Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XPG5

Protein Details
Accession A0A4U0XPG5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-142RKTAVKKKTAAKKRPEPKEVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-138AAKKPASTRGPYKKKTSAEKTSTRKNPAKKGSTAKPSARKTAVKKKTAAKKRPEP
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 13, mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLHRGVFCHVKAEATRTSTSSCNVAQLLRKIHLTRHITAPTRSLHCGQIRRTGIAFLSRTYATATTAASEVKPTKTVQSAVKEAAKKPASTRGPYKKKTSAEKTSTRKNPAKKGSTAKPSARKTAVKKKTAAKKRPEPKEVLTDEQTATKQARALLKAQFMTRKQLRERAMLKGEPKVPSLSAWNVFQSEGPMKEPGKDSNPRTLMGERAKTGAEQYKNLTPAEREHYNHLANERKAAMEAEYKTWVESHTPDRIRIANNARRHILRLRAAMSAEAKGLSHTRIIKDERQLKRPISAFTLFHIERFASNDFKGIPHVADAARLSAEEWKALSEGEKKKYHDAAAANLEHYQQEYKALYGHEAPSRLRKPSAPAVATAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.32
4 0.34
5 0.32
6 0.32
7 0.31
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.26
12 0.3
13 0.34
14 0.37
15 0.35
16 0.4
17 0.38
18 0.41
19 0.46
20 0.46
21 0.43
22 0.46
23 0.51
24 0.5
25 0.51
26 0.51
27 0.48
28 0.46
29 0.47
30 0.41
31 0.41
32 0.44
33 0.49
34 0.48
35 0.52
36 0.5
37 0.49
38 0.47
39 0.42
40 0.36
41 0.35
42 0.33
43 0.24
44 0.25
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.22
62 0.24
63 0.28
64 0.3
65 0.33
66 0.35
67 0.38
68 0.43
69 0.43
70 0.41
71 0.47
72 0.43
73 0.38
74 0.37
75 0.42
76 0.42
77 0.43
78 0.52
79 0.54
80 0.62
81 0.66
82 0.71
83 0.7
84 0.71
85 0.75
86 0.75
87 0.74
88 0.72
89 0.76
90 0.75
91 0.77
92 0.78
93 0.77
94 0.75
95 0.73
96 0.74
97 0.74
98 0.74
99 0.71
100 0.71
101 0.7
102 0.72
103 0.72
104 0.7
105 0.69
106 0.67
107 0.66
108 0.64
109 0.62
110 0.62
111 0.66
112 0.67
113 0.63
114 0.65
115 0.67
116 0.72
117 0.75
118 0.76
119 0.75
120 0.76
121 0.8
122 0.83
123 0.8
124 0.75
125 0.69
126 0.69
127 0.62
128 0.57
129 0.5
130 0.42
131 0.37
132 0.34
133 0.3
134 0.23
135 0.2
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.19
140 0.19
141 0.22
142 0.23
143 0.26
144 0.26
145 0.27
146 0.29
147 0.26
148 0.33
149 0.34
150 0.36
151 0.36
152 0.42
153 0.43
154 0.45
155 0.47
156 0.44
157 0.45
158 0.41
159 0.4
160 0.38
161 0.39
162 0.32
163 0.31
164 0.26
165 0.21
166 0.19
167 0.2
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.21
185 0.27
186 0.28
187 0.34
188 0.35
189 0.33
190 0.34
191 0.33
192 0.33
193 0.31
194 0.31
195 0.23
196 0.23
197 0.23
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.19
202 0.18
203 0.21
204 0.23
205 0.25
206 0.25
207 0.23
208 0.18
209 0.2
210 0.24
211 0.25
212 0.23
213 0.26
214 0.31
215 0.31
216 0.31
217 0.32
218 0.34
219 0.3
220 0.31
221 0.27
222 0.22
223 0.21
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.13
235 0.15
236 0.17
237 0.23
238 0.25
239 0.26
240 0.28
241 0.31
242 0.31
243 0.35
244 0.41
245 0.39
246 0.44
247 0.47
248 0.48
249 0.45
250 0.47
251 0.45
252 0.43
253 0.41
254 0.38
255 0.37
256 0.35
257 0.35
258 0.33
259 0.3
260 0.23
261 0.18
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.14
268 0.16
269 0.18
270 0.24
271 0.28
272 0.33
273 0.4
274 0.49
275 0.51
276 0.55
277 0.59
278 0.55
279 0.57
280 0.55
281 0.48
282 0.44
283 0.42
284 0.36
285 0.32
286 0.39
287 0.32
288 0.29
289 0.28
290 0.22
291 0.19
292 0.22
293 0.23
294 0.18
295 0.18
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.21
300 0.19
301 0.16
302 0.14
303 0.17
304 0.15
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.21
320 0.28
321 0.35
322 0.41
323 0.43
324 0.5
325 0.54
326 0.52
327 0.49
328 0.45
329 0.43
330 0.45
331 0.44
332 0.38
333 0.34
334 0.33
335 0.27
336 0.26
337 0.21
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.19
343 0.19
344 0.21
345 0.23
346 0.27
347 0.27
348 0.29
349 0.31
350 0.39
351 0.43
352 0.44
353 0.44
354 0.43
355 0.46
356 0.52
357 0.59
358 0.5