Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WMZ1

Protein Details
Accession A0A4U0WMZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
600-619APAPAHPASRRQRRPHGVATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
771-778SGARKRRA
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 6.5, cyto_nucl 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MSNLTASSSQAAKNPPHHPLAAQNASTPTTSSAHLSAAAFSSPAPRGLPSPAAHRAQAGKSPFAHGGPTSSAMARVGGSAAGLAGSSMGVAGSSPAAGMLDFASEAGLGMSLGGLGALEEGVGMGISMSGMGMSGLGFVAGSLGGRDSEDERRRKLEGVLATLRKRPGRVSEEAVERLAKSYGLDCAYDSDHGVGPLMIAGETVVVEVDIKPGMPRNVSLSFPLASQALEAHAESAARILQDDLTPPPGSTSIETKLDAFAKNLEILAKLDKLSPTRDINCYEAIAGIYTSLRRLFEHEKKAAMALMDASRGNVEERAEREVMCKKSGRPRMHAGKRIGLAVEYWMDCRHITTSKPGSDRPPASRSGRAMDVDEGRPKASDDGSKIFSVRIECETSPAQLYPSFRVSDSWISSRIEKPVSESTDANDLFSTAPLLDWLEPPQTYIASDTAGQADALALDPALGKLPDVRFVAKLEPPLVVPLQTAMALLESVGVAIAQESVRATTYEGLLLRPESQRAPYPSAAASDIGSDRLVWAVDADGQARPRRHVGSLFGPEVEYGRVLDEIPFTHPRQLVRILPVLRQFACLGELLRKSFAPAPAPAPAHPASRRQRRPHGVATASSNDSTTPPRPTPPLGLADLLRPGSTRPKDGTATSTVNTNTVANTDNNNNVALDVTLSTSPLPALDLTFSLPALAPASATLHIRPNADVAVAAATFVARGAGDGDDDGAGVGMTGAHDNEPELRTLARALDVAADLDVWVEWVGRRHASGSGARKRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.48
4 0.47
5 0.44
6 0.47
7 0.5
8 0.49
9 0.44
10 0.41
11 0.4
12 0.4
13 0.38
14 0.31
15 0.25
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.18
20 0.17
21 0.2
22 0.19
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.16
29 0.14
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.18
34 0.22
35 0.28
36 0.25
37 0.31
38 0.37
39 0.38
40 0.38
41 0.39
42 0.41
43 0.38
44 0.42
45 0.39
46 0.36
47 0.34
48 0.38
49 0.37
50 0.32
51 0.31
52 0.25
53 0.25
54 0.22
55 0.24
56 0.21
57 0.19
58 0.2
59 0.17
60 0.18
61 0.14
62 0.12
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.09
135 0.19
136 0.28
137 0.33
138 0.36
139 0.4
140 0.41
141 0.42
142 0.41
143 0.38
144 0.34
145 0.35
146 0.4
147 0.43
148 0.44
149 0.46
150 0.49
151 0.45
152 0.43
153 0.39
154 0.4
155 0.4
156 0.42
157 0.44
158 0.45
159 0.48
160 0.48
161 0.45
162 0.38
163 0.31
164 0.28
165 0.22
166 0.16
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.1
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.17
204 0.2
205 0.21
206 0.22
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.18
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.18
242 0.17
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.21
262 0.23
263 0.25
264 0.28
265 0.29
266 0.29
267 0.28
268 0.26
269 0.21
270 0.17
271 0.14
272 0.11
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.13
282 0.21
283 0.29
284 0.37
285 0.38
286 0.38
287 0.37
288 0.37
289 0.33
290 0.25
291 0.17
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.18
308 0.24
309 0.25
310 0.25
311 0.26
312 0.26
313 0.35
314 0.44
315 0.46
316 0.44
317 0.51
318 0.59
319 0.65
320 0.69
321 0.63
322 0.58
323 0.54
324 0.5
325 0.41
326 0.3
327 0.22
328 0.15
329 0.13
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.18
340 0.23
341 0.27
342 0.29
343 0.3
344 0.32
345 0.38
346 0.41
347 0.38
348 0.36
349 0.36
350 0.37
351 0.38
352 0.36
353 0.32
354 0.3
355 0.26
356 0.24
357 0.22
358 0.21
359 0.2
360 0.21
361 0.19
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.15
370 0.17
371 0.17
372 0.17
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.15
393 0.16
394 0.18
395 0.19
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.2
400 0.21
401 0.21
402 0.19
403 0.17
404 0.19
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.23
409 0.21
410 0.27
411 0.27
412 0.23
413 0.17
414 0.15
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.07
452 0.08
453 0.12
454 0.13
455 0.15
456 0.15
457 0.17
458 0.2
459 0.18
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.15
465 0.14
466 0.11
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.04
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.13
502 0.15
503 0.21
504 0.24
505 0.28
506 0.26
507 0.27
508 0.26
509 0.26
510 0.24
511 0.19
512 0.15
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.13
529 0.18
530 0.19
531 0.21
532 0.23
533 0.25
534 0.26
535 0.27
536 0.28
537 0.31
538 0.35
539 0.34
540 0.3
541 0.28
542 0.26
543 0.24
544 0.2
545 0.13
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.13
554 0.18
555 0.18
556 0.23
557 0.25
558 0.25
559 0.28
560 0.31
561 0.3
562 0.3
563 0.35
564 0.32
565 0.33
566 0.37
567 0.37
568 0.33
569 0.31
570 0.27
571 0.21
572 0.21
573 0.18
574 0.14
575 0.16
576 0.18
577 0.17
578 0.19
579 0.18
580 0.2
581 0.23
582 0.25
583 0.22
584 0.22
585 0.23
586 0.27
587 0.29
588 0.27
589 0.29
590 0.27
591 0.3
592 0.3
593 0.38
594 0.42
595 0.51
596 0.61
597 0.64
598 0.72
599 0.75
600 0.8
601 0.78
602 0.77
603 0.7
604 0.63
605 0.6
606 0.54
607 0.47
608 0.4
609 0.32
610 0.24
611 0.22
612 0.24
613 0.23
614 0.24
615 0.24
616 0.28
617 0.31
618 0.34
619 0.37
620 0.36
621 0.37
622 0.32
623 0.33
624 0.3
625 0.28
626 0.28
627 0.23
628 0.19
629 0.15
630 0.15
631 0.23
632 0.25
633 0.28
634 0.28
635 0.32
636 0.35
637 0.37
638 0.39
639 0.35
640 0.36
641 0.32
642 0.33
643 0.28
644 0.26
645 0.26
646 0.21
647 0.16
648 0.14
649 0.16
650 0.13
651 0.16
652 0.19
653 0.21
654 0.21
655 0.22
656 0.2
657 0.18
658 0.17
659 0.13
660 0.11
661 0.08
662 0.09
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.1
681 0.09
682 0.07
683 0.07
684 0.1
685 0.11
686 0.12
687 0.14
688 0.19
689 0.22
690 0.23
691 0.23
692 0.23
693 0.22
694 0.2
695 0.18
696 0.12
697 0.12
698 0.1
699 0.1
700 0.08
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.03
706 0.04
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.07
711 0.08
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.05
716 0.05
717 0.04
718 0.04
719 0.03
720 0.04
721 0.05
722 0.06
723 0.06
724 0.07
725 0.08
726 0.13
727 0.13
728 0.14
729 0.15
730 0.14
731 0.15
732 0.17
733 0.17
734 0.14
735 0.13
736 0.12
737 0.13
738 0.14
739 0.13
740 0.12
741 0.1
742 0.08
743 0.08
744 0.08
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.08
749 0.12
750 0.16
751 0.17
752 0.18
753 0.19
754 0.22
755 0.26
756 0.33
757 0.39
758 0.46