Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3XJ67

Protein Details
Accession A0A4V3XJ67    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MYSIDTRQPRKEKTRASHKVPGERLKTHydrophilic
53-79TVTWKVYHQGKFKKRFNKENINSRAYIHydrophilic
281-306SAPAARPTPKSPRRNRDKDASKQEKTHydrophilic
372-391ERKAPPKREAGKDKDNKDKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-230HKKDDGGKGKRGAGLPPKP
241-243KKA
286-296RPTPKSPRRNR
373-385RKAPPKREAGKDK
437-456AGRGRGRGRGARGRGGPRGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MYSIDTRQPRKEKTRASHKVPGERLKTVVRRLPPNLPEQIFWNSVQDWVSEETVTWKVYHQGKFKKRFNKENINSRAYIAFKDEEALATFSREYDGHLFRDKAGNESIAVVEFAPHQKVPSEKKKVDTRVGTIEKDEDYLSFLESLKESPSKAFDVDTLEQLASAERPPPAPTTTPLLEALKAEKSAQKDKESIIRAHAHYKDPAIAGGSSHKKDDGGKGKRGAGLPPKPSTANETTPQGKKATKPAPKGDTTPMPKKIAQNPNVNANANSASAQAATAKSAPAARPTPKSPRRNRDKDASKQEKTATQAAPRAQTPDTLAAPSNAAASSSTTAAPTAPGGAGGAPPSRRTRPIFGLASRHFEAALSGAGVERKAPPKREAGKDKDNKDKDAPADEGKAALTREAAVQGLAILTRPAGAPGTQESAGPGPGGSSDGAGRGRGRGRGARGRGGPRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.85
4 0.85
5 0.84
6 0.84
7 0.82
8 0.81
9 0.76
10 0.69
11 0.64
12 0.64
13 0.63
14 0.61
15 0.59
16 0.57
17 0.59
18 0.61
19 0.67
20 0.62
21 0.62
22 0.63
23 0.58
24 0.51
25 0.47
26 0.47
27 0.41
28 0.37
29 0.33
30 0.25
31 0.25
32 0.25
33 0.2
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.15
38 0.14
39 0.16
40 0.18
41 0.19
42 0.17
43 0.15
44 0.21
45 0.29
46 0.36
47 0.41
48 0.49
49 0.59
50 0.69
51 0.76
52 0.8
53 0.81
54 0.85
55 0.85
56 0.86
57 0.85
58 0.86
59 0.85
60 0.8
61 0.72
62 0.63
63 0.57
64 0.47
65 0.39
66 0.32
67 0.25
68 0.19
69 0.2
70 0.18
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.17
82 0.2
83 0.22
84 0.27
85 0.27
86 0.27
87 0.33
88 0.31
89 0.27
90 0.26
91 0.24
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.13
96 0.13
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.14
105 0.2
106 0.29
107 0.37
108 0.45
109 0.46
110 0.54
111 0.62
112 0.67
113 0.69
114 0.64
115 0.58
116 0.58
117 0.59
118 0.52
119 0.44
120 0.4
121 0.32
122 0.28
123 0.24
124 0.15
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.14
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.21
161 0.21
162 0.22
163 0.23
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.17
173 0.24
174 0.28
175 0.29
176 0.29
177 0.3
178 0.36
179 0.37
180 0.34
181 0.31
182 0.32
183 0.31
184 0.35
185 0.37
186 0.31
187 0.29
188 0.28
189 0.26
190 0.21
191 0.19
192 0.14
193 0.11
194 0.09
195 0.14
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.25
203 0.3
204 0.31
205 0.35
206 0.38
207 0.4
208 0.42
209 0.41
210 0.38
211 0.36
212 0.36
213 0.36
214 0.35
215 0.34
216 0.32
217 0.32
218 0.33
219 0.29
220 0.26
221 0.23
222 0.26
223 0.29
224 0.3
225 0.31
226 0.28
227 0.26
228 0.24
229 0.32
230 0.37
231 0.39
232 0.44
233 0.49
234 0.51
235 0.52
236 0.53
237 0.48
238 0.47
239 0.46
240 0.47
241 0.45
242 0.43
243 0.44
244 0.46
245 0.52
246 0.53
247 0.54
248 0.55
249 0.52
250 0.56
251 0.56
252 0.52
253 0.42
254 0.34
255 0.29
256 0.2
257 0.19
258 0.12
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.14
271 0.18
272 0.21
273 0.25
274 0.3
275 0.4
276 0.47
277 0.57
278 0.63
279 0.69
280 0.76
281 0.81
282 0.82
283 0.82
284 0.81
285 0.81
286 0.82
287 0.81
288 0.73
289 0.68
290 0.64
291 0.57
292 0.52
293 0.49
294 0.4
295 0.35
296 0.37
297 0.36
298 0.36
299 0.33
300 0.33
301 0.26
302 0.24
303 0.23
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.13
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.11
332 0.11
333 0.14
334 0.2
335 0.23
336 0.28
337 0.33
338 0.37
339 0.4
340 0.47
341 0.49
342 0.48
343 0.54
344 0.51
345 0.53
346 0.48
347 0.42
348 0.34
349 0.28
350 0.25
351 0.16
352 0.14
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.13
360 0.2
361 0.27
362 0.31
363 0.34
364 0.44
365 0.52
366 0.61
367 0.66
368 0.67
369 0.72
370 0.76
371 0.8
372 0.81
373 0.76
374 0.71
375 0.66
376 0.64
377 0.56
378 0.53
379 0.49
380 0.42
381 0.42
382 0.36
383 0.32
384 0.27
385 0.25
386 0.2
387 0.17
388 0.14
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.14
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.19
413 0.19
414 0.17
415 0.13
416 0.09
417 0.09
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.12
423 0.13
424 0.16
425 0.16
426 0.21
427 0.25
428 0.28
429 0.33
430 0.36
431 0.44
432 0.51
433 0.56
434 0.59
435 0.63
436 0.66