Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VNP4

Protein Details
Accession A0A4U0VNP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-329IPRTPRIKTRPLRPPRPPRYWLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-326RIKTRPLRPPRPPR
Subcellular Location(s) cysk 16, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003769  ClpS_core  
IPR014719  Ribosomal_L7/12_C/ClpS-like  
IPR039164  UBR1-like  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0071596  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF02617  ClpS  
Amino Acid Sequences MQDERMSRLTSHWYEGPDVDESEVEFALILWNDEKHTVDDVRDQVARACQQSRTFATRKAWEVNDRGRSIIKYSSSLAELLGIAKTIEEIKVTVTIRSSRDTFREQMCGTVIEWISDICGCSVGEDGQILRRIICEELLQSWRRGSKASNVDVGRNGIDDHEVEDFSGELYAMRRVGNVRRRNIVRVDVDQQQLDVDDDGDGDDEDGEEEDIDESTEENDEEDMEIDHPNSIDATEADRDGDLDMDPIDDPDDVTEVSEATLAGYPPPPPPPPHLANRRRGHDHTPVETENGDLFVAHDLTTRPLMDIPRTPRIKTRPLRPPRPPRYWLEKPKGYGFKDGTPLHENLWDRVRLDFLILYDLRMWKKLRSDLRDVYVSTVVTIPYFKRVLGLRFAGLYTTLAQLYLIADREPDHSIINLSLQMLTTPSITAEVLERGNFLTNLMAILYTFLTTRQVGYPSDVNPLATLAFDAGAVTNRRMYHFFLDLKYLFGSEYVQEKLCREDRYLLQFLDLIKLVQGICPNVRAVGEHIEYETDAWISASLITREINRFCRQYSDSFPLPENLDFSDVSMAIRRTAKTAIINSVGAESKRFSQAEIKDEIRFHSIEISEFGPGAIYNVVEFSVDRGPMSFHHPLHYLLSWLIDRAKSMSRTQLISLLQFSAIDLREQTTLPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.35
4 0.28
5 0.26
6 0.22
7 0.19
8 0.17
9 0.16
10 0.14
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.27
27 0.28
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.28
32 0.33
33 0.35
34 0.33
35 0.33
36 0.34
37 0.37
38 0.43
39 0.46
40 0.47
41 0.47
42 0.49
43 0.53
44 0.54
45 0.56
46 0.56
47 0.56
48 0.55
49 0.59
50 0.61
51 0.62
52 0.57
53 0.54
54 0.5
55 0.46
56 0.42
57 0.4
58 0.33
59 0.28
60 0.29
61 0.29
62 0.27
63 0.26
64 0.22
65 0.17
66 0.15
67 0.13
68 0.11
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.22
83 0.24
84 0.28
85 0.3
86 0.29
87 0.33
88 0.37
89 0.4
90 0.38
91 0.43
92 0.39
93 0.38
94 0.35
95 0.31
96 0.26
97 0.27
98 0.24
99 0.17
100 0.17
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.07
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.12
115 0.17
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.14
123 0.11
124 0.15
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.25
129 0.27
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.28
134 0.35
135 0.37
136 0.41
137 0.4
138 0.41
139 0.42
140 0.41
141 0.32
142 0.24
143 0.2
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.13
163 0.22
164 0.31
165 0.38
166 0.41
167 0.49
168 0.51
169 0.55
170 0.55
171 0.54
172 0.49
173 0.45
174 0.45
175 0.42
176 0.41
177 0.36
178 0.32
179 0.25
180 0.21
181 0.17
182 0.13
183 0.08
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.2
258 0.26
259 0.29
260 0.37
261 0.46
262 0.51
263 0.59
264 0.63
265 0.64
266 0.64
267 0.63
268 0.6
269 0.59
270 0.55
271 0.49
272 0.47
273 0.42
274 0.37
275 0.34
276 0.28
277 0.19
278 0.15
279 0.11
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.16
295 0.2
296 0.28
297 0.3
298 0.31
299 0.35
300 0.4
301 0.48
302 0.48
303 0.53
304 0.55
305 0.63
306 0.72
307 0.75
308 0.81
309 0.8
310 0.82
311 0.77
312 0.72
313 0.72
314 0.73
315 0.72
316 0.69
317 0.64
318 0.58
319 0.61
320 0.62
321 0.54
322 0.5
323 0.42
324 0.37
325 0.4
326 0.38
327 0.34
328 0.31
329 0.3
330 0.24
331 0.27
332 0.25
333 0.19
334 0.22
335 0.19
336 0.16
337 0.16
338 0.16
339 0.12
340 0.12
341 0.1
342 0.07
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.14
348 0.14
349 0.17
350 0.18
351 0.16
352 0.2
353 0.27
354 0.33
355 0.35
356 0.42
357 0.42
358 0.44
359 0.44
360 0.4
361 0.36
362 0.3
363 0.24
364 0.17
365 0.15
366 0.11
367 0.09
368 0.1
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.12
374 0.15
375 0.16
376 0.19
377 0.2
378 0.16
379 0.16
380 0.16
381 0.14
382 0.12
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.09
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.08
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.07
438 0.07
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.12
443 0.15
444 0.18
445 0.17
446 0.21
447 0.2
448 0.18
449 0.16
450 0.16
451 0.13
452 0.1
453 0.09
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.13
463 0.14
464 0.16
465 0.18
466 0.2
467 0.2
468 0.25
469 0.27
470 0.24
471 0.29
472 0.27
473 0.27
474 0.24
475 0.21
476 0.15
477 0.13
478 0.13
479 0.09
480 0.12
481 0.12
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.22
486 0.26
487 0.26
488 0.26
489 0.3
490 0.33
491 0.39
492 0.42
493 0.36
494 0.32
495 0.32
496 0.3
497 0.26
498 0.22
499 0.14
500 0.1
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.15
509 0.14
510 0.14
511 0.13
512 0.14
513 0.17
514 0.17
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.14
521 0.08
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.15
532 0.19
533 0.23
534 0.27
535 0.31
536 0.33
537 0.33
538 0.39
539 0.39
540 0.39
541 0.42
542 0.43
543 0.41
544 0.41
545 0.41
546 0.38
547 0.37
548 0.32
549 0.27
550 0.21
551 0.2
552 0.17
553 0.17
554 0.16
555 0.13
556 0.13
557 0.16
558 0.15
559 0.17
560 0.2
561 0.2
562 0.21
563 0.22
564 0.26
565 0.27
566 0.3
567 0.31
568 0.3
569 0.3
570 0.27
571 0.28
572 0.27
573 0.22
574 0.2
575 0.17
576 0.17
577 0.23
578 0.23
579 0.22
580 0.28
581 0.32
582 0.36
583 0.4
584 0.4
585 0.38
586 0.39
587 0.39
588 0.35
589 0.3
590 0.25
591 0.25
592 0.23
593 0.2
594 0.22
595 0.2
596 0.17
597 0.17
598 0.16
599 0.1
600 0.09
601 0.1
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.09
610 0.12
611 0.12
612 0.13
613 0.13
614 0.14
615 0.15
616 0.23
617 0.27
618 0.24
619 0.28
620 0.29
621 0.31
622 0.34
623 0.33
624 0.28
625 0.21
626 0.24
627 0.2
628 0.2
629 0.22
630 0.18
631 0.19
632 0.21
633 0.27
634 0.27
635 0.3
636 0.37
637 0.37
638 0.39
639 0.4
640 0.43
641 0.38
642 0.37
643 0.35
644 0.28
645 0.24
646 0.21
647 0.2
648 0.18
649 0.17
650 0.16
651 0.15
652 0.16
653 0.17
654 0.17