Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4U0X409

Protein Details
Accession A0A4U0X409    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-62PSPSPSSTSTKRKRDTQAQPAESKRAAKRKRTKKPKDIDDDELDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-54QPAESKRAAKRKRTKKPK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MSEPGASDGGIPLIEPLSPSPSPSSTSTKRKRDTQAQPAESKRAAKRKRTKKPKDIDDDELDTTAGVNTAVAHMDSRLLADHVAQRTKRFEPELSLVELEDRYIPERAILDTSSWKRQRDLENLPDFLEHSAGSKKKASKLNKAAEEKGSPHTIVVAGAGLRAADVTRALRKFQTKDAMVAKLISIGIDTPQRLIDLLNNGSLSTAHLERIVIDASHIDRKKRGIFDMKDTQLPLVQLLARDVLKGRYGASEKKIDLVFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.13
5 0.14
6 0.16
7 0.19
8 0.2
9 0.23
10 0.27
11 0.34
12 0.37
13 0.48
14 0.57
15 0.63
16 0.68
17 0.73
18 0.78
19 0.8
20 0.82
21 0.82
22 0.83
23 0.79
24 0.8
25 0.75
26 0.72
27 0.64
28 0.61
29 0.58
30 0.58
31 0.59
32 0.62
33 0.69
34 0.74
35 0.83
36 0.87
37 0.9
38 0.9
39 0.93
40 0.92
41 0.92
42 0.87
43 0.83
44 0.78
45 0.71
46 0.61
47 0.51
48 0.4
49 0.29
50 0.23
51 0.15
52 0.1
53 0.05
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.12
69 0.15
70 0.21
71 0.21
72 0.23
73 0.28
74 0.3
75 0.32
76 0.3
77 0.28
78 0.27
79 0.3
80 0.3
81 0.27
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.14
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.15
99 0.18
100 0.26
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.35
105 0.4
106 0.41
107 0.45
108 0.45
109 0.45
110 0.45
111 0.43
112 0.38
113 0.32
114 0.25
115 0.19
116 0.09
117 0.07
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.17
122 0.19
123 0.25
124 0.33
125 0.38
126 0.44
127 0.52
128 0.58
129 0.62
130 0.64
131 0.6
132 0.55
133 0.51
134 0.43
135 0.36
136 0.3
137 0.22
138 0.18
139 0.16
140 0.13
141 0.11
142 0.09
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.06
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.19
158 0.24
159 0.27
160 0.31
161 0.38
162 0.33
163 0.37
164 0.4
165 0.38
166 0.33
167 0.31
168 0.25
169 0.18
170 0.17
171 0.12
172 0.08
173 0.06
174 0.07
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.1
202 0.13
203 0.22
204 0.24
205 0.24
206 0.27
207 0.32
208 0.39
209 0.41
210 0.45
211 0.47
212 0.49
213 0.55
214 0.62
215 0.59
216 0.56
217 0.53
218 0.46
219 0.38
220 0.34
221 0.26
222 0.19
223 0.17
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.22
235 0.26
236 0.31
237 0.36
238 0.4
239 0.39
240 0.44