKKTWDSNAITPGTPFMEILAMSLRYWIAYKLNTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRNSPEHNPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQDSKPRTCHLCGQVGHMAAECRGEAKVKQGQFDEKQNAAPLKPFIWLHVSILREYLAIELDVPSLPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREQGIDTLIAIWRDNLPVMGGYVTKDGHVDLARAQFILEGLAKQEDAIFKRRKQVDDKREAGAKRRKLETERRNNRNSGAGNGYNDPSTPVSYPGSRRRGEPIPDINALPTFAPGQAQTAADPRYTSITHESVVNRGAVTNANVANRSAAAVLKEKLLAGKAAKAAETQIHEATNNGGVEALPASGSSTAEAAKTPPSALGKRKAELMEEDNSGTPGRNTPDSAASPATPKTDPDEPAPDNIRLWEDGYADRYYEQKFKADPKDIGFRHKVAHAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLDKMAISFDKGKPFRPYEQLMGVMPAASRHTIPDVFHPLMTDEDSDIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVALLPFIDAERLLAAMDTKYPLLTHEQVARNERGKDVLLFSTRHPLYEEVAMNFYSKKQGAPKYKLNVRVSEGLAGKVEKNDTYLPQSSLSFPLSKGVMPDLDEDYSISVHYEMPKSTHVHKSMLLRGVKFGTLALDHADIEATRGRSRQSGRHFGGVPLNDNYTNGGRGRGRGGRINYGADSRQNYNDSRNGYSGDSRSGHVQQDGRPNPFAAHLNPQFVPPPQFAVQNGYGAPPPGWVPPPPHLARGPPPPPPGQYGYPPQGYGGQYQGNGNGGGYGGQQHGQSGGRRGGGYDRC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.23
4	0.2
5	0.16
6	0.15
7	0.16
8	0.19
9	0.2
10	0.21
11	0.21
12	0.28
13	0.32
14	0.37
15	0.39
16	0.39
17	0.4
18	0.49
19	0.5
20	0.47
21	0.42
22	0.4
23	0.39
24	0.37
25	0.39
26	0.37
27	0.39
28	0.38
29	0.39
30	0.38
31	0.41
32	0.49
33	0.54
34	0.52
35	0.53
36	0.51
37	0.48
38	0.48
39	0.45
40	0.4
41	0.32
42	0.29
43	0.24
44	0.23
45	0.22
46	0.18
47	0.18
48	0.19
49	0.23
50	0.22
51	0.31
52	0.38
53	0.45
54	0.55
55	0.63
56	0.68
57	0.7
58	0.73
59	0.69
60	0.68
61	0.7
62	0.64
63	0.57
64	0.52
65	0.46
66	0.4
67	0.36
68	0.31
69	0.22
70	0.18
71	0.14
72	0.12
73	0.1
74	0.11
75	0.15
76	0.18
77	0.24
78	0.33
79	0.4
80	0.41
81	0.46
82	0.49
83	0.51
84	0.5
85	0.46
86	0.45
87	0.45
88	0.46
89	0.45
90	0.43
91	0.38
92	0.38
93	0.36
94	0.29
95	0.23
96	0.18
97	0.14
98	0.17
99	0.16
100	0.14
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.12
105	0.16
106	0.19
107	0.21
108	0.23
109	0.26
110	0.3
111	0.32
112	0.34
113	0.33
114	0.29
115	0.29
116	0.27
117	0.23
118	0.2
119	0.16
120	0.14
121	0.11
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.11
129	0.16
130	0.17
131	0.17
132	0.21
133	0.25
134	0.29
135	0.32
136	0.3
137	0.28
138	0.27
139	0.28
140	0.23
141	0.18
142	0.15
143	0.13
144	0.11
145	0.08
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.1
156	0.15
157	0.26
158	0.33
159	0.39
160	0.43
161	0.45
162	0.49
163	0.52
164	0.5
165	0.42
166	0.38
167	0.33
168	0.27
169	0.27
170	0.22
171	0.18
172	0.16
173	0.14
174	0.09
175	0.12
176	0.17
177	0.24
178	0.34
179	0.43
180	0.53
181	0.64
182	0.72
183	0.78
184	0.8
185	0.77
186	0.73
187	0.75
188	0.75
189	0.73
190	0.76
191	0.71
192	0.68
193	0.72
194	0.69
195	0.6
196	0.58
197	0.51
198	0.47
199	0.51
200	0.48
201	0.44
202	0.43
203	0.42
204	0.36
205	0.42
206	0.41
207	0.34
208	0.34
209	0.34
210	0.35
211	0.35
212	0.35
213	0.34
214	0.29
215	0.29
216	0.28
217	0.23
218	0.21
219	0.26
220	0.26
221	0.19
222	0.21
223	0.21
224	0.29
225	0.31
226	0.34
227	0.31
228	0.32
229	0.38
230	0.37
231	0.35
232	0.27
233	0.26
234	0.23
235	0.19
236	0.16
237	0.1
238	0.09
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.09
246	0.08
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.12
251	0.15
252	0.18
253	0.25
254	0.24
255	0.27
256	0.27
257	0.29
258	0.33
259	0.31
260	0.27
261	0.25
262	0.29
263	0.27
264	0.27
265	0.24
266	0.19
267	0.22
268	0.21
269	0.19
270	0.14
271	0.14
272	0.12
273	0.12
274	0.11
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.17
283	0.26
284	0.27
285	0.28
286	0.34
287	0.39
288	0.43
289	0.46
290	0.52
291	0.5
292	0.57
293	0.6
294	0.56
295	0.6
296	0.54
297	0.48
298	0.38
299	0.32
300	0.24
301	0.22
302	0.2
303	0.12
304	0.11
305	0.1
306	0.09
307	0.07
308	0.06
309	0.03
310	0.02
311	0.02
312	0.03
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.16
321	0.18
322	0.22
323	0.23
324	0.24
325	0.23
326	0.26
327	0.25
328	0.22
329	0.28
330	0.27
331	0.28
332	0.29
333	0.29
334	0.29
335	0.31
336	0.38
337	0.35
338	0.39
339	0.37
340	0.4
341	0.41
342	0.38
343	0.35
344	0.28
345	0.23
346	0.16
347	0.16
348	0.1
349	0.07
350	0.07
351	0.09
352	0.08
353	0.14
354	0.2
355	0.21
356	0.24
357	0.25
358	0.31
359	0.33
360	0.4
361	0.39
362	0.34
363	0.34
364	0.35
365	0.34
366	0.28
367	0.27
368	0.21
369	0.16
370	0.18
371	0.17
372	0.15
373	0.18
374	0.18
375	0.18
376	0.2
377	0.2
378	0.18
379	0.18
380	0.17
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.09
398	0.12
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.18
403	0.17
404	0.15
405	0.14
406	0.12
407	0.09
408	0.08
409	0.07
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.06
414	0.05
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.11
424	0.13
425	0.14
426	0.13
427	0.14
428	0.13
429	0.13
430	0.13
431	0.08
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.08
454	0.09
455	0.08
456	0.09
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.07
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.09
472	0.11
473	0.19
474	0.23
475	0.25
476	0.34
477	0.38
478	0.41
479	0.48
480	0.56
481	0.58
482	0.62
483	0.63
484	0.58
485	0.59
486	0.56
487	0.56
488	0.54
489	0.5
490	0.45
491	0.46
492	0.47
493	0.49
494	0.58
495	0.59
496	0.62
497	0.67
498	0.69
499	0.7
500	0.68
501	0.62
502	0.57
503	0.47
504	0.39
505	0.34
506	0.27
507	0.25
508	0.25
509	0.24
510	0.18
511	0.17
512	0.15
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.1
517	0.11
518	0.13
519	0.19
520	0.26
521	0.32
522	0.32
523	0.33
524	0.36
525	0.4
526	0.41
527	0.42
528	0.38
529	0.35
530	0.36
531	0.34
532	0.3
533	0.24
534	0.21
535	0.15
536	0.1
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.1
546	0.11
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.11
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.16
557	0.16
558	0.15
559	0.16
560	0.15
561	0.11
562	0.1
563	0.1
564	0.08
565	0.08
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.1
573	0.09
574	0.07
575	0.06
576	0.07
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.1
585	0.08
586	0.1
587	0.11
588	0.12
589	0.12
590	0.11
591	0.12
592	0.12
593	0.14
594	0.13
595	0.12
596	0.12
597	0.12
598	0.12
599	0.12
600	0.12
601	0.1
602	0.08
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.07
622	0.09
623	0.13
624	0.17
625	0.21
626	0.29
627	0.31
628	0.31
629	0.35
630	0.33
631	0.31
632	0.3
633	0.28
634	0.22
635	0.2
636	0.21
637	0.17
638	0.17
639	0.16
640	0.13
641	0.1
642	0.09
643	0.11
644	0.11
645	0.12
646	0.12
647	0.16
648	0.17
649	0.18
650	0.17
651	0.15
652	0.16
653	0.17
654	0.18
655	0.14
656	0.14
657	0.16
658	0.19
659	0.21
660	0.22
661	0.27
662	0.25
663	0.29
664	0.31
665	0.28
666	0.24
667	0.23
668	0.21
669	0.15
670	0.15
671	0.12
672	0.11
673	0.11
674	0.14
675	0.13
676	0.12
677	0.12
678	0.14
679	0.15
680	0.19
681	0.19
682	0.19
683	0.21
684	0.28
685	0.35
686	0.38
687	0.38
688	0.37
689	0.46
690	0.44
691	0.48
692	0.44
693	0.38
694	0.35
695	0.34
696	0.32
697	0.23
698	0.25
699	0.18
700	0.17
701	0.16
702	0.14
703	0.11
704	0.1
705	0.09
706	0.06
707	0.05
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.08
717	0.13
718	0.17
719	0.16
720	0.2
721	0.22
722	0.26
723	0.3
724	0.32
725	0.29
726	0.25
727	0.25
728	0.22
729	0.21
730	0.16
731	0.13
732	0.1
733	0.08
734	0.09
735	0.09
736	0.08
737	0.07
738	0.07
739	0.06
740	0.06
741	0.07
742	0.07
743	0.1
744	0.13
745	0.23
746	0.24
747	0.28
748	0.34
749	0.38
750	0.42
751	0.43
752	0.44
753	0.38
754	0.4
755	0.38
756	0.31
757	0.28
758	0.23
759	0.18
760	0.14
761	0.11
762	0.09
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.11
767	0.12
768	0.13
769	0.18
770	0.23
771	0.23
772	0.23
773	0.23
774	0.21
775	0.2
776	0.21
777	0.16
778	0.09
779	0.09
780	0.09
781	0.09
782	0.08
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.1
793	0.14
794	0.14
795	0.14
796	0.17
797	0.16
798	0.18
799	0.19
800	0.17
801	0.16
802	0.15
803	0.15
804	0.17
805	0.18
806	0.16
807	0.15
808	0.14
809	0.12
810	0.11
811	0.1
812	0.06
813	0.04
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.07
824	0.08
825	0.09
826	0.14
827	0.16
828	0.18
829	0.25
830	0.3
831	0.34
832	0.39
833	0.43
834	0.42
835	0.41
836	0.39
837	0.33
838	0.29
839	0.26
840	0.24
841	0.23
842	0.22
843	0.22
844	0.23
845	0.3
846	0.29
847	0.28
848	0.27
849	0.24
850	0.23
851	0.27
852	0.29
853	0.2
854	0.22
855	0.22
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.17
860	0.16
861	0.17
862	0.24
863	0.33
864	0.42
865	0.48
866	0.56
867	0.61
868	0.67
869	0.73
870	0.69
871	0.65
872	0.59
873	0.57
874	0.5
875	0.46
876	0.4
877	0.32
878	0.29
879	0.26
880	0.22
881	0.19
882	0.2
883	0.14
884	0.16
885	0.18
886	0.19
887	0.24
888	0.26
889	0.25
890	0.25
891	0.26
892	0.25
893	0.26
894	0.26
895	0.21
896	0.18
897	0.2
898	0.19
899	0.18
900	0.17
901	0.16
902	0.15
903	0.15
904	0.17
905	0.17
906	0.16
907	0.16
908	0.15
909	0.14
910	0.13
911	0.11
912	0.09
913	0.07
914	0.09
915	0.12
916	0.14
917	0.14
918	0.17
919	0.21
920	0.24
921	0.29
922	0.36
923	0.35
924	0.35
925	0.39
926	0.43
927	0.46
928	0.5
929	0.48
930	0.4
931	0.4
932	0.4
933	0.36
934	0.29
935	0.22
936	0.17
937	0.13
938	0.13
939	0.12
940	0.11
941	0.11
942	0.11
943	0.11
944	0.09
945	0.1
946	0.14
947	0.14
948	0.16
949	0.17
950	0.19
951	0.25
952	0.3
953	0.37
954	0.42
955	0.5
956	0.51
957	0.57
958	0.56
959	0.53
960	0.56
961	0.49
962	0.44
963	0.36
964	0.35
965	0.29
966	0.28
967	0.28
968	0.22
969	0.23
970	0.2
971	0.23
972	0.22
973	0.23
974	0.3
975	0.32
976	0.34
977	0.39
978	0.42
979	0.45
980	0.46
981	0.47
982	0.42
983	0.4
984	0.39
985	0.37
986	0.37
987	0.32
988	0.35
989	0.35
990	0.35
991	0.37
992	0.4
993	0.39
994	0.38
995	0.37
996	0.34
997	0.33
998	0.37
999	0.33
1000	0.34
1001	0.31
1002	0.29
1003	0.32
1004	0.34
1005	0.33
1006	0.33
1007	0.35
1008	0.34
1009	0.44
1010	0.49
1011	0.48
1012	0.46
1013	0.44
1014	0.4
1015	0.4
1016	0.38
1017	0.31
1018	0.35
1019	0.34
1020	0.37
1021	0.36
1022	0.37
1023	0.36
1024	0.36
1025	0.37
1026	0.28
1027	0.3
1028	0.27
1029	0.3
1030	0.29
1031	0.33
1032	0.31
1033	0.29
1034	0.28
1035	0.24
1036	0.23
1037	0.22
1038	0.21
1039	0.15
1040	0.15
1041	0.17
1042	0.19
1043	0.2
1044	0.25
1045	0.29
1046	0.38
1047	0.39
1048	0.43
1049	0.41
1050	0.45
1051	0.49
1052	0.54
1053	0.54
1054	0.53
1055	0.55
1056	0.55
1057	0.56
1058	0.55
1059	0.54
1060	0.48
1061	0.49
1062	0.5
1063	0.51
1064	0.49
1065	0.46
1066	0.42
1067	0.42
1068	0.39
1069	0.35
1070	0.31
1071	0.28
1072	0.26
1073	0.27
1074	0.28
1075	0.24
1076	0.22
1077	0.19
1078	0.15
1079	0.12
1080	0.11
1081	0.1
1082	0.11
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.13
1087	0.15
1088	0.19
1089	0.22
1090	0.25
1091	0.28
1092	0.29
1093	0.29
1094	0.3

A0A4U0Y180

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer