Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WV41

Protein Details
Accession A0A4U0WV41    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-106TFQVPATGKPKRKRNYKARDPNAPKRPLTHydrophilic
224-247TPPPAKTPKSTKGRKSKKDAEVPAHydrophilic
287-313QATKESSSEEPKKKRARKSKGGDEVVAHydrophilic
332-356AVAETPATEKKKRKSRKSKGESGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-102KPKRKRNYKARDPNAPK
218-241SPPRKPTPPPAKTPKSTKGRKSKK
277-307AKEKGVEKRKQATKESSSEEPKKKRARKSKG
341-353KKKRKSRKSKGES
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPKKDEQSNNVITFTREQYVYDRDAIVRGLTTLQASVNEMLGAYITHSNRILGGDSPGFDSLELSNHVPLLGAALNTFQVPATGKPKRKRNYKARDPNAPKRPLTAYFLYLQTARPIIKKDLGEDAKPGDVAQEATKRWRAMPESEQATWKESYQKSLQEYNEEVKAYIAKGGQLPSDDSPHQENDHVAEGVMAPTGSEDETSSEEDDDDEPAKALSPPRKPTPPPAKTPKSTKGRKSKKDAEVPAAPAVAPSSPSPATASAVRQSRVPLPGSVPAKEKGVEKRKQATKESSSEEPKKKRARKSKGGDEVVAAKGAVDEAAASKEEAGSGAVAETPATEKKKRKSRKSKGESGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.33
4 0.25
5 0.24
6 0.27
7 0.31
8 0.32
9 0.3
10 0.28
11 0.25
12 0.26
13 0.25
14 0.21
15 0.16
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.12
33 0.12
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.12
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.11
70 0.2
71 0.28
72 0.36
73 0.45
74 0.55
75 0.63
76 0.72
77 0.79
78 0.81
79 0.84
80 0.87
81 0.9
82 0.88
83 0.9
84 0.89
85 0.89
86 0.87
87 0.82
88 0.72
89 0.64
90 0.61
91 0.53
92 0.49
93 0.41
94 0.33
95 0.29
96 0.3
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.17
105 0.19
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.29
113 0.27
114 0.23
115 0.22
116 0.2
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.14
122 0.14
123 0.18
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.25
128 0.25
129 0.26
130 0.3
131 0.32
132 0.33
133 0.33
134 0.35
135 0.32
136 0.32
137 0.27
138 0.24
139 0.25
140 0.21
141 0.25
142 0.25
143 0.28
144 0.29
145 0.34
146 0.34
147 0.29
148 0.31
149 0.29
150 0.28
151 0.24
152 0.2
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.12
204 0.18
205 0.24
206 0.29
207 0.35
208 0.41
209 0.43
210 0.52
211 0.59
212 0.58
213 0.6
214 0.65
215 0.67
216 0.67
217 0.73
218 0.72
219 0.71
220 0.73
221 0.74
222 0.75
223 0.78
224 0.82
225 0.83
226 0.84
227 0.83
228 0.84
229 0.79
230 0.75
231 0.68
232 0.62
233 0.54
234 0.44
235 0.34
236 0.24
237 0.2
238 0.14
239 0.1
240 0.08
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.24
251 0.24
252 0.23
253 0.25
254 0.27
255 0.29
256 0.28
257 0.24
258 0.23
259 0.29
260 0.31
261 0.31
262 0.3
263 0.28
264 0.28
265 0.28
266 0.3
267 0.33
268 0.41
269 0.45
270 0.49
271 0.57
272 0.63
273 0.68
274 0.7
275 0.69
276 0.66
277 0.67
278 0.65
279 0.62
280 0.64
281 0.67
282 0.69
283 0.68
284 0.71
285 0.75
286 0.78
287 0.81
288 0.83
289 0.84
290 0.85
291 0.88
292 0.89
293 0.89
294 0.86
295 0.76
296 0.68
297 0.62
298 0.52
299 0.42
300 0.3
301 0.2
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.09
324 0.15
325 0.21
326 0.28
327 0.37
328 0.47
329 0.58
330 0.68
331 0.77
332 0.82
333 0.88
334 0.92
335 0.93
336 0.94