Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X996

Protein Details
Accession A0A4U0X996    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-172STSKDLLRVRNNTRKRRKPDVAKDDPINHydrophilic
398-421YYYPVRHRTFIRPKRAGRPRLGMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-161KRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MATSGARPERVYHQDYIARIRYSNALPPPPNPPKLLDIPNTGLASGQYTSAGFASRLAREQPLNIEADAELGMPIDLIGLPGIFDGDESALQGPAVPPPIHPHDKALLRPLATLGKPASVTSGVSFLRRTEYISSGADRMRFESSTSKDLLRVRNNTRKRRKPDVAKDDPINIARSIVKGFDLAYPQDAYTGPDSNQNLLGAEVSPAEKDAWTHPRHPTKPDLKLLDSYPVLPHVESLPAIGNYNVIKYITNPVAASSTYDSRLDVAVLRPLDLRLDQIQHYEDATQAHEEDPTKPVPSAMFDYELFLPESEESVAGIKRVLDVNDPEKEDAGLYDSELKYTKDQGAFCYRKVRTYETYQQVADSEEGYGDTVALALHDAEIDNHAIQAGHRLQKGAYYYPVRHRTFIRPKRAGRPRLGMDQNQMTDEQLDELRLLIKEPEGEELEKRATNAALLEGQAVVEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.46
3 0.51
4 0.49
5 0.43
6 0.39
7 0.38
8 0.37
9 0.35
10 0.4
11 0.39
12 0.41
13 0.42
14 0.44
15 0.52
16 0.55
17 0.57
18 0.51
19 0.48
20 0.45
21 0.5
22 0.55
23 0.49
24 0.47
25 0.47
26 0.5
27 0.46
28 0.4
29 0.33
30 0.26
31 0.23
32 0.18
33 0.14
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.09
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.19
44 0.21
45 0.24
46 0.24
47 0.26
48 0.27
49 0.26
50 0.26
51 0.23
52 0.22
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.11
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.18
86 0.26
87 0.3
88 0.31
89 0.32
90 0.35
91 0.39
92 0.41
93 0.42
94 0.38
95 0.34
96 0.33
97 0.32
98 0.3
99 0.26
100 0.27
101 0.21
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.14
107 0.14
108 0.12
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.17
118 0.19
119 0.2
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.23
124 0.23
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.23
131 0.25
132 0.26
133 0.27
134 0.25
135 0.27
136 0.32
137 0.38
138 0.38
139 0.43
140 0.48
141 0.57
142 0.66
143 0.72
144 0.78
145 0.81
146 0.81
147 0.84
148 0.85
149 0.86
150 0.87
151 0.87
152 0.85
153 0.81
154 0.75
155 0.67
156 0.6
157 0.5
158 0.41
159 0.31
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.14
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.1
198 0.18
199 0.2
200 0.24
201 0.31
202 0.4
203 0.42
204 0.45
205 0.5
206 0.5
207 0.54
208 0.56
209 0.52
210 0.45
211 0.45
212 0.42
213 0.37
214 0.29
215 0.23
216 0.17
217 0.15
218 0.14
219 0.11
220 0.11
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.12
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.18
291 0.17
292 0.18
293 0.16
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.16
311 0.2
312 0.23
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.22
317 0.19
318 0.15
319 0.13
320 0.09
321 0.08
322 0.15
323 0.14
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.17
328 0.21
329 0.25
330 0.23
331 0.23
332 0.27
333 0.37
334 0.38
335 0.39
336 0.45
337 0.41
338 0.42
339 0.45
340 0.46
341 0.41
342 0.47
343 0.55
344 0.52
345 0.55
346 0.49
347 0.46
348 0.41
349 0.37
350 0.29
351 0.19
352 0.13
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.15
376 0.2
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.29
382 0.33
383 0.28
384 0.3
385 0.3
386 0.35
387 0.44
388 0.54
389 0.53
390 0.53
391 0.54
392 0.58
393 0.63
394 0.68
395 0.69
396 0.68
397 0.73
398 0.8
399 0.86
400 0.84
401 0.8
402 0.8
403 0.75
404 0.75
405 0.76
406 0.69
407 0.66
408 0.65
409 0.58
410 0.5
411 0.45
412 0.35
413 0.29
414 0.25
415 0.2
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.12
424 0.13
425 0.15
426 0.16
427 0.2
428 0.21
429 0.23
430 0.23
431 0.26
432 0.29
433 0.27
434 0.27
435 0.24
436 0.21
437 0.21
438 0.2
439 0.18
440 0.16
441 0.15
442 0.15
443 0.13