FuNGI

A0A4U0X171

Protein Details

Accession

A0A4U0X171

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-99	SEELSKSRRKLNGKGKHSKSRSEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
82-95	SRRKLNGKGKHSKS

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus

Amino Acid Sequences

MPKVLSYTPSWLSRPSPGFDLFQPPPKSKSPSLANGSKKDKHTGPCRTIARRGTEVFVLAGNEIRWSDLVLLKDTSEELSKSRRKLNGKGKHSKSRSEGEDPVEDEGSADSAYRTLKVPVAGQIRQLVVSPRGEYLAILTTHTAHVAVLPDSSHLSVRDTGPIRVKTFQLGPTAHVLEQAPLASALWHPLGHNGTCLITVTTDATVRMWELNRENRHSFDEPALAVDLKKLANATSANEDFGASKYGTNKGFSPDSFEMEVAAACFGGLGLEDEHGWAPMTLWIAMKEGDVYALCPLLPSKWQPPSSLIPSLSTAVVAKAAAIGSASAALEEERRVSEQQYKWFTEIDNQEPLLAPGDTEFDSVEVYVRPSHPGPIPKLQGPFQLQLELDLDDDLEITDVLAIGAKLDDDELMLGEDSASDTDGEGLSVGVICLLTNTGKVHICLDLDGVEGQWLPARNSRAWYSSELIPPSLLVFETISLSPATESETSWPTFSPDPLSRYALFVTHDTGVFALSLTPWIRRLEDELTADVDAGAAFRLDLFVSSAKSLVDNPIKLSREQNAPQTHPSSVSSCIALFDSDLGYFLLTVAASQPYAAILDAPSAYVEVEPPPPRHHDQALIQHEPRTPYQPSYAFYAPSALPTFINTKTAPRHRRALNDEIRLSPHTLALMTDAHRLLSAETHALGVAAADLFRRCERLQDEFRDQIRRAADVAARIDAVTGDDEEADGGRGADGEGVVGSARVMQRIDGVRARQAELAERHERLRRRLARIAGRPLSAEEKGWAAEVHALAAAVPPAPASSLPPPNDGDDIVEDAAQVQAQDGEDATPPYARYEAVIALKSSLVAQTESVAAQDTEDGNGERGGGGADFAAEVNGSRNGRVRVPPGFRKQRVAAVMQLLERETALVDATAERLRRLSMLGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.4
4	0.38
5	0.39
6	0.38
7	0.44
8	0.39
9	0.45
10	0.47
11	0.45
12	0.48
13	0.51
14	0.55
15	0.51
16	0.55
17	0.54
18	0.58
19	0.63
20	0.66
21	0.68
22	0.7
23	0.74
24	0.73
25	0.68
26	0.66
27	0.65
28	0.65
29	0.67
30	0.69
31	0.67
32	0.69
33	0.74
34	0.74
35	0.76
36	0.73
37	0.7
38	0.66
39	0.62
40	0.55
41	0.48
42	0.43
43	0.34
44	0.29
45	0.23
46	0.17
47	0.16
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.1
53	0.11
54	0.13
55	0.15
56	0.17
57	0.18
58	0.19
59	0.18
60	0.19
61	0.18
62	0.17
63	0.16
64	0.15
65	0.16
66	0.25
67	0.31
68	0.35
69	0.42
70	0.49
71	0.53
72	0.63
73	0.7
74	0.71
75	0.75
76	0.81
77	0.83
78	0.85
79	0.84
80	0.81
81	0.77
82	0.75
83	0.71
84	0.67
85	0.63
86	0.57
87	0.57
88	0.5
89	0.46
90	0.38
91	0.31
92	0.24
93	0.19
94	0.15
95	0.1
96	0.09
97	0.06
98	0.08
99	0.09
100	0.1
101	0.11
102	0.12
103	0.14
104	0.16
105	0.18
106	0.23
107	0.29
108	0.29
109	0.31
110	0.32
111	0.3
112	0.29
113	0.29
114	0.25
115	0.23
116	0.24
117	0.22
118	0.19
119	0.2
120	0.19
121	0.18
122	0.16
123	0.17
124	0.15
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.14
129	0.15
130	0.13
131	0.08
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.09
136	0.09
137	0.1
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.11
142	0.13
143	0.16
144	0.17
145	0.24
146	0.24
147	0.28
148	0.34
149	0.38
150	0.38
151	0.38
152	0.38
153	0.34
154	0.36
155	0.35
156	0.34
157	0.3
158	0.29
159	0.32
160	0.33
161	0.29
162	0.27
163	0.24
164	0.18
165	0.18
166	0.16
167	0.12
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.13
177	0.17
178	0.16
179	0.17
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.11
185	0.08
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.12
195	0.12
196	0.16
197	0.22
198	0.3
199	0.36
200	0.42
201	0.43
202	0.43
203	0.48
204	0.46
205	0.42
206	0.35
207	0.32
208	0.26
209	0.25
210	0.23
211	0.17
212	0.15
213	0.13
214	0.13
215	0.1
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.12
220	0.13
221	0.14
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.19
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.1
231	0.11
232	0.13
233	0.18
234	0.2
235	0.2
236	0.21
237	0.23
238	0.25
239	0.24
240	0.3
241	0.26
242	0.28
243	0.28
244	0.26
245	0.22
246	0.19
247	0.19
248	0.11
249	0.09
250	0.06
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.09
286	0.12
287	0.18
288	0.25
289	0.27
290	0.28
291	0.33
292	0.37
293	0.4
294	0.41
295	0.35
296	0.29
297	0.29
298	0.28
299	0.24
300	0.18
301	0.14
302	0.09
303	0.09
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.08
322	0.09
323	0.11
324	0.2
325	0.22
326	0.3
327	0.35
328	0.36
329	0.35
330	0.35
331	0.33
332	0.32
333	0.32
334	0.28
335	0.25
336	0.23
337	0.23
338	0.22
339	0.22
340	0.17
341	0.12
342	0.09
343	0.06
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.1
357	0.11
358	0.14
359	0.17
360	0.21
361	0.25
362	0.3
363	0.32
364	0.33
365	0.35
366	0.33
367	0.36
368	0.34
369	0.32
370	0.26
371	0.25
372	0.22
373	0.2
374	0.2
375	0.15
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.06
380	0.06
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.02
418	0.02
419	0.02
420	0.02
421	0.03
422	0.03
423	0.04
424	0.05
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.06
442	0.07
443	0.1
444	0.13
445	0.13
446	0.16
447	0.18
448	0.18
449	0.2
450	0.21
451	0.21
452	0.22
453	0.24
454	0.22
455	0.2
456	0.18
457	0.16
458	0.13
459	0.1
460	0.07
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.09
475	0.11
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.15
483	0.16
484	0.18
485	0.2
486	0.23
487	0.21
488	0.22
489	0.21
490	0.17
491	0.16
492	0.14
493	0.13
494	0.11
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.04
502	0.03
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.09
507	0.1
508	0.11
509	0.11
510	0.14
511	0.15
512	0.17
513	0.18
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.11
519	0.09
520	0.06
521	0.05
522	0.04
523	0.03
524	0.02
525	0.02
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.04
530	0.05
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.13
538	0.15
539	0.15
540	0.18
541	0.23
542	0.25
543	0.25
544	0.27
545	0.25
546	0.29
547	0.3
548	0.36
549	0.34
550	0.36
551	0.38
552	0.38
553	0.35
554	0.3
555	0.29
556	0.23
557	0.21
558	0.19
559	0.16
560	0.14
561	0.14
562	0.12
563	0.11
564	0.09
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.06
595	0.12
596	0.15
597	0.17
598	0.2
599	0.25
600	0.29
601	0.32
602	0.32
603	0.31
604	0.34
605	0.42
606	0.46
607	0.45
608	0.43
609	0.42
610	0.43
611	0.41
612	0.36
613	0.32
614	0.27
615	0.24
616	0.28
617	0.28
618	0.27
619	0.31
620	0.3
621	0.26
622	0.24
623	0.25
624	0.19
625	0.19
626	0.19
627	0.14
628	0.13
629	0.14
630	0.17
631	0.15
632	0.18
633	0.16
634	0.19
635	0.27
636	0.37
637	0.43
638	0.44
639	0.52
640	0.53
641	0.61
642	0.63
643	0.65
644	0.63
645	0.63
646	0.61
647	0.54
648	0.52
649	0.45
650	0.41
651	0.31
652	0.23
653	0.16
654	0.14
655	0.12
656	0.11
657	0.12
658	0.11
659	0.14
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.07
673	0.06
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.05
679	0.08
680	0.08
681	0.13
682	0.12
683	0.18
684	0.22
685	0.3
686	0.37
687	0.42
688	0.49
689	0.52
690	0.55
691	0.56
692	0.53
693	0.49
694	0.43
695	0.36
696	0.31
697	0.28
698	0.26
699	0.23
700	0.24
701	0.2
702	0.18
703	0.17
704	0.16
705	0.12
706	0.11
707	0.08
708	0.07
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.05
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.07
729	0.07
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.15
734	0.18
735	0.22
736	0.24
737	0.25
738	0.29
739	0.31
740	0.32
741	0.29
742	0.27
743	0.3
744	0.29
745	0.34
746	0.34
747	0.34
748	0.37
749	0.41
750	0.46
751	0.45
752	0.52
753	0.53
754	0.56
755	0.62
756	0.66
757	0.69
758	0.72
759	0.76
760	0.69
761	0.62
762	0.55
763	0.5
764	0.47
765	0.37
766	0.3
767	0.21
768	0.18
769	0.18
770	0.17
771	0.15
772	0.11
773	0.13
774	0.12
775	0.12
776	0.1
777	0.1
778	0.09
779	0.1
780	0.09
781	0.06
782	0.06
783	0.05
784	0.05
785	0.06
786	0.06
787	0.1
788	0.16
789	0.24
790	0.26
791	0.29
792	0.3
793	0.32
794	0.33
795	0.29
796	0.25
797	0.19
798	0.2
799	0.17
800	0.15
801	0.13
802	0.11
803	0.11
804	0.09
805	0.08
806	0.05
807	0.06
808	0.07
809	0.07
810	0.07
811	0.08
812	0.1
813	0.11
814	0.11
815	0.12
816	0.12
817	0.13
818	0.14
819	0.13
820	0.12
821	0.13
822	0.17
823	0.19
824	0.21
825	0.19
826	0.2
827	0.2
828	0.19
829	0.17
830	0.14
831	0.12
832	0.11
833	0.1
834	0.11
835	0.12
836	0.12
837	0.11
838	0.11
839	0.1
840	0.09
841	0.11
842	0.11
843	0.1
844	0.12
845	0.13
846	0.12
847	0.13
848	0.12
849	0.1
850	0.09
851	0.09
852	0.07
853	0.07
854	0.05
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.05
860	0.05
861	0.08
862	0.13
863	0.14
864	0.16
865	0.21
866	0.24
867	0.29
868	0.34
869	0.38
870	0.41
871	0.49
872	0.58
873	0.63
874	0.71
875	0.7
876	0.73
877	0.71
878	0.7
879	0.66
880	0.6
881	0.54
882	0.49
883	0.48
884	0.42
885	0.39
886	0.32
887	0.27
888	0.23
889	0.18
890	0.12
891	0.09
892	0.09
893	0.07
894	0.07
895	0.08
896	0.11
897	0.14
898	0.15
899	0.16
900	0.16
901	0.17
902	0.17

A0A4U0X171

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer