Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4MSY4

Protein Details
Accession A0A4S4MSY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-159GADGEKPKRKQPPKLDEARLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-152KGKKDGADGEKPKRKQPPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR002699  V_ATPase_D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046961  F:proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01813  ATP-synt_D  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MSFSLDDIWDEPVQPEARGPTPAPIPIDIDNDLPGPSPAKRPRTTLFLSDSEDGSPKKPPPPRSSTASKLNPDIDALFDDLDDDLRFAPALDLDALRRQAAARHAAKLPALTPREILPSSSPPRDLDGDDEGGKGKKDGADGEKPKRKQPPKLDEARLLGPNGFPVLVKHTKSFKPRGKGHEASDLNRLMQIYQFWAHKMYPKNHFGENVQRIEKLCHSKRMGVAMSVWRDESKGLINGRKPQEPEDDATSDTEDVDQGVEGRARSSPARESSASAPGSPTRGSHASSPLRPPSSASDRTSTYGDDDIDIDALIQEDAERQASSHARQPSPPLNPPSNHYRSNPKPVPGPDDMDEDEDLWSSFNDNSIFDDPSILATSSTVATSMNSRIEHEEDDEDEWQIMREQEEEEERMRAQKQRPPPAPAKPALKEPDPIPDSGAPVEKPRPTNDEGARENIFPTRMALTNTKLRLKGAQTGHSLLAKKRDALTTRFRAILRKVDEAKRKMGRVMQLASFSLAEVTYATGDISYLVQEQAKSASFKVKAKQENVSGVVLPAFEVDRAAGTGAHITLHAKAAQSSHYSPIDFNLTGLGRGGQQVLKSKEVYAKAVETLVELASLQTAFTILDEVIRATNRRVNAIEHVVIPRLDNTIKYITSELDEMDREEFFRQALLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.23
5 0.26
6 0.26
7 0.25
8 0.27
9 0.31
10 0.31
11 0.28
12 0.29
13 0.28
14 0.31
15 0.27
16 0.25
17 0.23
18 0.21
19 0.2
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.15
24 0.24
25 0.32
26 0.4
27 0.43
28 0.49
29 0.52
30 0.57
31 0.6
32 0.56
33 0.54
34 0.48
35 0.5
36 0.46
37 0.43
38 0.36
39 0.36
40 0.3
41 0.26
42 0.28
43 0.27
44 0.34
45 0.41
46 0.48
47 0.53
48 0.61
49 0.65
50 0.66
51 0.7
52 0.69
53 0.72
54 0.71
55 0.65
56 0.62
57 0.58
58 0.51
59 0.45
60 0.38
61 0.29
62 0.22
63 0.19
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.16
82 0.17
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.18
87 0.22
88 0.3
89 0.28
90 0.32
91 0.34
92 0.35
93 0.35
94 0.33
95 0.29
96 0.28
97 0.28
98 0.25
99 0.24
100 0.24
101 0.28
102 0.27
103 0.27
104 0.23
105 0.29
106 0.34
107 0.36
108 0.37
109 0.32
110 0.35
111 0.36
112 0.33
113 0.28
114 0.26
115 0.26
116 0.24
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.2
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.19
126 0.23
127 0.32
128 0.4
129 0.5
130 0.57
131 0.58
132 0.63
133 0.69
134 0.71
135 0.71
136 0.74
137 0.74
138 0.75
139 0.82
140 0.81
141 0.76
142 0.72
143 0.67
144 0.58
145 0.48
146 0.39
147 0.29
148 0.24
149 0.19
150 0.14
151 0.1
152 0.08
153 0.15
154 0.2
155 0.22
156 0.25
157 0.3
158 0.36
159 0.44
160 0.54
161 0.54
162 0.58
163 0.64
164 0.69
165 0.72
166 0.71
167 0.66
168 0.66
169 0.62
170 0.54
171 0.53
172 0.46
173 0.36
174 0.32
175 0.29
176 0.19
177 0.17
178 0.15
179 0.12
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.17
184 0.17
185 0.22
186 0.29
187 0.33
188 0.38
189 0.43
190 0.45
191 0.45
192 0.46
193 0.43
194 0.46
195 0.46
196 0.43
197 0.38
198 0.37
199 0.36
200 0.37
201 0.4
202 0.39
203 0.36
204 0.39
205 0.4
206 0.43
207 0.44
208 0.47
209 0.42
210 0.33
211 0.32
212 0.29
213 0.29
214 0.26
215 0.24
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.12
221 0.14
222 0.17
223 0.21
224 0.25
225 0.32
226 0.36
227 0.39
228 0.38
229 0.37
230 0.4
231 0.37
232 0.37
233 0.33
234 0.31
235 0.27
236 0.26
237 0.24
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.21
257 0.21
258 0.23
259 0.24
260 0.3
261 0.28
262 0.24
263 0.22
264 0.19
265 0.2
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.23
273 0.26
274 0.28
275 0.32
276 0.33
277 0.33
278 0.32
279 0.31
280 0.3
281 0.33
282 0.35
283 0.33
284 0.31
285 0.31
286 0.33
287 0.32
288 0.26
289 0.2
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.16
312 0.21
313 0.21
314 0.22
315 0.27
316 0.3
317 0.33
318 0.37
319 0.36
320 0.35
321 0.35
322 0.37
323 0.42
324 0.4
325 0.39
326 0.35
327 0.4
328 0.4
329 0.5
330 0.5
331 0.43
332 0.43
333 0.42
334 0.46
335 0.39
336 0.37
337 0.28
338 0.29
339 0.27
340 0.24
341 0.22
342 0.16
343 0.14
344 0.11
345 0.1
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.1
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.08
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.07
371 0.08
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.1
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.15
399 0.17
400 0.23
401 0.26
402 0.3
403 0.39
404 0.48
405 0.53
406 0.56
407 0.6
408 0.62
409 0.63
410 0.62
411 0.6
412 0.51
413 0.53
414 0.5
415 0.46
416 0.4
417 0.34
418 0.38
419 0.32
420 0.31
421 0.26
422 0.24
423 0.23
424 0.22
425 0.23
426 0.15
427 0.17
428 0.21
429 0.22
430 0.24
431 0.25
432 0.29
433 0.3
434 0.38
435 0.38
436 0.41
437 0.39
438 0.41
439 0.4
440 0.35
441 0.33
442 0.27
443 0.23
444 0.16
445 0.15
446 0.14
447 0.14
448 0.16
449 0.18
450 0.2
451 0.26
452 0.31
453 0.33
454 0.31
455 0.31
456 0.33
457 0.33
458 0.37
459 0.34
460 0.36
461 0.34
462 0.36
463 0.37
464 0.36
465 0.36
466 0.3
467 0.33
468 0.29
469 0.28
470 0.28
471 0.32
472 0.32
473 0.36
474 0.43
475 0.42
476 0.43
477 0.45
478 0.43
479 0.43
480 0.43
481 0.46
482 0.41
483 0.42
484 0.45
485 0.5
486 0.58
487 0.56
488 0.61
489 0.58
490 0.56
491 0.52
492 0.5
493 0.48
494 0.45
495 0.45
496 0.38
497 0.35
498 0.33
499 0.31
500 0.26
501 0.2
502 0.14
503 0.1
504 0.08
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.09
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.13
522 0.14
523 0.15
524 0.21
525 0.24
526 0.29
527 0.35
528 0.42
529 0.47
530 0.49
531 0.54
532 0.52
533 0.53
534 0.51
535 0.46
536 0.38
537 0.3
538 0.27
539 0.2
540 0.15
541 0.1
542 0.08
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.12
558 0.13
559 0.12
560 0.13
561 0.14
562 0.17
563 0.21
564 0.22
565 0.25
566 0.26
567 0.26
568 0.25
569 0.26
570 0.29
571 0.24
572 0.21
573 0.2
574 0.19
575 0.18
576 0.18
577 0.17
578 0.12
579 0.13
580 0.15
581 0.12
582 0.15
583 0.23
584 0.26
585 0.29
586 0.29
587 0.31
588 0.36
589 0.36
590 0.36
591 0.31
592 0.29
593 0.27
594 0.27
595 0.24
596 0.19
597 0.17
598 0.14
599 0.11
600 0.09
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.07
605 0.05
606 0.06
607 0.05
608 0.06
609 0.07
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.09
614 0.11
615 0.14
616 0.16
617 0.18
618 0.23
619 0.23
620 0.28
621 0.29
622 0.29
623 0.34
624 0.38
625 0.36
626 0.35
627 0.36
628 0.34
629 0.32
630 0.3
631 0.24
632 0.22
633 0.21
634 0.19
635 0.21
636 0.24
637 0.24
638 0.25
639 0.25
640 0.22
641 0.23
642 0.23
643 0.2
644 0.18
645 0.19
646 0.18
647 0.18
648 0.17
649 0.17
650 0.17
651 0.17
652 0.13