Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XCF0

Protein Details
Accession A0A4U0XCF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-524MVVGPPSKKNAKKSQRKKLKKTEASAGSRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
500-516PSKKNAKKSQRKKLKKT
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, pero 3, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MEVDKTSFQPLLLDILTAISEAHFVSFDLELSGVASKKQNGTGKPTLQERYEEVKEAAERYQILQIGLTCVHEDEEHGGYVARPYNFNINPVVEERLDIERIFSFQSGAVEFLLGCGFRMDIPFTRGVPYLSRDEAKQAKKLASDRLEKSTIPDIQLAPEDSQSIEFMRRVRSEIDAWKSTRKPFREFLNIGPADQEFVHDPVQRGELSRFEKRLVHQLVRAEYPDLVSVSKRAFMQIVPFNQEREDAIKEQRMKEVKERIHRQTGFRWLVEAMSGSDLPHVDPRSFARNPVTGEAIFCDLEEISTRLSRATELLKRKRTVLVGHNLFTDLIYFYRTFIGELPATIEEHQRNVHALFPTVIDTKYMATHNCGDINPASSLEQIADQLNMRTVPAIEVHPDHPKYLEGSAFHEAGYDSFLTAKIAVRLSTKLEAAGSYVGECRKEQLTLSEDEQGYDTAPEDVSGGVAVNGKTRDATAQESGGVSLSSAVSDLKEMVVGPPSKKNAKKSQRKKLKKTEASAGSRFAKPTIFDQLRNLTPSDLEVDDSDLADPTAPSPVITGTDGPDGLAVALESSATWQHRAGPTLHASAAAKATTLDASPDEWAVVKKERGGGEEEMMPPFGTDFWRVYGNKLRGFGTKEGLCDLTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.09
19 0.12
20 0.1
21 0.12
22 0.16
23 0.19
24 0.22
25 0.29
26 0.35
27 0.36
28 0.45
29 0.51
30 0.53
31 0.56
32 0.6
33 0.57
34 0.52
35 0.52
36 0.48
37 0.48
38 0.44
39 0.42
40 0.35
41 0.35
42 0.35
43 0.34
44 0.3
45 0.25
46 0.23
47 0.22
48 0.26
49 0.23
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.16
68 0.2
69 0.17
70 0.17
71 0.19
72 0.28
73 0.28
74 0.3
75 0.3
76 0.26
77 0.27
78 0.28
79 0.29
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.18
86 0.18
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.11
108 0.12
109 0.16
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.23
121 0.3
122 0.37
123 0.38
124 0.4
125 0.39
126 0.39
127 0.42
128 0.45
129 0.47
130 0.46
131 0.5
132 0.49
133 0.51
134 0.5
135 0.45
136 0.46
137 0.44
138 0.38
139 0.32
140 0.31
141 0.26
142 0.25
143 0.27
144 0.25
145 0.19
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.19
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.24
160 0.26
161 0.32
162 0.36
163 0.36
164 0.37
165 0.43
166 0.45
167 0.49
168 0.53
169 0.5
170 0.49
171 0.49
172 0.54
173 0.56
174 0.55
175 0.51
176 0.54
177 0.49
178 0.43
179 0.4
180 0.32
181 0.24
182 0.21
183 0.18
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.21
195 0.24
196 0.28
197 0.28
198 0.28
199 0.32
200 0.31
201 0.4
202 0.39
203 0.36
204 0.34
205 0.37
206 0.38
207 0.36
208 0.35
209 0.26
210 0.21
211 0.19
212 0.16
213 0.13
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.17
224 0.2
225 0.22
226 0.25
227 0.26
228 0.25
229 0.25
230 0.25
231 0.2
232 0.17
233 0.18
234 0.16
235 0.18
236 0.23
237 0.27
238 0.28
239 0.33
240 0.34
241 0.33
242 0.38
243 0.43
244 0.44
245 0.5
246 0.56
247 0.56
248 0.62
249 0.62
250 0.58
251 0.55
252 0.58
253 0.51
254 0.44
255 0.39
256 0.3
257 0.27
258 0.24
259 0.19
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.23
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.13
299 0.18
300 0.27
301 0.35
302 0.41
303 0.42
304 0.44
305 0.45
306 0.42
307 0.4
308 0.38
309 0.39
310 0.35
311 0.35
312 0.33
313 0.31
314 0.28
315 0.23
316 0.17
317 0.08
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.13
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.15
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.1
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.16
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.1
384 0.13
385 0.19
386 0.19
387 0.19
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.18
392 0.18
393 0.12
394 0.16
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.15
399 0.14
400 0.12
401 0.12
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.16
415 0.17
416 0.16
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.08
423 0.07
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.13
432 0.16
433 0.18
434 0.2
435 0.21
436 0.25
437 0.24
438 0.24
439 0.24
440 0.19
441 0.16
442 0.14
443 0.13
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.07
454 0.07
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.16
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.16
467 0.15
468 0.14
469 0.11
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.12
484 0.15
485 0.17
486 0.22
487 0.27
488 0.36
489 0.41
490 0.48
491 0.54
492 0.62
493 0.71
494 0.76
495 0.82
496 0.85
497 0.91
498 0.94
499 0.94
500 0.94
501 0.92
502 0.87
503 0.86
504 0.84
505 0.81
506 0.72
507 0.67
508 0.6
509 0.53
510 0.48
511 0.39
512 0.31
513 0.25
514 0.26
515 0.31
516 0.3
517 0.29
518 0.33
519 0.39
520 0.4
521 0.4
522 0.37
523 0.27
524 0.24
525 0.24
526 0.22
527 0.16
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.1
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.07
539 0.09
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.13
547 0.12
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.13
552 0.11
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.09
562 0.1
563 0.12
564 0.12
565 0.19
566 0.22
567 0.25
568 0.26
569 0.28
570 0.31
571 0.33
572 0.32
573 0.29
574 0.27
575 0.26
576 0.27
577 0.2
578 0.16
579 0.13
580 0.14
581 0.12
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.11
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.16
592 0.21
593 0.22
594 0.24
595 0.3
596 0.31
597 0.32
598 0.35
599 0.34
600 0.31
601 0.34
602 0.32
603 0.28
604 0.27
605 0.24
606 0.19
607 0.17
608 0.15
609 0.12
610 0.14
611 0.14
612 0.15
613 0.23
614 0.23
615 0.29
616 0.38
617 0.43
618 0.44
619 0.45
620 0.46
621 0.44
622 0.49
623 0.47
624 0.45
625 0.41
626 0.37
627 0.38