Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WED9

Protein Details
Accession A0A4U0WED9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-418TKQGVEKKGPKVRSRRSQRGKEGSRAKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-418VEKKGPKVRSRRSQRGKEGSRAKV
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032854  ALKBH3  
IPR000868  Isochorismatase-like  
IPR036380  Isochorismatase-like_sf  
Gene Ontology GO:0051213  F:dioxygenase activity  
GO:0006307  P:DNA dealkylation involved in DNA repair  
GO:0035552  P:oxidative single-stranded DNA demethylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00857  Isochorismatase  
CDD cd00431  cysteine_hydrolases  
Amino Acid Sequences MSSLLDVLTQIQPQFKTRQALLILGLQNDFVAPTGKLPVGTGLGFLDRIKTIIPRFRETGDIIWVRTVYEADRLVNITNDDGEAVILGARDTQDHQPTENIVESEDEVVHEATPPGPSPSRPEPYPTSKRALELLKRASGRNRAKGQQRSSSSTEEEELFLTSTAEREPCCLRGSYGADFAEEIKPWINGPKDIEIVKSHYSAFNTTSLLTMLRMKLITEVYICGCLTNMSVYATATDAARHGLTINILEDCLGYRQKARHEDAVKQMIELMGAYTLSSTQLLETLAEEAGTTSAGVEGGLEHTSALTPQLHNLKLSGGQLPRAAILENGAMKRRSESMDHGPGSQNSGIVQRPRIELQSEAAQSIGKGTTSREPEESMRGELRPDLHPATKQGVEKKGPKVRSRRSQRGKEGSRAKVVDSAKKEDHIPKGSHAGATETTAPPNGLIQSSSASEDTQPPGTLGADSAETPNSSTKTDPRPNSQQSNKLQLQFTPWRPQAIHHRHTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.37
4 0.36
5 0.41
6 0.38
7 0.38
8 0.36
9 0.38
10 0.35
11 0.3
12 0.29
13 0.22
14 0.2
15 0.18
16 0.16
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.09
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.16
38 0.22
39 0.28
40 0.33
41 0.36
42 0.39
43 0.4
44 0.43
45 0.41
46 0.37
47 0.38
48 0.35
49 0.3
50 0.29
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.12
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.17
60 0.18
61 0.18
62 0.19
63 0.18
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.07
78 0.1
79 0.16
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.24
84 0.26
85 0.28
86 0.27
87 0.21
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.21
106 0.28
107 0.33
108 0.33
109 0.38
110 0.41
111 0.49
112 0.57
113 0.54
114 0.52
115 0.48
116 0.49
117 0.48
118 0.49
119 0.45
120 0.45
121 0.45
122 0.45
123 0.46
124 0.47
125 0.48
126 0.5
127 0.52
128 0.53
129 0.54
130 0.56
131 0.63
132 0.7
133 0.7
134 0.69
135 0.66
136 0.63
137 0.61
138 0.58
139 0.5
140 0.43
141 0.38
142 0.29
143 0.25
144 0.19
145 0.16
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.12
156 0.14
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.19
161 0.22
162 0.21
163 0.23
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.17
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.17
178 0.19
179 0.2
180 0.21
181 0.22
182 0.19
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.09
243 0.12
244 0.17
245 0.23
246 0.26
247 0.32
248 0.34
249 0.38
250 0.42
251 0.46
252 0.4
253 0.34
254 0.31
255 0.24
256 0.21
257 0.16
258 0.1
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.1
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.15
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.13
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.12
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.23
325 0.28
326 0.35
327 0.36
328 0.36
329 0.36
330 0.34
331 0.35
332 0.3
333 0.22
334 0.14
335 0.16
336 0.18
337 0.18
338 0.21
339 0.19
340 0.22
341 0.23
342 0.24
343 0.23
344 0.21
345 0.21
346 0.24
347 0.23
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.15
352 0.16
353 0.13
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.16
358 0.2
359 0.22
360 0.22
361 0.25
362 0.26
363 0.31
364 0.31
365 0.28
366 0.26
367 0.24
368 0.24
369 0.23
370 0.24
371 0.2
372 0.23
373 0.23
374 0.23
375 0.25
376 0.27
377 0.29
378 0.31
379 0.33
380 0.36
381 0.4
382 0.44
383 0.49
384 0.56
385 0.59
386 0.62
387 0.66
388 0.7
389 0.73
390 0.77
391 0.81
392 0.83
393 0.85
394 0.88
395 0.9
396 0.91
397 0.87
398 0.86
399 0.85
400 0.8
401 0.77
402 0.67
403 0.58
404 0.54
405 0.52
406 0.5
407 0.45
408 0.46
409 0.4
410 0.41
411 0.45
412 0.45
413 0.49
414 0.48
415 0.45
416 0.41
417 0.46
418 0.45
419 0.41
420 0.35
421 0.3
422 0.24
423 0.25
424 0.25
425 0.2
426 0.2
427 0.19
428 0.19
429 0.16
430 0.17
431 0.16
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.13
436 0.14
437 0.16
438 0.15
439 0.14
440 0.15
441 0.19
442 0.21
443 0.21
444 0.2
445 0.18
446 0.19
447 0.19
448 0.17
449 0.13
450 0.11
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.17
458 0.18
459 0.19
460 0.21
461 0.27
462 0.37
463 0.46
464 0.51
465 0.55
466 0.64
467 0.71
468 0.78
469 0.79
470 0.78
471 0.75
472 0.79
473 0.77
474 0.72
475 0.65
476 0.56
477 0.57
478 0.57
479 0.56
480 0.56
481 0.53
482 0.52
483 0.51
484 0.56
485 0.59
486 0.6