FuNGI

A0A4S4MCI2

Protein Details

Accession

A0A4S4MCI2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
198-220	DDVDPRRRPGRQPRQPHFPSRQT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
487-495	VKKRHARKL

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

SRLYAATPTSIAAGVFLPSIPIWGRNTQSANLAYTPNDFEILGACFRKEVEIFLHELNGIHTFKPDPFFYHAEDLFGSSDDSVDVVTGDSSVLNDTADEDPIPAPAFSRDPAPHLPVHGSPTPTMSPPPHGTQNAPTTINTSRPSAITRLLPSASMAPRAAAHSSSSRLAEMFSRTPPVIARQPDSGPPDDDGSDNGDDVDPRRRPGRQPRQPHFPSRQTGPQNAAGTPAPSSVKISEAHFDHKLKIEIVPTWNGDTTTLARWILRVNAISKKSPTVATQLGTIVPQRLTSDAETWYYSLRDHERVTCETGWQEIRDAIGNHFMNRAWVEKTRRQAMAVRFRDATHPRETPSQYFIRKQELLELVYEYSDAEIIAEVMAGAPHSWKTLLTPRLYQTTRSDLASEATRRTTHQTHTGPLKMNVEAYVVKGMTAPFILGNDFADHSRIVPVQNSLLPGMEDENGHTFSVSYADTSNTKTGLRQRRLELVKKRHARKLKDPYVRAQDRVVIPPKSSRLVPVTANFPPENACLYVEKIFNSPRNEDDVYAAPDTLITKLHPFLHVSNFSDSTLTLEKGQAFSTERYNHINAHAQLIRRLASPTFSASTPIATDINTTRSETSILNTAGLHASELEDDLDAEEPLEGGPKTSEAPPEDTSTADFLQTVDVSEEVTGDRRTHLLGILERNIKAFSLDGRLGTTDATCTIPLRPGSKEVSLPPFPGSPAKREVMDKQMDTWIRLEVIEPSKSPWGAPGFIVYRNGKPRMVIDYRKLNEMTVPDEFPLPKQEDIMNALSGAQWLSTMDALSGFTQVVIQEDDRPKTAFRTHRGLHQFRRMPFGLRNGPSIFQRIMQNVLAPYLWIYALVYIDDIVIYSKTFDEHVEHVDRVLTAVADAGITLSPAKCHFAYRSLMLLGQKVSRLGLSTHKDKVDAIIQLAEPKNLHELQTFLAPLFQLQRKDTNWDWTAVHQEAFDLCKQVLTQAPIRAHPIQGLPYRVYTDACDYGLAAILQQVQPIQVKDLRVAEVSKNSSDVPKPGIWANSFEDTTVHIERVIAYWSRILKSPERNYSPTEREALALKEGDQINDPLKNAFSELGERFEEKLLSVASKYANSLSSSDNPEEVLSIPIAPVEDHQAATPTLSYVASTHSSLVVGLSDGEIKRWKQGYDKDDEFTKVLKILNSADDKSQETYSHYFRSEDGLLYFEDWNGASRLCVPQSLQTEIMSESHNVITEGAHAGYHRTYNRLASTYYWPRMSRDIRRITKTNCHSFPTLRSNKLTKYGIFIPTTTNVTEKETAELFFKHVVTQYGLPRQVITDRDTRWRNDFWKQLCTNMGMKSLYALTSTLSETTGVTTSTP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.08
6	0.11
7	0.11
8	0.14
9	0.17
10	0.22
11	0.25
12	0.3
13	0.34
14	0.33
15	0.39
16	0.37
17	0.36
18	0.33
19	0.32
20	0.27
21	0.26
22	0.28
23	0.23
24	0.21
25	0.18
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.19
30	0.17
31	0.16
32	0.16
33	0.16
34	0.2
35	0.18
36	0.18
37	0.18
38	0.2
39	0.23
40	0.23
41	0.24
42	0.21
43	0.21
44	0.2
45	0.21
46	0.19
47	0.16
48	0.17
49	0.18
50	0.21
51	0.25
52	0.25
53	0.24
54	0.29
55	0.32
56	0.34
57	0.39
58	0.36
59	0.34
60	0.32
61	0.3
62	0.25
63	0.22
64	0.18
65	0.11
66	0.11
67	0.09
68	0.09
69	0.07
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.06
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.13
89	0.14
90	0.11
91	0.11
92	0.13
93	0.15
94	0.14
95	0.21
96	0.21
97	0.25
98	0.3
99	0.33
100	0.31
101	0.32
102	0.35
103	0.3
104	0.35
105	0.34
106	0.31
107	0.28
108	0.31
109	0.31
110	0.28
111	0.31
112	0.27
113	0.31
114	0.33
115	0.38
116	0.41
117	0.41
118	0.43
119	0.45
120	0.49
121	0.47
122	0.44
123	0.39
124	0.36
125	0.36
126	0.39
127	0.34
128	0.3
129	0.27
130	0.27
131	0.3
132	0.28
133	0.3
134	0.29
135	0.3
136	0.31
137	0.29
138	0.28
139	0.26
140	0.3
141	0.28
142	0.26
143	0.23
144	0.2
145	0.21
146	0.23
147	0.23
148	0.17
149	0.19
150	0.19
151	0.22
152	0.24
153	0.23
154	0.21
155	0.2
156	0.2
157	0.2
158	0.22
159	0.22
160	0.21
161	0.24
162	0.24
163	0.25
164	0.25
165	0.28
166	0.3
167	0.32
168	0.33
169	0.33
170	0.35
171	0.4
172	0.44
173	0.4
174	0.35
175	0.32
176	0.31
177	0.28
178	0.26
179	0.21
180	0.2
181	0.18
182	0.16
183	0.15
184	0.13
185	0.13
186	0.15
187	0.23
188	0.21
189	0.24
190	0.29
191	0.32
192	0.41
193	0.52
194	0.61
195	0.62
196	0.71
197	0.76
198	0.82
199	0.84
200	0.84
201	0.82
202	0.79
203	0.74
204	0.69
205	0.71
206	0.66
207	0.64
208	0.59
209	0.57
210	0.51
211	0.45
212	0.42
213	0.33
214	0.28
215	0.24
216	0.22
217	0.16
218	0.15
219	0.17
220	0.15
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.21
225	0.22
226	0.27
227	0.3
228	0.31
229	0.31
230	0.34
231	0.34
232	0.3
233	0.29
234	0.27
235	0.25
236	0.27
237	0.28
238	0.25
239	0.25
240	0.25
241	0.23
242	0.21
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.18
247	0.16
248	0.15
249	0.16
250	0.17
251	0.18
252	0.18
253	0.18
254	0.2
255	0.27
256	0.3
257	0.33
258	0.33
259	0.33
260	0.33
261	0.32
262	0.3
263	0.28
264	0.28
265	0.25
266	0.25
267	0.23
268	0.21
269	0.2
270	0.2
271	0.16
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.13
276	0.15
277	0.16
278	0.17
279	0.16
280	0.18
281	0.18
282	0.17
283	0.17
284	0.15
285	0.14
286	0.17
287	0.19
288	0.22
289	0.23
290	0.28
291	0.31
292	0.33
293	0.37
294	0.33
295	0.3
296	0.27
297	0.29
298	0.26
299	0.22
300	0.21
301	0.17
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.16
306	0.22
307	0.22
308	0.21
309	0.22
310	0.21
311	0.2
312	0.2
313	0.21
314	0.16
315	0.22
316	0.29
317	0.33
318	0.41
319	0.45
320	0.45
321	0.45
322	0.49
323	0.51
324	0.55
325	0.53
326	0.49
327	0.44
328	0.44
329	0.49
330	0.47
331	0.42
332	0.37
333	0.36
334	0.35
335	0.41
336	0.44
337	0.39
338	0.4
339	0.43
340	0.41
341	0.44
342	0.45
343	0.45
344	0.43
345	0.4
346	0.42
347	0.38
348	0.34
349	0.29
350	0.27
351	0.2
352	0.18
353	0.18
354	0.11
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.09
374	0.17
375	0.23
376	0.25
377	0.29
378	0.31
379	0.39
380	0.4
381	0.4
382	0.36
383	0.37
384	0.36
385	0.33
386	0.31
387	0.23
388	0.25
389	0.27
390	0.25
391	0.2
392	0.21
393	0.21
394	0.22
395	0.27
396	0.28
397	0.26
398	0.34
399	0.34
400	0.37
401	0.42
402	0.45
403	0.43
404	0.42
405	0.41
406	0.32
407	0.3
408	0.25
409	0.21
410	0.16
411	0.14
412	0.14
413	0.11
414	0.1
415	0.11
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.09
452	0.08
453	0.1
454	0.09
455	0.07
456	0.07
457	0.08
458	0.1
459	0.12
460	0.13
461	0.12
462	0.12
463	0.15
464	0.23
465	0.32
466	0.37
467	0.4
468	0.42
469	0.5
470	0.56
471	0.62
472	0.62
473	0.62
474	0.66
475	0.7
476	0.73
477	0.72
478	0.75
479	0.73
480	0.74
481	0.75
482	0.76
483	0.76
484	0.73
485	0.71
486	0.74
487	0.69
488	0.6
489	0.5
490	0.45
491	0.38
492	0.41
493	0.4
494	0.3
495	0.29
496	0.31
497	0.32
498	0.29
499	0.27
500	0.24
501	0.21
502	0.22
503	0.24
504	0.22
505	0.24
506	0.23
507	0.27
508	0.24
509	0.21
510	0.2
511	0.18
512	0.18
513	0.14
514	0.14
515	0.11
516	0.13
517	0.16
518	0.15
519	0.15
520	0.16
521	0.19
522	0.23
523	0.25
524	0.25
525	0.24
526	0.28
527	0.28
528	0.26
529	0.25
530	0.22
531	0.21
532	0.2
533	0.18
534	0.13
535	0.12
536	0.12
537	0.1
538	0.09
539	0.06
540	0.07
541	0.1
542	0.11
543	0.12
544	0.13
545	0.15
546	0.19
547	0.22
548	0.22
549	0.23
550	0.23
551	0.22
552	0.2
553	0.18
554	0.15
555	0.14
556	0.13
557	0.11
558	0.12
559	0.12
560	0.12
561	0.13
562	0.12
563	0.12
564	0.13
565	0.18
566	0.19
567	0.2
568	0.23
569	0.24
570	0.23
571	0.23
572	0.28
573	0.22
574	0.25
575	0.26
576	0.23
577	0.24
578	0.24
579	0.22
580	0.17
581	0.18
582	0.13
583	0.12
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.13
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.12
593	0.1
594	0.08
595	0.09
596	0.08
597	0.11
598	0.12
599	0.12
600	0.11
601	0.12
602	0.13
603	0.12
604	0.12
605	0.14
606	0.13
607	0.13
608	0.12
609	0.12
610	0.11
611	0.11
612	0.1
613	0.05
614	0.05
615	0.04
616	0.05
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.05
631	0.05
632	0.07
633	0.08
634	0.11
635	0.1
636	0.15
637	0.16
638	0.18
639	0.18
640	0.17
641	0.17
642	0.16
643	0.15
644	0.11
645	0.09
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.05
655	0.04
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.07
660	0.07
661	0.08
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.11
666	0.13
667	0.16
668	0.18
669	0.18
670	0.18
671	0.17
672	0.15
673	0.13
674	0.11
675	0.07
676	0.09
677	0.1
678	0.09
679	0.1
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.09
684	0.05
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.1
691	0.11
692	0.13
693	0.13
694	0.15
695	0.18
696	0.19
697	0.2
698	0.2
699	0.24
700	0.23
701	0.23
702	0.21
703	0.19
704	0.19
705	0.23
706	0.22
707	0.18
708	0.21
709	0.21
710	0.21
711	0.23
712	0.25
713	0.27
714	0.29
715	0.26
716	0.24
717	0.28
718	0.27
719	0.26
720	0.24
721	0.17
722	0.14
723	0.13
724	0.12
725	0.11
726	0.14
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.16
731	0.16
732	0.16
733	0.15
734	0.14
735	0.13
736	0.13
737	0.15
738	0.15
739	0.16
740	0.2
741	0.18
742	0.21
743	0.26
744	0.28
745	0.25
746	0.24
747	0.24
748	0.27
749	0.31
750	0.31
751	0.31
752	0.38
753	0.39
754	0.41
755	0.39
756	0.32
757	0.28
758	0.26
759	0.24
760	0.16
761	0.15
762	0.13
763	0.14
764	0.14
765	0.13
766	0.16
767	0.15
768	0.13
769	0.14
770	0.15
771	0.15
772	0.18
773	0.19
774	0.15
775	0.12
776	0.12
777	0.11
778	0.1
779	0.09
780	0.05
781	0.03
782	0.03
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.05
789	0.05
790	0.06
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.12
799	0.15
800	0.17
801	0.18
802	0.19
803	0.18
804	0.2
805	0.27
806	0.27
807	0.29
808	0.36
809	0.36
810	0.44
811	0.52
812	0.56
813	0.55
814	0.59
815	0.6
816	0.53
817	0.58
818	0.51
819	0.45
820	0.41
821	0.43
822	0.41
823	0.36
824	0.39
825	0.33
826	0.34
827	0.31
828	0.31
829	0.24
830	0.19
831	0.21
832	0.18
833	0.2
834	0.18
835	0.19
836	0.16
837	0.16
838	0.13
839	0.1
840	0.09
841	0.07
842	0.07
843	0.05
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.05
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.04
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.06
860	0.07
861	0.09
862	0.11
863	0.15
864	0.17
865	0.17
866	0.17
867	0.17
868	0.16
869	0.14
870	0.12
871	0.08
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.04
876	0.04
877	0.04
878	0.03
879	0.04
880	0.04
881	0.04
882	0.05
883	0.06
884	0.09
885	0.09
886	0.12
887	0.13
888	0.17
889	0.2
890	0.2
891	0.22
892	0.2
893	0.21
894	0.2
895	0.2
896	0.17
897	0.15
898	0.14
899	0.13
900	0.12
901	0.1
902	0.11
903	0.1
904	0.17
905	0.21
906	0.25
907	0.29
908	0.29
909	0.29
910	0.28
911	0.29
912	0.26
913	0.22
914	0.18
915	0.16
916	0.15
917	0.21
918	0.21
919	0.2
920	0.16
921	0.16
922	0.19
923	0.18
924	0.19
925	0.14
926	0.14
927	0.14
928	0.17
929	0.16
930	0.11
931	0.11
932	0.1
933	0.1
934	0.15
935	0.17
936	0.17
937	0.19
938	0.25
939	0.25
940	0.32
941	0.33
942	0.36
943	0.33
944	0.33
945	0.32
946	0.28
947	0.33
948	0.28
949	0.26
950	0.18
951	0.17
952	0.15
953	0.17
954	0.16
955	0.12
956	0.11
957	0.11
958	0.11
959	0.13
960	0.15
961	0.16
962	0.2
963	0.24
964	0.26
965	0.26
966	0.31
967	0.31
968	0.28
969	0.26
970	0.24
971	0.24
972	0.26
973	0.28
974	0.24
975	0.24
976	0.25
977	0.24
978	0.23
979	0.18
980	0.19
981	0.18
982	0.17
983	0.15
984	0.13
985	0.13
986	0.13
987	0.11
988	0.07
989	0.06
990	0.08
991	0.08
992	0.09
993	0.09
994	0.09
995	0.12
996	0.12
997	0.15
998	0.15
999	0.16
1000	0.18
1001	0.2
1002	0.2
1003	0.19
1004	0.21
1005	0.2
1006	0.24
1007	0.26
1008	0.23
1009	0.23
1010	0.22
1011	0.25
1012	0.24
1013	0.24
1014	0.22
1015	0.2
1016	0.22
1017	0.23
1018	0.27
1019	0.24
1020	0.26
1021	0.27
1022	0.26
1023	0.25
1024	0.24
1025	0.21
1026	0.19
1027	0.23
1028	0.2
1029	0.17
1030	0.13
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.14
1038	0.17
1039	0.18
1040	0.21
1041	0.24
1042	0.29
1043	0.38
1044	0.46
1045	0.51
1046	0.55
1047	0.56
1048	0.58
1049	0.62
1050	0.6
1051	0.53
1052	0.47
1053	0.38
1054	0.33
1055	0.33
1056	0.3
1057	0.25
1058	0.2
1059	0.18
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.2
1063	0.19
1064	0.2
1065	0.2
1066	0.21
1067	0.21
1068	0.16
1069	0.16
1070	0.16
1071	0.15
1072	0.14
1073	0.12
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.19
1077	0.2
1078	0.21
1079	0.21
1080	0.21
1081	0.2
1082	0.15
1083	0.16
1084	0.13
1085	0.13
1086	0.12
1087	0.13
1088	0.14
1089	0.14
1090	0.15
1091	0.14
1092	0.15
1093	0.16
1094	0.17
1095	0.19
1096	0.23
1097	0.27
1098	0.27
1099	0.25
1100	0.24
1101	0.23
1102	0.22
1103	0.18
1104	0.14
1105	0.1
1106	0.09
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.12
1113	0.13
1114	0.13
1115	0.13
1116	0.15
1117	0.14
1118	0.15
1119	0.14
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.09
1123	0.09
1124	0.08
1125	0.11
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.12
1130	0.13
1131	0.12
1132	0.12
1133	0.09
1134	0.07
1135	0.06
1136	0.06
1137	0.1
1138	0.1
1139	0.13
1140	0.17
1141	0.18
1142	0.24
1143	0.27
1144	0.28
1145	0.32
1146	0.41
1147	0.45
1148	0.49
1149	0.52
1150	0.48
1151	0.48
1152	0.49
1153	0.42
1154	0.35
1155	0.3
1156	0.24
1157	0.23
1158	0.21
1159	0.2
1160	0.2
1161	0.25
1162	0.29
1163	0.29
1164	0.29
1165	0.29
1166	0.3
1167	0.3
1168	0.3
1169	0.24
1170	0.25
1171	0.28
1172	0.3
1173	0.32
1174	0.31
1175	0.29
1176	0.28
1177	0.32
1178	0.29
1179	0.26
1180	0.22
1181	0.19
1182	0.18
1183	0.19
1184	0.19
1185	0.13
1186	0.13
1187	0.11
1188	0.12
1189	0.12
1190	0.11
1191	0.1
1192	0.12
1193	0.16
1194	0.16
1195	0.18
1196	0.17
1197	0.23
1198	0.27
1199	0.31
1200	0.29
1201	0.25
1202	0.26
1203	0.25
1204	0.26
1205	0.2
1206	0.17
1207	0.16
1208	0.15
1209	0.15
1210	0.14
1211	0.13
1212	0.12
1213	0.12
1214	0.13
1215	0.11
1216	0.1
1217	0.1
1218	0.12
1219	0.13
1220	0.19
1221	0.19
1222	0.2
1223	0.22
1224	0.27
1225	0.31
1226	0.31
1227	0.3
1228	0.29
1229	0.37
1230	0.43
1231	0.46
1232	0.47
1233	0.44
1234	0.45
1235	0.53
1236	0.58
1237	0.58
1238	0.59
1239	0.64
1240	0.67
1241	0.73
1242	0.78
1243	0.76
1244	0.78
1245	0.77
1246	0.77
1247	0.71
1248	0.67
1249	0.64
1250	0.6
1251	0.62
1252	0.62
1253	0.61
1254	0.57
1255	0.59
1256	0.6
1257	0.6
1258	0.64
1259	0.61
1260	0.5
1261	0.49
1262	0.49
1263	0.49
1264	0.45
1265	0.4
1266	0.36
1267	0.35
1268	0.37
1269	0.31
1270	0.27
1271	0.22
1272	0.26
1273	0.29
1274	0.26
1275	0.26
1276	0.24
1277	0.24
1278	0.25
1279	0.25
1280	0.22
1281	0.22
1282	0.22
1283	0.2
1284	0.21
1285	0.23
1286	0.24
1287	0.28
1288	0.33
1289	0.37
1290	0.4
1291	0.38
1292	0.36
1293	0.36
1294	0.37
1295	0.35
1296	0.32
1297	0.31
1298	0.32
1299	0.42
1300	0.47
1301	0.49
1302	0.5
1303	0.54
1304	0.56
1305	0.57
1306	0.63
1307	0.58
1308	0.63
1309	0.6
1310	0.59
1311	0.55
1312	0.53
1313	0.49
1314	0.42
1315	0.43
1316	0.33
1317	0.31
1318	0.29
1319	0.26
1320	0.22
1321	0.19
1322	0.16
1323	0.12
1324	0.13
1325	0.15
1326	0.13
1327	0.12
1328	0.12
1329	0.12
1330	0.14
1331	0.14

A0A4S4MCI2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer