FuNGI

A0A4U0WX10

Protein Details

Accession

A0A4U0WX10

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	APGRGKKTLKQQPKFIGRRS	Hydrophilic
427-453	PSSPGIKKKVPQKPRVRRRSGFRGTKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-16	GRGRGRGRSA
103-174	APGRGKKTLKQQPKFIGRRSKEERDALEAAEAARRRARIAAAEAEANAKIAERGGFRGRGRSDRGSRGGRGR
430-450	PGIKKKVPQKPRVRRRSGFRG

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MTPKGSGRGRGRGRSAAKATGRLSAETSGWENPDIDPAASNDSIAAPGDPKETSSATLGSSSIIGETQDIAATTSTPAPSSLRPPVERLDSLRGTGSGSGSPAPGRGKKTLKQQPKFIGRRSKEERDALEAAEAARRRARIAAAEAEANAKIAERGGFRGRGRSDRGSRGGRGRGGFMGDNLASGPFSAGTVTQGSRGFYAQRSGRRIGGRGDGSSGHRIKRESGIKIDEDGDFSMLGIPRVKSEYEGYTSSDPEDGNEVGPRTNVDTIIDLISDAEDSGEDRDVAMRQKMIGTSGLGPGLQPVRIKRVEHEDRKAGAKKGTSASAPIKIEDEAAKKDGHESHRNATAHAIDEQVSPSKSRRGKAKVKDVEFVRDERRWKGVYQEDSDRDGEVRIKEEPRDEEDGLPMLPVENVTDMDSLTQVKEPPSSPGIKKKVPQKPRVRRRSGFRGTKPVIQTKEEQQEWDRHVEELGLLSNELGHIVVAASAPPDAEGDTPMEDAAQAKSEDKKAGRVYLFQFPPIVPDLIARPTVKEEPTSFTQTRGNSIDVDATPASIDKTPVKIEDDVTDADELKSKSFRPKLATGAAGKLRIHESGRATLSWGGTSLELNMGIAASLLQDTMLMKITPENQRVTANDGGEAMSFGQIRGKFVVTPDWDEIIG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.66
3	0.65
4	0.61
5	0.6
6	0.56
7	0.53
8	0.5
9	0.42
10	0.4
11	0.33
12	0.29
13	0.25
14	0.27
15	0.22
16	0.22
17	0.22
18	0.2
19	0.18
20	0.23
21	0.21
22	0.18
23	0.17
24	0.17
25	0.21
26	0.2
27	0.19
28	0.15
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.13
33	0.09
34	0.1
35	0.13
36	0.12
37	0.13
38	0.15
39	0.16
40	0.17
41	0.18
42	0.18
43	0.16
44	0.17
45	0.16
46	0.14
47	0.13
48	0.11
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.07
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.09
60	0.09
61	0.11
62	0.11
63	0.11
64	0.13
65	0.14
66	0.17
67	0.22
68	0.29
69	0.33
70	0.35
71	0.38
72	0.41
73	0.45
74	0.45
75	0.44
76	0.44
77	0.38
78	0.37
79	0.35
80	0.31
81	0.26
82	0.25
83	0.21
84	0.14
85	0.14
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.15
90	0.2
91	0.23
92	0.27
93	0.33
94	0.4
95	0.44
96	0.55
97	0.62
98	0.67
99	0.69
100	0.73
101	0.76
102	0.8
103	0.81
104	0.79
105	0.8
106	0.73
107	0.76
108	0.76
109	0.75
110	0.71
111	0.7
112	0.64
113	0.6
114	0.57
115	0.47
116	0.4
117	0.31
118	0.24
119	0.23
120	0.21
121	0.16
122	0.18
123	0.18
124	0.18
125	0.19
126	0.21
127	0.2
128	0.23
129	0.26
130	0.24
131	0.25
132	0.24
133	0.23
134	0.21
135	0.18
136	0.13
137	0.09
138	0.07
139	0.07
140	0.09
141	0.09
142	0.13
143	0.17
144	0.23
145	0.24
146	0.31
147	0.34
148	0.37
149	0.42
150	0.47
151	0.49
152	0.51
153	0.57
154	0.55
155	0.56
156	0.57
157	0.56
158	0.52
159	0.46
160	0.41
161	0.35
162	0.33
163	0.29
164	0.22
165	0.2
166	0.15
167	0.14
168	0.12
169	0.11
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.08
179	0.08
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.14
184	0.15
185	0.15
186	0.14
187	0.21
188	0.22
189	0.28
190	0.32
191	0.34
192	0.38
193	0.39
194	0.4
195	0.36
196	0.38
197	0.34
198	0.29
199	0.28
200	0.25
201	0.26
202	0.31
203	0.31
204	0.26
205	0.27
206	0.27
207	0.28
208	0.34
209	0.37
210	0.33
211	0.35
212	0.37
213	0.35
214	0.36
215	0.35
216	0.27
217	0.22
218	0.19
219	0.14
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.12
229	0.13
230	0.12
231	0.14
232	0.15
233	0.16
234	0.18
235	0.19
236	0.19
237	0.19
238	0.18
239	0.17
240	0.14
241	0.12
242	0.13
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.07
272	0.09
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.15
292	0.18
293	0.18
294	0.19
295	0.28
296	0.36
297	0.41
298	0.45
299	0.44
300	0.43
301	0.48
302	0.5
303	0.42
304	0.35
305	0.3
306	0.29
307	0.26
308	0.26
309	0.2
310	0.2
311	0.2
312	0.22
313	0.22
314	0.19
315	0.18
316	0.16
317	0.17
318	0.16
319	0.16
320	0.13
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.15
325	0.19
326	0.22
327	0.27
328	0.28
329	0.3
330	0.37
331	0.37
332	0.35
333	0.31
334	0.27
335	0.21
336	0.19
337	0.16
338	0.1
339	0.1
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.18
346	0.21
347	0.24
348	0.32
349	0.38
350	0.48
351	0.55
352	0.64
353	0.65
354	0.64
355	0.67
356	0.6
357	0.57
358	0.49
359	0.44
360	0.38
361	0.34
362	0.33
363	0.3
364	0.32
365	0.28
366	0.26
367	0.3
368	0.32
369	0.33
370	0.35
371	0.39
372	0.37
373	0.39
374	0.39
375	0.32
376	0.26
377	0.22
378	0.21
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.16
383	0.17
384	0.2
385	0.22
386	0.23
387	0.27
388	0.27
389	0.24
390	0.23
391	0.23
392	0.19
393	0.17
394	0.12
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.12
412	0.12
413	0.15
414	0.18
415	0.22
416	0.25
417	0.33
418	0.39
419	0.41
420	0.45
421	0.52
422	0.58
423	0.63
424	0.7
425	0.71
426	0.77
427	0.83
428	0.89
429	0.89
430	0.86
431	0.85
432	0.85
433	0.84
434	0.83
435	0.78
436	0.77
437	0.71
438	0.71
439	0.67
440	0.63
441	0.56
442	0.49
443	0.47
444	0.44
445	0.49
446	0.43
447	0.41
448	0.37
449	0.4
450	0.39
451	0.4
452	0.33
453	0.25
454	0.25
455	0.22
456	0.19
457	0.14
458	0.12
459	0.08
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.11
491	0.15
492	0.18
493	0.23
494	0.23
495	0.29
496	0.3
497	0.36
498	0.35
499	0.37
500	0.38
501	0.42
502	0.42
503	0.36
504	0.35
505	0.28
506	0.29
507	0.26
508	0.23
509	0.14
510	0.14
511	0.15
512	0.17
513	0.2
514	0.18
515	0.16
516	0.21
517	0.25
518	0.25
519	0.26
520	0.25
521	0.28
522	0.33
523	0.39
524	0.35
525	0.34
526	0.37
527	0.35
528	0.38
529	0.35
530	0.31
531	0.24
532	0.24
533	0.26
534	0.21
535	0.24
536	0.18
537	0.16
538	0.14
539	0.14
540	0.15
541	0.12
542	0.14
543	0.13
544	0.17
545	0.19
546	0.21
547	0.24
548	0.24
549	0.24
550	0.24
551	0.24
552	0.22
553	0.21
554	0.2
555	0.17
556	0.16
557	0.2
558	0.18
559	0.17
560	0.19
561	0.21
562	0.3
563	0.35
564	0.4
565	0.41
566	0.46
567	0.49
568	0.52
569	0.55
570	0.48
571	0.49
572	0.48
573	0.45
574	0.4
575	0.37
576	0.34
577	0.31
578	0.31
579	0.28
580	0.29
581	0.31
582	0.33
583	0.3
584	0.31
585	0.3
586	0.29
587	0.24
588	0.21
589	0.16
590	0.14
591	0.14
592	0.12
593	0.11
594	0.1
595	0.09
596	0.09
597	0.07
598	0.06
599	0.06
600	0.05
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.07
608	0.09
609	0.09
610	0.09
611	0.13
612	0.2
613	0.28
614	0.32
615	0.35
616	0.35
617	0.39
618	0.4
619	0.42
620	0.4
621	0.32
622	0.29
623	0.26
624	0.24
625	0.2
626	0.19
627	0.14
628	0.12
629	0.11
630	0.1
631	0.16
632	0.16
633	0.19
634	0.21
635	0.21
636	0.2
637	0.22
638	0.3
639	0.28
640	0.33
641	0.34

A0A4U0WX10

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer