FuNGI

A0A4S4MMF7

Protein Details

Accession

A0A4S4MMF7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-299	REGQAPQRKGGQKKKKGREKAHVAVDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-292	PQRKGGQKKKKGREK

Subcellular Location(s)

nucl 8, cyto_mito 8, mito 7.5, cyto 7.5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MAPSPVATTRSLPTPDAPVSTRPWELPHGVGTYFPTSDDNRLANEEKFYVWSILMEKAYDVCELWEIVKGTDLAPSPGAMDAKEWKKKDKAATALMLKCIKPELVVKVASALTSHDAWTALETEFSQTGSGSVMLWFRRLTKLFVSGGDISAHCNGFNEAVRHLANSDFQIDSYFAAAILISTLPADPKDPESWNNFIAGFKVDKKTTTLPSVINTILEEKRRLQSDDSEVRNTETALAARERTARAAGKRFCRNCKRDGHDASQCWGPGGEREGQAPQRKGGQKKKKGREKAHVAVDDGGDENSNHVVYEKCLMTRVVDLSDYDPSRDSIPSTLHSDSQPSSVIQPAYSARTTGAPDIIIDSGSSTHIHSVRSDFTSMRTTSGNIIGFGAGTTGIKGHGESILYSVLPKGGTSRLRLQDTCYIPASSPSIISVSRLDDADCYTLFGNRRCITFEAKDDWKHMQDALANENIVFSGTLRHDHLYHLDTPRSTESSYAVNLPPAPTSRLERLHQKFGHLNYQMIKLMARKGSLLGIQLSKAELAREPPMCAACAQGKMTCASFPPSESGKANEFLGRVHSDLWGPASVQSPAGTRYIITFSDDHSAWVWAYYLRRKSDAFAAFKDWLALVENISGHRLKIFRSDNGGEFINANWIEFMKARGIHWETSSAKTPEQNGVAERLMYTIFDRVRTILIDSGLPLFLWTEAVSYVIYTKNRHGSSRLKDTTPHEIRYGRKPSAKRLHRFGCKCYVYDHSPGRRKLDPKGIPAVFVGYSDTQKAFRVYIPEKHAVHVSVHVRFDDDSDMRDVFQTEGEMQFHYSSLRPKASADDDDDFPSQEHIPSPLSPPFIPHPPIPNPIPPEPSSSHSRNTRPNSPPPTRQRSSRSAAIKSQAKTQQVLSEGKRGPRKQLPAPEATAPAAEASAAQGESIDDHPPSSPPSESALDEPPDPDELVHRVLSHGEEPRSYREATESADFAEWSDAMDSEHDSISEQRTFELVVPPKGANIITTKWVYRFKHDANGKIIRYKARLVARGFTQKPGVDFDETFAPVAKIESSRLLLALAASLNWEIDVVDVDSAFLNSEMPDDPQIFVRQPEGYVVEGKEHMVWHLLKVLYGLKQSGHLWYQKLKSIMIKLGFIVCVADPCVFVRQTPKATSLVSSHVDDLSLICSSRDETALLKSQLRQHVPIKDGSHXXXXXIXXSQLLPPFASFHELESTWRVQTRLKLQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.34
4	0.34
5	0.32
6	0.35
7	0.38
8	0.38
9	0.33
10	0.34
11	0.35
12	0.35
13	0.34
14	0.32
15	0.3
16	0.27
17	0.27
18	0.27
19	0.25
20	0.23
21	0.21
22	0.21
23	0.21
24	0.25
25	0.29
26	0.27
27	0.26
28	0.31
29	0.33
30	0.31
31	0.32
32	0.29
33	0.25
34	0.26
35	0.26
36	0.22
37	0.19
38	0.19
39	0.18
40	0.21
41	0.2
42	0.18
43	0.17
44	0.17
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.11
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.15
53	0.15
54	0.15
55	0.17
56	0.16
57	0.15
58	0.19
59	0.19
60	0.16
61	0.16
62	0.16
63	0.14
64	0.16
65	0.17
66	0.12
67	0.14
68	0.21
69	0.3
70	0.38
71	0.4
72	0.45
73	0.51
74	0.58
75	0.64
76	0.65
77	0.64
78	0.63
79	0.68
80	0.69
81	0.65
82	0.65
83	0.6
84	0.51
85	0.44
86	0.39
87	0.31
88	0.25
89	0.26
90	0.26
91	0.27
92	0.27
93	0.26
94	0.27
95	0.27
96	0.25
97	0.2
98	0.17
99	0.14
100	0.14
101	0.15
102	0.12
103	0.13
104	0.13
105	0.14
106	0.14
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.13
111	0.13
112	0.13
113	0.12
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.1
118	0.08
119	0.09
120	0.12
121	0.13
122	0.15
123	0.15
124	0.17
125	0.24
126	0.25
127	0.27
128	0.27
129	0.32
130	0.32
131	0.32
132	0.35
133	0.29
134	0.28
135	0.27
136	0.23
137	0.2
138	0.22
139	0.21
140	0.15
141	0.15
142	0.15
143	0.16
144	0.19
145	0.18
146	0.16
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.2
151	0.18
152	0.16
153	0.16
154	0.18
155	0.14
156	0.14
157	0.15
158	0.15
159	0.14
160	0.13
161	0.11
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.05
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.07
173	0.09
174	0.1
175	0.14
176	0.18
177	0.21
178	0.25
179	0.29
180	0.33
181	0.31
182	0.31
183	0.28
184	0.24
185	0.22
186	0.2
187	0.19
188	0.2
189	0.24
190	0.24
191	0.25
192	0.29
193	0.33
194	0.35
195	0.37
196	0.36
197	0.32
198	0.33
199	0.35
200	0.31
201	0.26
202	0.22
203	0.22
204	0.23
205	0.24
206	0.25
207	0.25
208	0.3
209	0.33
210	0.35
211	0.32
212	0.35
213	0.41
214	0.46
215	0.47
216	0.46
217	0.43
218	0.42
219	0.4
220	0.34
221	0.26
222	0.19
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.15
227	0.16
228	0.2
229	0.19
230	0.19
231	0.23
232	0.25
233	0.3
234	0.38
235	0.43
236	0.48
237	0.57
238	0.63
239	0.69
240	0.74
241	0.73
242	0.71
243	0.75
244	0.73
245	0.73
246	0.73
247	0.71
248	0.69
249	0.66
250	0.61
251	0.54
252	0.47
253	0.37
254	0.3
255	0.22
256	0.16
257	0.17
258	0.19
259	0.16
260	0.18
261	0.22
262	0.29
263	0.36
264	0.35
265	0.34
266	0.38
267	0.45
268	0.53
269	0.59
270	0.63
271	0.66
272	0.75
273	0.84
274	0.86
275	0.9
276	0.9
277	0.89
278	0.88
279	0.86
280	0.84
281	0.76
282	0.67
283	0.58
284	0.49
285	0.39
286	0.29
287	0.21
288	0.13
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.13
298	0.13
299	0.12
300	0.14
301	0.15
302	0.15
303	0.17
304	0.17
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.14
309	0.2
310	0.19
311	0.17
312	0.16
313	0.16
314	0.17
315	0.17
316	0.16
317	0.13
318	0.15
319	0.17
320	0.21
321	0.21
322	0.21
323	0.21
324	0.23
325	0.22
326	0.21
327	0.2
328	0.15
329	0.15
330	0.17
331	0.17
332	0.13
333	0.15
334	0.15
335	0.17
336	0.17
337	0.16
338	0.13
339	0.15
340	0.17
341	0.16
342	0.15
343	0.11
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.09
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.1
355	0.12
356	0.13
357	0.14
358	0.16
359	0.18
360	0.19
361	0.21
362	0.17
363	0.18
364	0.23
365	0.22
366	0.22
367	0.19
368	0.18
369	0.18
370	0.23
371	0.2
372	0.15
373	0.15
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.12
399	0.15
400	0.19
401	0.27
402	0.31
403	0.36
404	0.36
405	0.38
406	0.41
407	0.41
408	0.4
409	0.34
410	0.28
411	0.24
412	0.26
413	0.24
414	0.16
415	0.13
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.12
432	0.15
433	0.16
434	0.23
435	0.23
436	0.23
437	0.25
438	0.27
439	0.29
440	0.29
441	0.3
442	0.28
443	0.31
444	0.32
445	0.32
446	0.34
447	0.3
448	0.28
449	0.24
450	0.2
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.09
460	0.07
461	0.05
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.16
470	0.15
471	0.19
472	0.2
473	0.21
474	0.2
475	0.22
476	0.23
477	0.22
478	0.19
479	0.16
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.15
484	0.14
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.12
490	0.13
491	0.12
492	0.15
493	0.19
494	0.23
495	0.25
496	0.34
497	0.36
498	0.44
499	0.43
500	0.43
501	0.42
502	0.4
503	0.46
504	0.37
505	0.35
506	0.28
507	0.3
508	0.27
509	0.22
510	0.21
511	0.15
512	0.17
513	0.17
514	0.15
515	0.13
516	0.13
517	0.14
518	0.14
519	0.13
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.06
529	0.08
530	0.12
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.14
535	0.14
536	0.13
537	0.13
538	0.11
539	0.12
540	0.13
541	0.12
542	0.13
543	0.13
544	0.13
545	0.12
546	0.1
547	0.12
548	0.11
549	0.11
550	0.13
551	0.14
552	0.16
553	0.16
554	0.18
555	0.16
556	0.17
557	0.17
558	0.15
559	0.14
560	0.12
561	0.14
562	0.13
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.09
567	0.09
568	0.1
569	0.08
570	0.07
571	0.08
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.1
579	0.08
580	0.07
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.09
586	0.1
587	0.13
588	0.13
589	0.13
590	0.11
591	0.12
592	0.1
593	0.09
594	0.08
595	0.07
596	0.09
597	0.14
598	0.18
599	0.19
600	0.21
601	0.21
602	0.22
603	0.29
604	0.32
605	0.3
606	0.26
607	0.29
608	0.27
609	0.27
610	0.26
611	0.18
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.09
620	0.09
621	0.07
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.16
626	0.19
627	0.19
628	0.24
629	0.26
630	0.25
631	0.26
632	0.26
633	0.19
634	0.16
635	0.15
636	0.14
637	0.12
638	0.11
639	0.09
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.08
645	0.09
646	0.09
647	0.14
648	0.17
649	0.17
650	0.17
651	0.21
652	0.21
653	0.23
654	0.27
655	0.23
656	0.22
657	0.23
658	0.24
659	0.22
660	0.21
661	0.2
662	0.16
663	0.18
664	0.17
665	0.15
666	0.13
667	0.11
668	0.09
669	0.08
670	0.08
671	0.09
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.11
676	0.12
677	0.12
678	0.12
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.08
685	0.07
686	0.06
687	0.05
688	0.04
689	0.05
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.06
697	0.09
698	0.1
699	0.12
700	0.15
701	0.22
702	0.23
703	0.25
704	0.28
705	0.34
706	0.39
707	0.48
708	0.48
709	0.41
710	0.44
711	0.46
712	0.52
713	0.48
714	0.43
715	0.36
716	0.38
717	0.4
718	0.45
719	0.48
720	0.42
721	0.44
722	0.45
723	0.52
724	0.58
725	0.64
726	0.6
727	0.63
728	0.67
729	0.7
730	0.71
731	0.65
732	0.65
733	0.57
734	0.52
735	0.46
736	0.42
737	0.36
738	0.4
739	0.43
740	0.42
741	0.48
742	0.5
743	0.52
744	0.53
745	0.51
746	0.5
747	0.54
748	0.5
749	0.46
750	0.52
751	0.48
752	0.43
753	0.4
754	0.36
755	0.25
756	0.2
757	0.18
758	0.1
759	0.11
760	0.11
761	0.12
762	0.11
763	0.12
764	0.13
765	0.12
766	0.12
767	0.19
768	0.21
769	0.27
770	0.32
771	0.37
772	0.37
773	0.37
774	0.37
775	0.31
776	0.28
777	0.28
778	0.26
779	0.22
780	0.22
781	0.21
782	0.21
783	0.2
784	0.2
785	0.19
786	0.15
787	0.13
788	0.15
789	0.15
790	0.14
791	0.15
792	0.14
793	0.1
794	0.1
795	0.09
796	0.08
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.1
802	0.1
803	0.1
804	0.11
805	0.14
806	0.18
807	0.19
808	0.19
809	0.19
810	0.23
811	0.26
812	0.27
813	0.27
814	0.25
815	0.25
816	0.28
817	0.28
818	0.24
819	0.2
820	0.19
821	0.15
822	0.13
823	0.12
824	0.11
825	0.12
826	0.13
827	0.16
828	0.17
829	0.2
830	0.19
831	0.21
832	0.23
833	0.26
834	0.28
835	0.27
836	0.3
837	0.31
838	0.36
839	0.36
840	0.38
841	0.38
842	0.38
843	0.41
844	0.36
845	0.37
846	0.35
847	0.36
848	0.38
849	0.35
850	0.39
851	0.41
852	0.46
853	0.5
854	0.54
855	0.6
856	0.59
857	0.66
858	0.68
859	0.68
860	0.72
861	0.73
862	0.76
863	0.69
864	0.7
865	0.68
866	0.66
867	0.65
868	0.63
869	0.6
870	0.54
871	0.56
872	0.56
873	0.56
874	0.49
875	0.51
876	0.49
877	0.45
878	0.42
879	0.4
880	0.35
881	0.33
882	0.38
883	0.32
884	0.35
885	0.36
886	0.41
887	0.48
888	0.46
889	0.49
890	0.51
891	0.56
892	0.55
893	0.61
894	0.6
895	0.56
896	0.58
897	0.52
898	0.46
899	0.4
900	0.32
901	0.23
902	0.18
903	0.13
904	0.09
905	0.06
906	0.05
907	0.06
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.07
913	0.08
914	0.09
915	0.08
916	0.09
917	0.1
918	0.11
919	0.13
920	0.14
921	0.13
922	0.13
923	0.17
924	0.19
925	0.2
926	0.22
927	0.24
928	0.23
929	0.23
930	0.22
931	0.19
932	0.18
933	0.17
934	0.14
935	0.12
936	0.13
937	0.15
938	0.15
939	0.14
940	0.13
941	0.14
942	0.16
943	0.18
944	0.2
945	0.19
946	0.21
947	0.24
948	0.28
949	0.3
950	0.29
951	0.25
952	0.23
953	0.24
954	0.24
955	0.24
956	0.2
957	0.18
958	0.18
959	0.18
960	0.15
961	0.14
962	0.11
963	0.09
964	0.09
965	0.08
966	0.07
967	0.08
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.09
972	0.09
973	0.12
974	0.15
975	0.17
976	0.16
977	0.15
978	0.15
979	0.16
980	0.17
981	0.23
982	0.24
983	0.24
984	0.26
985	0.26
986	0.26
987	0.26
988	0.24
989	0.18
990	0.17
991	0.16
992	0.18
993	0.21
994	0.22
995	0.25
996	0.34
997	0.34
998	0.37
999	0.44
1000	0.42
1001	0.5
1002	0.54
1003	0.56
1004	0.55
1005	0.62
1006	0.57
1007	0.54
1008	0.54
1009	0.5
1010	0.48
1011	0.45
1012	0.45
1013	0.43
1014	0.48
1015	0.45
1016	0.46
1017	0.47
1018	0.54
1019	0.52
1020	0.48
1021	0.46
1022	0.4
1023	0.39
1024	0.39
1025	0.35
1026	0.29
1027	0.28
1028	0.26
1029	0.26
1030	0.25
1031	0.24
1032	0.2
1033	0.17
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.14
1037	0.11
1038	0.12
1039	0.15
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.16
1043	0.15
1044	0.13
1045	0.12
1046	0.12
1047	0.09
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.07
1064	0.06
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.1
1070	0.12
1071	0.13
1072	0.14
1073	0.17
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.2
1077	0.21
1078	0.19
1079	0.19
1080	0.21
1081	0.2
1082	0.18
1083	0.21
1084	0.2
1085	0.2
1086	0.2
1087	0.2
1088	0.19
1089	0.17
1090	0.16
1091	0.17
1092	0.17
1093	0.16
1094	0.21
1095	0.2
1096	0.19
1097	0.2
1098	0.23
1099	0.21
1100	0.23
1101	0.23
1102	0.17
1103	0.21
1104	0.22
1105	0.25
1106	0.26
1107	0.27
1108	0.29
1109	0.35
1110	0.38
1111	0.4
1112	0.42
1113	0.39
1114	0.4
1115	0.41
1116	0.45
1117	0.39
1118	0.37
1119	0.33
1120	0.33
1121	0.3
1122	0.24
1123	0.2
1124	0.13
1125	0.13
1126	0.13
1127	0.12
1128	0.11
1129	0.12
1130	0.17
1131	0.16
1132	0.17
1133	0.23
1134	0.29
1135	0.34
1136	0.37
1137	0.38
1138	0.36
1139	0.37
1140	0.39
1141	0.34
1142	0.33
1143	0.3
1144	0.29
1145	0.28
1146	0.25
1147	0.24
1148	0.21
1149	0.18
1150	0.15
1151	0.13
1152	0.11
1153	0.1
1154	0.1
1155	0.12
1156	0.13
1157	0.14
1158	0.13
1159	0.13
1160	0.19
1161	0.27
1162	0.29
1163	0.31
1164	0.33
1165	0.4
1166	0.48
1167	0.5
1168	0.51
1169	0.5
1170	0.55
1171	0.55
1172	0.57
1173	0.52
1174	0.49
1175	0.49
1176	0.45
1177	0.44
1178	0.38
1179	0.36
1180	0.33
1181	0.32
1182	0.29
1183	0.26
1184	0.24
1185	0.2
1186	0.2
1187	0.23
1188	0.19
1189	0.19
1190	0.21
1191	0.21
1192	0.24
1193	0.27
1194	0.29
1195	0.27
1196	0.3
1197	0.29
1198	0.29
1199	0.36

A0A4S4MMF7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer