FuNGI

A0A4S4MSJ6

Protein Details

Accession

A0A4S4MSJ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1195-1221	RAKLLKRASEWKKSPRFYKQMRHIDVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1200-1201	KR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR

Amino Acid Sequences

MIRRPFVAQRLRIWQQNTRKSPSAQDDIVNLAHPSKWDMIMLQEPWLDAKGKTRGNLFYHAVYPYNHNHLSNSAHRVRSVILINNNITSDSYDVLPVTSNDITAIRLRTDKGNVSLFNIYNDCTHNNTLATMERYLRDNPSISRPRPADHMLWFGDFNRHHALWDSPDNSHLFTPEQFIAPLIDLIHDYDMDMALPPGAPTICNSGGNWTRPDNVWKSSNAFDPFIACRVEHALRPANTDHYPIISILDFAVARTEPRVTRNFHDVDWKAFRDDLTARLDTLPTATPITDEDTFDSTVANLTRVIQETIGECVPERKPCPFSKRWWTAELTTARKAKNRASSRSYKFRHVPEHVSHGEYKQLNDSYATLLKNTKSEHWNEWLENITNEDVYTANRYVTSSPSDFCATRIPTLTYVDPAGTTCEAVTNADKCTILSKTFFPPPPDTPLLPDCAYPKPLLGLRFFRREIIRRTIGKLKPHKAPGPDGIPNIVLKRCTDTLIDHLFYVYKGAMEQGFYHSSWRTSLTIVLRKPGRSDYSVAKSYRPIGLLNTIGKVLTTMFTADMTYLAEHHQLIPPTQFGGRPGRSTTDALHRTVAFIKDAWSKNKVAAALCLDVQAAFPNTVKEVLLHNMRMRRVPTNYVRFVENKLTNRTTSLHFDDFTSDQIPTINGTTQGCPGAMEEYKYYNAGLVEIALPDDPHNTPQGFVDDVAMLTSASSLDECQRRLSTLMTQPNGGFDWSLTHNSPFELDKFVALYWKRVPSDPDPPPFIIHRPNPDGSTTPVTIKVVPSHKFLGVILDSKLNWKPHEAKAVASATWWTAQIARLGRVGGGIPAKYLRKLYLTVAVPRFSYGADVWWSPPHPSKTGNRSVGSVGVTKRLASAQRKAAITILGAMRTTAGDVLNAHANLLPVHLLLTRIVHRAVTRIATLPPLHPLYTLARRRPCLAKHKTNHAIHEAFNIASVKPAALETIQPVRRHPNFISAFTTHIARSKDDAMKEAVRQEHFCKIRLFSDGSGYKGKIGAAAILYIDDEWVKTLHYHLGTQDEHTVYEAEAVGLILTLHLLTQLTRSLHPRVFIGLDNQAVIRALSDNTPNPGHYLIDITHDMAEKLMLKEDKCRCRDEYDDAKQDGTPWVGNRRDVFELNIHWVPGHEGYKENEEVDIEAKKAAEGTSSSASLLPLSLRTKLPISVSAERQRFRAKLLKRASEWKKSPRFYKQMRHIDVEMPSRKYMKLVASLRCNQASIIVQLRTGHIPLNEHLHRIHRADSPDCPHCGPTYPEDVRHYLLQCPHYRDARTRLSNTLHRKAFSLPYLLSAPRAVAPLMRFIKSTHRFDSLLGDIAVDPPPPH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.64
3	0.7
4	0.71
5	0.69
6	0.7
7	0.66
8	0.7
9	0.69
10	0.65
11	0.57
12	0.52
13	0.46
14	0.43
15	0.41
16	0.34
17	0.26
18	0.2
19	0.18
20	0.17
21	0.18
22	0.17
23	0.17
24	0.17
25	0.17
26	0.2
27	0.25
28	0.25
29	0.24
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.23
34	0.21
35	0.16
36	0.22
37	0.28
38	0.31
39	0.34
40	0.38
41	0.44
42	0.46
43	0.52
44	0.48
45	0.43
46	0.42
47	0.41
48	0.38
49	0.32
50	0.33
51	0.32
52	0.36
53	0.36
54	0.33
55	0.33
56	0.34
57	0.39
58	0.4
59	0.44
60	0.43
61	0.42
62	0.42
63	0.42
64	0.39
65	0.39
66	0.37
67	0.35
68	0.34
69	0.37
70	0.39
71	0.39
72	0.38
73	0.32
74	0.28
75	0.23
76	0.18
77	0.14
78	0.13
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.12
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.14
88	0.14
89	0.15
90	0.18
91	0.2
92	0.17
93	0.2
94	0.22
95	0.25
96	0.3
97	0.33
98	0.34
99	0.38
100	0.36
101	0.38
102	0.42
103	0.38
104	0.37
105	0.33
106	0.29
107	0.25
108	0.27
109	0.25
110	0.24
111	0.25
112	0.23
113	0.23
114	0.22
115	0.22
116	0.24
117	0.24
118	0.22
119	0.23
120	0.23
121	0.25
122	0.28
123	0.3
124	0.29
125	0.29
126	0.29
127	0.37
128	0.45
129	0.44
130	0.5
131	0.48
132	0.47
133	0.5
134	0.52
135	0.46
136	0.41
137	0.45
138	0.38
139	0.38
140	0.36
141	0.31
142	0.34
143	0.29
144	0.29
145	0.3
146	0.28
147	0.27
148	0.28
149	0.3
150	0.28
151	0.35
152	0.34
153	0.28
154	0.31
155	0.32
156	0.31
157	0.29
158	0.24
159	0.19
160	0.17
161	0.21
162	0.19
163	0.19
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.15
168	0.15
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.14
189	0.16
190	0.17
191	0.18
192	0.24
193	0.3
194	0.33
195	0.35
196	0.31
197	0.31
198	0.32
199	0.39
200	0.36
201	0.36
202	0.36
203	0.35
204	0.37
205	0.37
206	0.42
207	0.38
208	0.35
209	0.3
210	0.3
211	0.29
212	0.27
213	0.25
214	0.18
215	0.16
216	0.21
217	0.22
218	0.21
219	0.25
220	0.3
221	0.3
222	0.34
223	0.34
224	0.34
225	0.33
226	0.34
227	0.29
228	0.23
229	0.23
230	0.19
231	0.19
232	0.14
233	0.13
234	0.1
235	0.12
236	0.1
237	0.09
238	0.11
239	0.09
240	0.09
241	0.11
242	0.14
243	0.14
244	0.19
245	0.25
246	0.27
247	0.31
248	0.38
249	0.39
250	0.36
251	0.44
252	0.4
253	0.42
254	0.44
255	0.41
256	0.35
257	0.34
258	0.33
259	0.28
260	0.28
261	0.25
262	0.24
263	0.23
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.18
268	0.19
269	0.16
270	0.12
271	0.12
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.16
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.17
280	0.17
281	0.17
282	0.16
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.11
287	0.09
288	0.1
289	0.12
290	0.14
291	0.15
292	0.12
293	0.13
294	0.13
295	0.16
296	0.15
297	0.12
298	0.11
299	0.15
300	0.17
301	0.22
302	0.24
303	0.26
304	0.32
305	0.39
306	0.48
307	0.49
308	0.55
309	0.6
310	0.67
311	0.66
312	0.64
313	0.61
314	0.54
315	0.56
316	0.55
317	0.49
318	0.46
319	0.47
320	0.45
321	0.46
322	0.48
323	0.47
324	0.5
325	0.53
326	0.54
327	0.57
328	0.65
329	0.67
330	0.74
331	0.71
332	0.69
333	0.67
334	0.66
335	0.67
336	0.62
337	0.62
338	0.55
339	0.6
340	0.53
341	0.5
342	0.44
343	0.36
344	0.37
345	0.31
346	0.28
347	0.26
348	0.25
349	0.22
350	0.22
351	0.22
352	0.19
353	0.21
354	0.21
355	0.17
356	0.19
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.25
361	0.26
362	0.3
363	0.33
364	0.36
365	0.39
366	0.36
367	0.36
368	0.34
369	0.3
370	0.26
371	0.24
372	0.18
373	0.14
374	0.13
375	0.12
376	0.09
377	0.09
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.12
384	0.14
385	0.18
386	0.16
387	0.16
388	0.18
389	0.2
390	0.19
391	0.2
392	0.24
393	0.21
394	0.22
395	0.23
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.24
400	0.18
401	0.17
402	0.15
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.1
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.12
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.15
419	0.15
420	0.14
421	0.15
422	0.17
423	0.2
424	0.27
425	0.3
426	0.31
427	0.35
428	0.36
429	0.41
430	0.42
431	0.38
432	0.35
433	0.33
434	0.33
435	0.28
436	0.27
437	0.22
438	0.21
439	0.23
440	0.19
441	0.17
442	0.16
443	0.18
444	0.2
445	0.21
446	0.27
447	0.29
448	0.35
449	0.36
450	0.37
451	0.39
452	0.42
453	0.44
454	0.45
455	0.47
456	0.43
457	0.48
458	0.53
459	0.52
460	0.56
461	0.59
462	0.57
463	0.57
464	0.61
465	0.61
466	0.55
467	0.55
468	0.51
469	0.48
470	0.45
471	0.39
472	0.33
473	0.29
474	0.27
475	0.25
476	0.21
477	0.15
478	0.12
479	0.16
480	0.15
481	0.16
482	0.16
483	0.15
484	0.2
485	0.23
486	0.23
487	0.19
488	0.19
489	0.18
490	0.16
491	0.16
492	0.1
493	0.06
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.1
500	0.12
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.16
507	0.13
508	0.12
509	0.16
510	0.2
511	0.25
512	0.25
513	0.3
514	0.31
515	0.31
516	0.32
517	0.32
518	0.29
519	0.26
520	0.28
521	0.28
522	0.32
523	0.37
524	0.36
525	0.33
526	0.31
527	0.31
528	0.3
529	0.25
530	0.19
531	0.15
532	0.17
533	0.19
534	0.18
535	0.16
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.11
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.12
565	0.19
566	0.19
567	0.2
568	0.21
569	0.23
570	0.24
571	0.25
572	0.24
573	0.26
574	0.27
575	0.26
576	0.27
577	0.24
578	0.23
579	0.24
580	0.23
581	0.14
582	0.12
583	0.14
584	0.19
585	0.22
586	0.24
587	0.24
588	0.24
589	0.25
590	0.26
591	0.25
592	0.18
593	0.17
594	0.17
595	0.15
596	0.14
597	0.13
598	0.11
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.11
612	0.13
613	0.14
614	0.17
615	0.2
616	0.21
617	0.22
618	0.23
619	0.24
620	0.24
621	0.29
622	0.34
623	0.38
624	0.4
625	0.39
626	0.39
627	0.36
628	0.36
629	0.37
630	0.34
631	0.3
632	0.32
633	0.33
634	0.31
635	0.31
636	0.3
637	0.26
638	0.25
639	0.25
640	0.22
641	0.2
642	0.2
643	0.21
644	0.2
645	0.18
646	0.15
647	0.1
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.09
660	0.08
661	0.08
662	0.09
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.1
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.09
671	0.08
672	0.08
673	0.07
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.06
682	0.06
683	0.07
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.11
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.06
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.03
700	0.03
701	0.03
702	0.04
703	0.08
704	0.1
705	0.11
706	0.13
707	0.14
708	0.14
709	0.15
710	0.16
711	0.17
712	0.22
713	0.27
714	0.26
715	0.27
716	0.26
717	0.26
718	0.25
719	0.2
720	0.13
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.12
725	0.11
726	0.11
727	0.12
728	0.12
729	0.13
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.11
734	0.1
735	0.1
736	0.1
737	0.14
738	0.13
739	0.16
740	0.16
741	0.2
742	0.21
743	0.22
744	0.26
745	0.25
746	0.34
747	0.37
748	0.37
749	0.36
750	0.36
751	0.37
752	0.34
753	0.33
754	0.3
755	0.28
756	0.3
757	0.31
758	0.31
759	0.31
760	0.31
761	0.29
762	0.26
763	0.27
764	0.22
765	0.19
766	0.18
767	0.18
768	0.18
769	0.17
770	0.19
771	0.2
772	0.21
773	0.23
774	0.24
775	0.24
776	0.23
777	0.22
778	0.2
779	0.16
780	0.15
781	0.13
782	0.12
783	0.12
784	0.15
785	0.19
786	0.18
787	0.17
788	0.2
789	0.25
790	0.27
791	0.35
792	0.33
793	0.29
794	0.33
795	0.34
796	0.29
797	0.24
798	0.21
799	0.13
800	0.14
801	0.13
802	0.08
803	0.07
804	0.08
805	0.12
806	0.13
807	0.14
808	0.14
809	0.14
810	0.13
811	0.13
812	0.12
813	0.1
814	0.1
815	0.09
816	0.08
817	0.11
818	0.12
819	0.13
820	0.14
821	0.13
822	0.14
823	0.15
824	0.16
825	0.21
826	0.22
827	0.27
828	0.29
829	0.29
830	0.27
831	0.26
832	0.24
833	0.17
834	0.16
835	0.1
836	0.09
837	0.1
838	0.11
839	0.11
840	0.13
841	0.14
842	0.15
843	0.2
844	0.21
845	0.22
846	0.26
847	0.32
848	0.38
849	0.47
850	0.5
851	0.45
852	0.44
853	0.42
854	0.4
855	0.34
856	0.3
857	0.21
858	0.19
859	0.19
860	0.17
861	0.17
862	0.17
863	0.22
864	0.23
865	0.29
866	0.31
867	0.36
868	0.37
869	0.36
870	0.35
871	0.29
872	0.24
873	0.21
874	0.16
875	0.11
876	0.11
877	0.1
878	0.09
879	0.09
880	0.09
881	0.06
882	0.05
883	0.05
884	0.06
885	0.07
886	0.1
887	0.1
888	0.1
889	0.1
890	0.1
891	0.1
892	0.1
893	0.09
894	0.05
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.09
900	0.11
901	0.12
902	0.12
903	0.13
904	0.13
905	0.15
906	0.16
907	0.15
908	0.14
909	0.14
910	0.15
911	0.17
912	0.18
913	0.16
914	0.19
915	0.19
916	0.18
917	0.17
918	0.19
919	0.2
920	0.29
921	0.35
922	0.38
923	0.42
924	0.43
925	0.47
926	0.52
927	0.54
928	0.55
929	0.58
930	0.61
931	0.61
932	0.7
933	0.76
934	0.73
935	0.69
936	0.65
937	0.58
938	0.48
939	0.45
940	0.36
941	0.26
942	0.24
943	0.21
944	0.14
945	0.13
946	0.12
947	0.09
948	0.08
949	0.08
950	0.07
951	0.07
952	0.08
953	0.1
954	0.18
955	0.23
956	0.23
957	0.26
958	0.34
959	0.36
960	0.41
961	0.38
962	0.4
963	0.39
964	0.41
965	0.43
966	0.35
967	0.35
968	0.3
969	0.31
970	0.21
971	0.23
972	0.22
973	0.18
974	0.2
975	0.25
976	0.28
977	0.28
978	0.29
979	0.29
980	0.3
981	0.3
982	0.32
983	0.31
984	0.28
985	0.31
986	0.31
987	0.36
988	0.35
989	0.37
990	0.35
991	0.32
992	0.32
993	0.33
994	0.33
995	0.24
996	0.31
997	0.3
998	0.3
999	0.31
1000	0.29
1001	0.26
1002	0.25
1003	0.24
1004	0.17
1005	0.15
1006	0.13
1007	0.1
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.06
1013	0.07
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.08
1021	0.12
1022	0.14
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.21
1026	0.21
1027	0.23
1028	0.26
1029	0.21
1030	0.2
1031	0.2
1032	0.19
1033	0.13
1034	0.14
1035	0.12
1036	0.08
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.06
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.03
1043	0.03
1044	0.03
1045	0.03
1046	0.03
1047	0.04
1048	0.04
1049	0.06
1050	0.1
1051	0.12
1052	0.14
1053	0.18
1054	0.24
1055	0.25
1056	0.26
1057	0.26
1058	0.24
1059	0.24
1060	0.23
1061	0.23
1062	0.21
1063	0.19
1064	0.19
1065	0.18
1066	0.16
1067	0.14
1068	0.12
1069	0.1
1070	0.07
1071	0.08
1072	0.09
1073	0.13
1074	0.14
1075	0.18
1076	0.19
1077	0.19
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.18
1081	0.15
1082	0.16
1083	0.13
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.16
1087	0.16
1088	0.16
1089	0.16
1090	0.13
1091	0.14
1092	0.12
1093	0.12
1094	0.17
1095	0.18
1096	0.19
1097	0.28
1098	0.37
1099	0.45
1100	0.46
1101	0.5
1102	0.47
1103	0.5
1104	0.54
1105	0.54
1106	0.56
1107	0.56
1108	0.6
1109	0.57
1110	0.54
1111	0.49
1112	0.46
1113	0.39
1114	0.31
1115	0.24
1116	0.2
1117	0.27
1118	0.29
1119	0.33
1120	0.33
1121	0.35
1122	0.37
1123	0.35
1124	0.34
1125	0.3
1126	0.29
1127	0.32
1128	0.31
1129	0.26
1130	0.22
1131	0.21
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.22
1135	0.17
1136	0.19
1137	0.21
1138	0.27
1139	0.28
1140	0.25
1141	0.21
1142	0.19
1143	0.19
1144	0.19
1145	0.18
1146	0.13
1147	0.13
1148	0.12
1149	0.12
1150	0.12
1151	0.11
1152	0.11
1153	0.1
1154	0.14
1155	0.16
1156	0.16
1157	0.17
1158	0.16
1159	0.16
1160	0.15
1161	0.14
1162	0.11
1163	0.13
1164	0.14
1165	0.17
1166	0.17
1167	0.2
1168	0.21
1169	0.23
1170	0.25
1171	0.26
1172	0.31
1173	0.35
1174	0.42
1175	0.49
1176	0.54
1177	0.52
1178	0.54
1179	0.55
1180	0.49
1181	0.49
1182	0.49
1183	0.46
1184	0.49
1185	0.58
1186	0.62
1187	0.59
1188	0.69
1189	0.72
1190	0.73
1191	0.76
1192	0.76
1193	0.77
1194	0.76
1195	0.8
1196	0.8
1197	0.82
1198	0.81
1199	0.83
1200	0.83
1201	0.84
1202	0.82
1203	0.79
1204	0.71
1205	0.66
1206	0.63
1207	0.61
1208	0.57
1209	0.5
1210	0.47
1211	0.44
1212	0.42
1213	0.38
1214	0.37
1215	0.32
1216	0.35
1217	0.38
1218	0.43
1219	0.49
1220	0.55
1221	0.59
1222	0.56
1223	0.51
1224	0.42
1225	0.39
1226	0.34
1227	0.3
1228	0.3
1229	0.25
1230	0.25
1231	0.25
1232	0.28
1233	0.26
1234	0.24
1235	0.23
1236	0.19
1237	0.21
1238	0.22
1239	0.3
1240	0.29
1241	0.29
1242	0.31
1243	0.33
1244	0.37
1245	0.36
1246	0.38
1247	0.34
1248	0.39
1249	0.4
1250	0.45
1251	0.47
1252	0.47
1253	0.48
1254	0.46
1255	0.42
1256	0.38
1257	0.39
1258	0.35
1259	0.33
1260	0.38
1261	0.38
1262	0.41
1263	0.44
1264	0.46
1265	0.44
1266	0.46
1267	0.43
1268	0.38
1269	0.41
1270	0.44
1271	0.46
1272	0.5
1273	0.54
1274	0.54
1275	0.57
1276	0.59
1277	0.61
1278	0.63
1279	0.65
1280	0.61
1281	0.61
1282	0.63
1283	0.68
1284	0.7
1285	0.71
1286	0.66
1287	0.58
1288	0.57
1289	0.55
1290	0.54
1291	0.48
1292	0.44
1293	0.35
1294	0.34
1295	0.37
1296	0.35
1297	0.32
1298	0.26
1299	0.24
1300	0.2
1301	0.21
1302	0.17
1303	0.17
1304	0.18
1305	0.26
1306	0.29
1307	0.29
1308	0.28
1309	0.28
1310	0.39
1311	0.43
1312	0.48
1313	0.44
1314	0.45
1315	0.44
1316	0.44
1317	0.49
1318	0.41
1319	0.37
1320	0.3
1321	0.27
1322	0.22
1323	0.23
1324	0.23

A0A4S4MSJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer