Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N3W0

Protein Details
Accession A0A4S4N3W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-167MICPDMKKAKRKKTAEGAVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-96TKKLHKTIKKASKARQVKRGVKEIQKGIRKGEK
155-160KAKRKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.333, cyto 11, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
Amino Acid Sequences MAKSEKKEKKAKEVTEPVEEADVEMVEGEVAKVEKKIKKERERVVVTLEDLSPIAQPLAQHKLTKKLHKTIKKASKARQVKRGVKEIQKGIRKGEKGLLVLAADITPIDITSHLPVMSEDANMPYVFVTSKEELGHASGTKRPTSCVMICPDMKKAKRKKTAEGAVEKGDDDLDFKELYDQCCEEVKKLDQKVVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.72
3 0.66
4 0.56
5 0.48
6 0.41
7 0.31
8 0.21
9 0.16
10 0.09
11 0.08
12 0.06
13 0.04
14 0.05
15 0.04
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.09
20 0.16
21 0.2
22 0.28
23 0.39
24 0.48
25 0.58
26 0.68
27 0.73
28 0.77
29 0.78
30 0.72
31 0.66
32 0.58
33 0.48
34 0.41
35 0.32
36 0.22
37 0.17
38 0.15
39 0.11
40 0.09
41 0.08
42 0.06
43 0.07
44 0.1
45 0.16
46 0.18
47 0.21
48 0.22
49 0.32
50 0.38
51 0.46
52 0.49
53 0.52
54 0.59
55 0.65
56 0.71
57 0.71
58 0.75
59 0.76
60 0.77
61 0.76
62 0.77
63 0.79
64 0.77
65 0.76
66 0.76
67 0.74
68 0.72
69 0.72
70 0.68
71 0.64
72 0.64
73 0.61
74 0.58
75 0.56
76 0.52
77 0.48
78 0.47
79 0.42
80 0.38
81 0.35
82 0.3
83 0.24
84 0.23
85 0.19
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.07
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.17
127 0.2
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.27
132 0.27
133 0.28
134 0.3
135 0.33
136 0.35
137 0.35
138 0.39
139 0.42
140 0.46
141 0.5
142 0.56
143 0.61
144 0.69
145 0.72
146 0.74
147 0.76
148 0.8
149 0.79
150 0.77
151 0.71
152 0.64
153 0.59
154 0.5
155 0.4
156 0.31
157 0.22
158 0.16
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.16
164 0.18
165 0.21
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.3
170 0.31
171 0.27
172 0.31
173 0.36
174 0.41
175 0.43