Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XCX8

Protein Details
Accession A0A4U0XCX8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-41GYRHRRVLKIIRRPRIKWEWKVVNTQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-478PKPRRLALLALPRRRRGSGVRGHK
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 4.5, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MFFRYQIYGGALLIGYRHRRVLKIIRRPRIKWEWKVVNTQITFINTTATVPTVRNADELLPVYVVLRTPLTDEESVQSYFSQLSITVEAHASGTAVSAAPDVGAKELQQAPLAKDLLYSMTIAASQEPLVVISRSGAEAPVHSESFVFAVWRVNIPLTRPRVRLQKPSIYFTANAVLNSAEQTRAGMIEGQYLPSGVPASINLLECFRDDPALAGVKPRLSAARVQKIAPVAAVSENVLRPLKSSHRRSFRAGPALVSRIRYSRLGHPVKSTVIASLDLEVTSFAGCDVTVEEVSLGISDGRAEPCTGLDGLGLPLTCKPGDETTILYRLSPARIAGQTTTDNQTFHVLEINTIAHVLISEDCHPQINIRWRANVDLAPPAPSLLGNSNRRTSSQSLAFRLPGRDSIPSVDDNSLRPSPTETSNATNITLTFAGPPVVHVGETFRWDVSVVNRSPKPRRLALLALPRRRRGSGVRGHKPLASIATAISRDEHGADAMAEAVLDESVVYAMQKNGTQEPTGLVCLSPDVRIGPLASSACFTTELKFLVLTPGVLHLEALRVVDLDTKEVMDVRNLPDIIALERSRES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.2
4 0.26
5 0.28
6 0.3
7 0.39
8 0.48
9 0.53
10 0.59
11 0.68
12 0.72
13 0.78
14 0.79
15 0.81
16 0.82
17 0.81
18 0.79
19 0.8
20 0.8
21 0.76
22 0.82
23 0.77
24 0.75
25 0.65
26 0.58
27 0.51
28 0.43
29 0.4
30 0.31
31 0.28
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.19
45 0.2
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.11
53 0.09
54 0.09
55 0.11
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.18
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.1
69 0.08
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.13
93 0.15
94 0.16
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.26
99 0.26
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.09
135 0.06
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.17
143 0.24
144 0.28
145 0.33
146 0.35
147 0.4
148 0.48
149 0.53
150 0.6
151 0.6
152 0.62
153 0.59
154 0.62
155 0.59
156 0.51
157 0.46
158 0.37
159 0.36
160 0.27
161 0.23
162 0.19
163 0.16
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.1
182 0.11
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.18
209 0.24
210 0.31
211 0.32
212 0.32
213 0.34
214 0.34
215 0.33
216 0.26
217 0.18
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.22
230 0.29
231 0.38
232 0.44
233 0.53
234 0.56
235 0.61
236 0.66
237 0.64
238 0.62
239 0.54
240 0.47
241 0.41
242 0.41
243 0.37
244 0.3
245 0.25
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.23
251 0.32
252 0.34
253 0.35
254 0.36
255 0.36
256 0.34
257 0.33
258 0.26
259 0.17
260 0.13
261 0.13
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.17
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.18
332 0.16
333 0.14
334 0.16
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.06
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.16
354 0.25
355 0.31
356 0.31
357 0.34
358 0.34
359 0.36
360 0.37
361 0.33
362 0.25
363 0.22
364 0.2
365 0.2
366 0.19
367 0.17
368 0.15
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.21
373 0.24
374 0.27
375 0.31
376 0.32
377 0.33
378 0.36
379 0.34
380 0.32
381 0.35
382 0.37
383 0.36
384 0.38
385 0.39
386 0.37
387 0.36
388 0.31
389 0.26
390 0.23
391 0.21
392 0.2
393 0.2
394 0.2
395 0.19
396 0.2
397 0.2
398 0.19
399 0.18
400 0.22
401 0.22
402 0.2
403 0.19
404 0.19
405 0.2
406 0.22
407 0.24
408 0.22
409 0.24
410 0.27
411 0.28
412 0.25
413 0.23
414 0.2
415 0.18
416 0.16
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.12
428 0.12
429 0.15
430 0.16
431 0.13
432 0.12
433 0.13
434 0.14
435 0.15
436 0.22
437 0.21
438 0.28
439 0.32
440 0.39
441 0.46
442 0.52
443 0.53
444 0.5
445 0.52
446 0.49
447 0.51
448 0.53
449 0.57
450 0.59
451 0.62
452 0.64
453 0.65
454 0.63
455 0.59
456 0.55
457 0.5
458 0.51
459 0.52
460 0.56
461 0.6
462 0.62
463 0.63
464 0.6
465 0.54
466 0.47
467 0.39
468 0.29
469 0.21
470 0.16
471 0.19
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.07
497 0.09
498 0.11
499 0.14
500 0.18
501 0.21
502 0.21
503 0.2
504 0.22
505 0.22
506 0.22
507 0.2
508 0.15
509 0.13
510 0.15
511 0.15
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.11
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.16
527 0.15
528 0.17
529 0.18
530 0.17
531 0.17
532 0.16
533 0.18
534 0.18
535 0.16
536 0.14
537 0.16
538 0.16
539 0.16
540 0.16
541 0.11
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.17
555 0.17
556 0.16
557 0.2
558 0.21
559 0.27
560 0.27
561 0.26
562 0.26
563 0.27
564 0.25
565 0.27
566 0.24