Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X4J3

Protein Details
Accession A0A4U0X4J3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-169HEPLSVPRRRQKKIARRRTYSALDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-163RRRQKKIARRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MSRYRHKSPNISSAGMPHSRSLRTYDLDGHHGLSHRRNEEAFQKGRLNQKTTKTATKQSSNEGSADLAANGGSVDEEEDGNANAEEEDDSEEPDNRAPFNKPSTNAGLARKVMMHHRGTGPRSGKKRTFSSIRSDSSSQGSEDSDHEPLSVPRRRQKKIARRRTYSALDRNRVTTWEFDLVESFDAMKEDIEISDNDDDYAAVELVSDSDEEAHANVEKAEQKGIVESNVVDSADEASTARRLSLVSADSDLLDFELDANTIFDDKTFFDAEFHRGAIGEASDLASTTAAKEQDRKSFNVSSRRVRFNDEIQLSEGSSTVESDQESDIYPDIMLQQDHLDPGFRRVIENEQDFDVEYGSGSDSDSSYWDFRGDEGDGGFQGFDDVNEDSNQSDSSAGSSGYETDEGETTDEDSPISPTVSNPKSLLRQQTSPALGEESDVVTSKPTPNSSMQPPRIPASAAKRRGPVMGTWAVDPNKAFAVIDHTGTRMLITPARHPSNNDLQLWSRAGSSVSSPSNSPQASFQNLAGEESDLSDMSAQQSSMYLDPALRQLFGAATGSGLSLGKQALIGGTDLRAFYPFTNVGVDGSVIEDEDEWDDASDHEDQLDINAFIDLGDDSENDDVEVSDEGTPAASSTQNSTSNLLAHFDKGFNIMSFAHNQHRAHHHASLPQSPAMRKLTSDEHAVQVGRAAAANALITPRRKRRTGTINAHSHVAHHGSPLKHGSPLNGGPARGTFGGRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.5
3 0.44
4 0.37
5 0.37
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.35
10 0.34
11 0.36
12 0.39
13 0.38
14 0.41
15 0.4
16 0.37
17 0.34
18 0.35
19 0.37
20 0.37
21 0.41
22 0.39
23 0.41
24 0.4
25 0.41
26 0.45
27 0.49
28 0.46
29 0.43
30 0.48
31 0.5
32 0.58
33 0.61
34 0.6
35 0.58
36 0.62
37 0.66
38 0.66
39 0.7
40 0.67
41 0.69
42 0.71
43 0.73
44 0.68
45 0.67
46 0.68
47 0.6
48 0.55
49 0.46
50 0.38
51 0.31
52 0.28
53 0.19
54 0.12
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.11
75 0.1
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.16
80 0.19
81 0.2
82 0.17
83 0.2
84 0.22
85 0.26
86 0.33
87 0.38
88 0.37
89 0.41
90 0.45
91 0.49
92 0.5
93 0.49
94 0.47
95 0.41
96 0.41
97 0.36
98 0.32
99 0.34
100 0.36
101 0.33
102 0.32
103 0.38
104 0.44
105 0.45
106 0.52
107 0.52
108 0.53
109 0.58
110 0.62
111 0.62
112 0.62
113 0.65
114 0.65
115 0.66
116 0.61
117 0.64
118 0.63
119 0.61
120 0.59
121 0.55
122 0.49
123 0.45
124 0.42
125 0.33
126 0.26
127 0.23
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.17
136 0.25
137 0.29
138 0.32
139 0.39
140 0.48
141 0.52
142 0.6
143 0.68
144 0.71
145 0.76
146 0.81
147 0.83
148 0.81
149 0.84
150 0.82
151 0.79
152 0.78
153 0.76
154 0.75
155 0.71
156 0.65
157 0.62
158 0.55
159 0.48
160 0.4
161 0.32
162 0.26
163 0.25
164 0.24
165 0.21
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.17
170 0.13
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.07
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.07
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.16
279 0.19
280 0.27
281 0.3
282 0.31
283 0.33
284 0.38
285 0.43
286 0.46
287 0.48
288 0.5
289 0.54
290 0.58
291 0.55
292 0.54
293 0.52
294 0.46
295 0.49
296 0.41
297 0.36
298 0.31
299 0.3
300 0.25
301 0.22
302 0.17
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.11
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.18
334 0.21
335 0.23
336 0.21
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.13
342 0.07
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.15
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.19
410 0.23
411 0.27
412 0.34
413 0.3
414 0.31
415 0.31
416 0.36
417 0.35
418 0.31
419 0.27
420 0.2
421 0.17
422 0.15
423 0.13
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.1
431 0.11
432 0.12
433 0.14
434 0.17
435 0.21
436 0.29
437 0.37
438 0.39
439 0.4
440 0.41
441 0.4
442 0.38
443 0.35
444 0.31
445 0.31
446 0.37
447 0.39
448 0.41
449 0.41
450 0.41
451 0.42
452 0.39
453 0.3
454 0.26
455 0.25
456 0.22
457 0.21
458 0.24
459 0.23
460 0.23
461 0.22
462 0.17
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.07
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.09
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.17
480 0.24
481 0.28
482 0.29
483 0.29
484 0.34
485 0.41
486 0.44
487 0.4
488 0.35
489 0.33
490 0.35
491 0.34
492 0.29
493 0.19
494 0.15
495 0.14
496 0.12
497 0.12
498 0.14
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.21
504 0.21
505 0.2
506 0.19
507 0.21
508 0.24
509 0.25
510 0.24
511 0.22
512 0.22
513 0.22
514 0.19
515 0.16
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.07
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.15
569 0.15
570 0.14
571 0.13
572 0.13
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.09
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.11
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.07
601 0.05
602 0.06
603 0.05
604 0.07
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.12
623 0.17
624 0.2
625 0.22
626 0.24
627 0.24
628 0.25
629 0.25
630 0.24
631 0.2
632 0.19
633 0.19
634 0.17
635 0.17
636 0.17
637 0.18
638 0.15
639 0.16
640 0.15
641 0.16
642 0.2
643 0.23
644 0.28
645 0.33
646 0.34
647 0.38
648 0.44
649 0.48
650 0.48
651 0.5
652 0.46
653 0.45
654 0.5
655 0.49
656 0.46
657 0.43
658 0.42
659 0.38
660 0.41
661 0.39
662 0.35
663 0.3
664 0.31
665 0.34
666 0.33
667 0.38
668 0.34
669 0.32
670 0.34
671 0.34
672 0.29
673 0.25
674 0.23
675 0.17
676 0.14
677 0.12
678 0.09
679 0.09
680 0.1
681 0.08
682 0.11
683 0.14
684 0.2
685 0.29
686 0.39
687 0.46
688 0.51
689 0.55
690 0.62
691 0.68
692 0.73
693 0.75
694 0.75
695 0.77
696 0.74
697 0.72
698 0.62
699 0.52
700 0.46
701 0.39
702 0.29
703 0.25
704 0.3
705 0.28
706 0.33
707 0.37
708 0.34
709 0.35
710 0.36
711 0.34
712 0.35
713 0.37
714 0.41
715 0.39
716 0.37
717 0.34
718 0.34
719 0.34
720 0.28
721 0.28