Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4U0XM24

Protein Details
Accession A0A4U0XM24    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-51VNPLVSKKSTVRKPPRQATPSAHydrophilic
137-156SRFTRPIRLHRRDPRARPEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-43PRRRKPVNPLVSKKSTVRKP
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Amino Acid Sequences MSASPAGAPFGPNSTTPNGGAVPPRRRKPVNPLVSKKSTVRKPPRQATPSAVVNGVSGTRNGGAQHVPLRQSAGPQTVQDKYGPLPDMDVGGTHDVPDVGRYTDYPIVMTKKSLMEGLRHHAMRFATKEEIRPYDESRFTRPIRLHRRDPRARPEKHIDPTLDPTLDPTMDDKEREKQEILKAQRQAQREANQAQMAPVQKAAASQVKRAPFQKKTEQVYRTDDTPQSKKRMLLRYEEGRPWHLEDFDNKNTWVGTYEEALSECHVMFVIEDGSFRMVPIEKWYKFSAVGRVKNSLTIDEAEARMSMKTKDTRWFMDTQKANEEKRREQAIRIRTMNKARQGMRGEGKMEGDEEDRERPDLAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.22
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.3
8 0.35
9 0.42
10 0.49
11 0.55
12 0.61
13 0.66
14 0.7
15 0.73
16 0.74
17 0.75
18 0.76
19 0.78
20 0.78
21 0.79
22 0.77
23 0.73
24 0.72
25 0.7
26 0.7
27 0.72
28 0.74
29 0.79
30 0.84
31 0.88
32 0.83
33 0.78
34 0.74
35 0.7
36 0.64
37 0.55
38 0.47
39 0.36
40 0.31
41 0.28
42 0.22
43 0.16
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.12
51 0.15
52 0.2
53 0.23
54 0.24
55 0.23
56 0.26
57 0.24
58 0.27
59 0.27
60 0.26
61 0.24
62 0.24
63 0.28
64 0.26
65 0.27
66 0.24
67 0.22
68 0.19
69 0.23
70 0.22
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.15
76 0.14
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.2
101 0.18
102 0.18
103 0.21
104 0.26
105 0.3
106 0.29
107 0.29
108 0.29
109 0.28
110 0.28
111 0.27
112 0.24
113 0.24
114 0.25
115 0.29
116 0.3
117 0.32
118 0.31
119 0.32
120 0.32
121 0.33
122 0.37
123 0.35
124 0.37
125 0.41
126 0.39
127 0.42
128 0.42
129 0.47
130 0.52
131 0.57
132 0.61
133 0.63
134 0.73
135 0.76
136 0.8
137 0.8
138 0.79
139 0.75
140 0.72
141 0.71
142 0.68
143 0.63
144 0.6
145 0.51
146 0.44
147 0.46
148 0.41
149 0.33
150 0.25
151 0.22
152 0.18
153 0.16
154 0.14
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.27
166 0.34
167 0.37
168 0.36
169 0.37
170 0.42
171 0.46
172 0.45
173 0.44
174 0.42
175 0.42
176 0.42
177 0.4
178 0.36
179 0.32
180 0.29
181 0.25
182 0.22
183 0.19
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.14
192 0.17
193 0.21
194 0.24
195 0.27
196 0.32
197 0.37
198 0.36
199 0.42
200 0.48
201 0.51
202 0.55
203 0.61
204 0.59
205 0.56
206 0.56
207 0.52
208 0.45
209 0.41
210 0.39
211 0.36
212 0.41
213 0.42
214 0.41
215 0.42
216 0.44
217 0.48
218 0.53
219 0.5
220 0.49
221 0.51
222 0.52
223 0.55
224 0.54
225 0.48
226 0.42
227 0.41
228 0.37
229 0.31
230 0.26
231 0.22
232 0.24
233 0.3
234 0.31
235 0.31
236 0.28
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.2
241 0.14
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.18
267 0.26
268 0.25
269 0.29
270 0.31
271 0.31
272 0.33
273 0.35
274 0.37
275 0.37
276 0.43
277 0.42
278 0.45
279 0.44
280 0.46
281 0.44
282 0.35
283 0.28
284 0.23
285 0.22
286 0.21
287 0.21
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.17
295 0.22
296 0.26
297 0.34
298 0.39
299 0.42
300 0.45
301 0.49
302 0.46
303 0.51
304 0.52
305 0.47
306 0.52
307 0.54
308 0.55
309 0.57
310 0.6
311 0.57
312 0.6
313 0.65
314 0.58
315 0.6
316 0.63
317 0.64
318 0.66
319 0.67
320 0.63
321 0.61
322 0.69
323 0.69
324 0.68
325 0.68
326 0.61
327 0.63
328 0.64
329 0.64
330 0.62
331 0.59
332 0.52
333 0.46
334 0.45
335 0.37
336 0.33
337 0.27
338 0.22
339 0.2
340 0.22
341 0.24
342 0.24
343 0.25
344 0.24