Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WWF9

Protein Details
Accession A0A4U0WWF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-266LIDDTPKPKNKARKEQADRGGSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-89RRRG
250-297KPKNKARKEQADRGGSRGGMRGGPRGGGRGRGGGGGMRGGRGRGGRGF
Subcellular Location(s) mito 8, cyto 6, extr 4, cyto_nucl 4, E.R. 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR013945  Pkr1  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF08636  Pkr1  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MSAFLENLWNSIFTPGATPTLLIATNATFAALQLVLFSLLIATYSIHFVVLSFLCGGLWWAINWFAAELAAAQQKEEEAERLRQARRRGKSGRDTIRLGEGDSGADDEGTETEVEERKEKGVAYEESPMEPKVREDAMETLRESARATMTSGSTLGVGGQGDEGATQRRSLADSQVSTDSEWEKIGTIVHGTIASVSPQMNTALRACKVTVKGRETTACDSMNIRGSTIRYFILPDSLPLDTLLIDDTPKPKNKARKEQADRGGSRGGMRGGPRGGGRGRGGGGGMRGGRGRGGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.08
16 0.07
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.04
26 0.04
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.07
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.16
67 0.21
68 0.27
69 0.32
70 0.36
71 0.45
72 0.51
73 0.53
74 0.59
75 0.61
76 0.64
77 0.69
78 0.74
79 0.74
80 0.7
81 0.66
82 0.58
83 0.57
84 0.48
85 0.39
86 0.3
87 0.21
88 0.16
89 0.13
90 0.12
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.06
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.1
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.17
165 0.17
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.2
195 0.24
196 0.3
197 0.35
198 0.35
199 0.37
200 0.39
201 0.42
202 0.42
203 0.42
204 0.39
205 0.32
206 0.29
207 0.27
208 0.27
209 0.3
210 0.26
211 0.22
212 0.19
213 0.2
214 0.21
215 0.21
216 0.19
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.13
235 0.2
236 0.26
237 0.31
238 0.37
239 0.47
240 0.57
241 0.66
242 0.72
243 0.77
244 0.8
245 0.85
246 0.88
247 0.87
248 0.78
249 0.71
250 0.64
251 0.54
252 0.46
253 0.39
254 0.32
255 0.26
256 0.26
257 0.27
258 0.25
259 0.27
260 0.26
261 0.28
262 0.28
263 0.3
264 0.3
265 0.28
266 0.28
267 0.25
268 0.25
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.18
276 0.21
277 0.21