Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VZS6

Protein Details
Accession A0A4U0VZS6    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-56EVPVTVKKRRAPRSKSLADAGQPPKKSTKITKPKKAVPILPKLLHydrophilic
492-516LVERKDGKGARKKREMKCVRKELEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-48KKRRAPRSKSLADAGQPPKKSTKITKPKKA
311-319KKPRGRPRK
496-505KDGKGARKKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6.5, cyto_mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences VVSPVIVSAAPAEVPVTVKKRRAPRSKSLADAGQPPKKSTKITKPKKAVPILPKLLSPQTASKKMDRQDFLFGTSSQLAREESPTFIRDLQHAMRESETVMDGEEGSQPTYESYESVPTAPHGTSLSIVQTRRGLWAAAARDPDRQMLAADWRVRRLPSSAVNSKMADEESQDSGVADMEPVSITGLDMEEADDDTLPESGVGDLAQPPACNNGIDAPSEQEMQDSGFVDIDTFEKDPGRHDEKDECMVLKSDDSHDKLAGESASLASNLPSLSTSTNLASTKSDLLPTASITIQKELSARVTHEPLSQAKKPRGRPRKALVPNGSTTNSSKPQGRPHEDLGSVTSALTKRKRNTTILPSTAPASLDQDGWLNIDEISDSDTPPTPSPPRRRASHSPVALQPLEFDAPVPPTAPDSASTSKAGEKPDWAATSAALFPRITHTIRSAPATSTPSKPSWHTKILLYDPLPLEDFTAWLNAQGVRYAGTETETVLVERKDGKGARKKREMKCVRKELEVEAWMVQKWCEEMGVCCFSRESGRGGAKARY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.16
3 0.21
4 0.27
5 0.33
6 0.4
7 0.5
8 0.6
9 0.69
10 0.71
11 0.75
12 0.8
13 0.81
14 0.8
15 0.75
16 0.7
17 0.63
18 0.64
19 0.63
20 0.59
21 0.54
22 0.52
23 0.52
24 0.51
25 0.54
26 0.55
27 0.57
28 0.61
29 0.7
30 0.77
31 0.8
32 0.85
33 0.88
34 0.87
35 0.84
36 0.82
37 0.82
38 0.78
39 0.71
40 0.63
41 0.57
42 0.53
43 0.46
44 0.4
45 0.39
46 0.4
47 0.46
48 0.49
49 0.51
50 0.55
51 0.59
52 0.64
53 0.59
54 0.54
55 0.55
56 0.52
57 0.49
58 0.44
59 0.38
60 0.33
61 0.31
62 0.29
63 0.2
64 0.21
65 0.18
66 0.17
67 0.21
68 0.18
69 0.18
70 0.21
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.25
77 0.26
78 0.29
79 0.3
80 0.29
81 0.28
82 0.27
83 0.26
84 0.21
85 0.19
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.16
107 0.14
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.2
119 0.22
120 0.22
121 0.18
122 0.15
123 0.2
124 0.2
125 0.21
126 0.25
127 0.23
128 0.26
129 0.27
130 0.27
131 0.22
132 0.2
133 0.17
134 0.14
135 0.18
136 0.2
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.29
141 0.29
142 0.28
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.33
147 0.36
148 0.38
149 0.41
150 0.4
151 0.38
152 0.34
153 0.28
154 0.2
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.18
226 0.23
227 0.22
228 0.25
229 0.28
230 0.29
231 0.32
232 0.3
233 0.24
234 0.19
235 0.19
236 0.17
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.07
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.2
294 0.25
295 0.28
296 0.32
297 0.37
298 0.43
299 0.5
300 0.58
301 0.65
302 0.66
303 0.7
304 0.7
305 0.74
306 0.75
307 0.76
308 0.71
309 0.64
310 0.59
311 0.54
312 0.48
313 0.39
314 0.33
315 0.29
316 0.26
317 0.24
318 0.28
319 0.28
320 0.36
321 0.43
322 0.48
323 0.47
324 0.48
325 0.51
326 0.46
327 0.43
328 0.36
329 0.28
330 0.22
331 0.17
332 0.16
333 0.13
334 0.18
335 0.23
336 0.28
337 0.31
338 0.4
339 0.45
340 0.47
341 0.53
342 0.58
343 0.6
344 0.57
345 0.54
346 0.47
347 0.43
348 0.39
349 0.32
350 0.22
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.14
370 0.14
371 0.19
372 0.22
373 0.31
374 0.41
375 0.48
376 0.53
377 0.56
378 0.64
379 0.68
380 0.7
381 0.71
382 0.66
383 0.61
384 0.58
385 0.59
386 0.51
387 0.41
388 0.32
389 0.25
390 0.22
391 0.17
392 0.14
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.16
403 0.18
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.24
408 0.27
409 0.29
410 0.24
411 0.24
412 0.25
413 0.29
414 0.29
415 0.26
416 0.23
417 0.2
418 0.2
419 0.2
420 0.18
421 0.15
422 0.13
423 0.12
424 0.17
425 0.21
426 0.2
427 0.2
428 0.23
429 0.26
430 0.28
431 0.32
432 0.29
433 0.26
434 0.3
435 0.33
436 0.33
437 0.32
438 0.35
439 0.33
440 0.35
441 0.38
442 0.42
443 0.44
444 0.47
445 0.45
446 0.44
447 0.49
448 0.51
449 0.53
450 0.45
451 0.44
452 0.38
453 0.37
454 0.35
455 0.28
456 0.25
457 0.18
458 0.17
459 0.12
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.11
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.17
482 0.18
483 0.23
484 0.27
485 0.36
486 0.44
487 0.53
488 0.61
489 0.69
490 0.78
491 0.79
492 0.86
493 0.87
494 0.87
495 0.89
496 0.89
497 0.83
498 0.79
499 0.74
500 0.68
501 0.65
502 0.56
503 0.47
504 0.39
505 0.37
506 0.32
507 0.3
508 0.25
509 0.17
510 0.17
511 0.15
512 0.14
513 0.13
514 0.14
515 0.2
516 0.26
517 0.25
518 0.25
519 0.25
520 0.25
521 0.29
522 0.28
523 0.26
524 0.28
525 0.33
526 0.37