Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WH01

Protein Details
Accession A0A4U0WH01    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-111KVAGEKGADKPKKRKAKKTANGAASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-103GEKGADKPKKRKAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MTSPDIQPTLPADSDSHKRLANIVASATQQYSLKNYDAAADFYSEATELQATVNGEMSPENADLLYAYGRCLYHVAVSKSDVLGGKVAGEKGADKPKKRKAKKTANGAASSTGMEGSAQAGEQPLDAILETIVEKRDDVDQQKPEAGAETKPYFAITGDENWTDESDSEADDGEDGAQEADEEAGEEEDDFANAYEILDVARVLLNRKLEALADEGMGKNEVSEESAEVRQVKERLADTHDLQAEISLENERFADAITDSHSALALKHERYPKESSLLAEAHFKLSLALEFASVTKAQGEDGNEQTEADTTKVDQGLRDEAIQEMEAAIESCRLRISKERGELASLAATEAERKQRSINDVTEMVEEMEQRLLDLRNPEPVLNGAPGLDDAASGSNPLAGLLGSMLGESPAQQKARIEEATKGANDLTGLVKHKKKPAVEKDTSAVGGASGTNGAAKGKRRLEFAGEVDQATEGKKVKFDDEQAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.33
4 0.3
5 0.3
6 0.32
7 0.35
8 0.34
9 0.29
10 0.27
11 0.26
12 0.26
13 0.27
14 0.25
15 0.21
16 0.18
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.24
26 0.21
27 0.19
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.13
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.07
36 0.07
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.08
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.16
61 0.23
62 0.25
63 0.24
64 0.26
65 0.28
66 0.26
67 0.29
68 0.24
69 0.18
70 0.16
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.17
79 0.28
80 0.33
81 0.38
82 0.47
83 0.57
84 0.68
85 0.76
86 0.8
87 0.81
88 0.86
89 0.88
90 0.89
91 0.89
92 0.85
93 0.79
94 0.69
95 0.59
96 0.49
97 0.4
98 0.29
99 0.2
100 0.12
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.17
125 0.2
126 0.26
127 0.29
128 0.3
129 0.32
130 0.31
131 0.28
132 0.26
133 0.24
134 0.18
135 0.2
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.18
224 0.2
225 0.18
226 0.22
227 0.22
228 0.19
229 0.18
230 0.16
231 0.13
232 0.1
233 0.1
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.18
255 0.24
256 0.25
257 0.29
258 0.33
259 0.3
260 0.3
261 0.3
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.11
287 0.13
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.12
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.11
300 0.12
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.2
323 0.27
324 0.32
325 0.37
326 0.41
327 0.4
328 0.42
329 0.4
330 0.33
331 0.27
332 0.19
333 0.14
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.19
339 0.18
340 0.19
341 0.22
342 0.26
343 0.32
344 0.35
345 0.35
346 0.31
347 0.31
348 0.32
349 0.29
350 0.26
351 0.21
352 0.16
353 0.14
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.16
362 0.16
363 0.22
364 0.23
365 0.23
366 0.22
367 0.22
368 0.22
369 0.19
370 0.18
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.06
396 0.09
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.19
401 0.22
402 0.28
403 0.3
404 0.29
405 0.28
406 0.32
407 0.35
408 0.33
409 0.31
410 0.25
411 0.22
412 0.2
413 0.17
414 0.15
415 0.14
416 0.19
417 0.26
418 0.33
419 0.39
420 0.47
421 0.52
422 0.57
423 0.63
424 0.7
425 0.72
426 0.71
427 0.7
428 0.65
429 0.63
430 0.56
431 0.45
432 0.34
433 0.23
434 0.18
435 0.13
436 0.1
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.13
443 0.19
444 0.27
445 0.35
446 0.38
447 0.41
448 0.44
449 0.49
450 0.5
451 0.49
452 0.49
453 0.43
454 0.4
455 0.37
456 0.34
457 0.28
458 0.23
459 0.23
460 0.18
461 0.18
462 0.22
463 0.23
464 0.27
465 0.33