Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N5C6

Protein Details
Accession A0A4S4N5C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-68APLGSSTKNKKARAPPKKPGSKKGGKSKKDVDNASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-62SSTKNKKARAPPKKPGSKKGGKSKK
553-553K
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, pero 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR004036  Endonuclease-III-like_CS2  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR044298  MIG/MutY  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01155  ENDONUCLEASE_III_2  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MKRKLSVSSEEWDGSDSDPDDAYKPKAVAGSSRAPLGSSTKNKKARAPPKKPGSKKGGKSKKDVDNASEDDVEEGRDVPHAASMHTVTHAKDTRKALLAWYDTIHEVRGMPWRKPFNDSWNEEERAQRAYEVWISEIMLQQTQVVTVIPYYNKWMSKFPTIEDLAESDIDTVNSLWKGLGYYSRAARILQGAQKAVKELGGRLPDNAIDMESKIPGIGRYSAGAICSIAYNQCVPVVDGNVNRLLSRFLAFYTPPKAKQALDVLWAGAAAMVEGADRPGDTNQALIELGATVCKVHDPLCDTCPVQQWCRAHARQRANEEVQPEAHASSSEQQLPDIEDLCTLCRPLPVPTLVTLYPMKVERKKAREELDVVSVIEWRAAVDEEDRWFLLVRRPQGGLLAGLHEFPTIPDVSVATPDSMTDFAQSSLRQLLVHPPPPPSPAVRSPTRHSDIQASIPEDNPRIVKAKPAGDVLHIFSHIKKTYRVQWVLLVGGSGGRGEEERVIAGQYSVSGDPPPAALPPTLHTSPHPYAKGHAAKRTGIAKSKEGTALAVKKKKLIAADSVQGSSTRLEAMWVRMDDVPKANIGTGVLKVWKQVRTLWDSEFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.19
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.17
8 0.19
9 0.21
10 0.22
11 0.21
12 0.22
13 0.25
14 0.25
15 0.27
16 0.3
17 0.35
18 0.32
19 0.35
20 0.32
21 0.3
22 0.31
23 0.31
24 0.34
25 0.36
26 0.44
27 0.51
28 0.59
29 0.63
30 0.7
31 0.76
32 0.77
33 0.79
34 0.8
35 0.81
36 0.84
37 0.91
38 0.91
39 0.89
40 0.89
41 0.88
42 0.87
43 0.88
44 0.87
45 0.83
46 0.83
47 0.83
48 0.82
49 0.8
50 0.75
51 0.68
52 0.65
53 0.62
54 0.56
55 0.48
56 0.38
57 0.31
58 0.27
59 0.23
60 0.16
61 0.13
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.13
67 0.12
68 0.12
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.19
74 0.16
75 0.24
76 0.29
77 0.29
78 0.35
79 0.38
80 0.4
81 0.42
82 0.42
83 0.37
84 0.38
85 0.38
86 0.33
87 0.3
88 0.27
89 0.24
90 0.24
91 0.22
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.21
96 0.23
97 0.25
98 0.33
99 0.4
100 0.41
101 0.47
102 0.49
103 0.5
104 0.56
105 0.57
106 0.55
107 0.55
108 0.56
109 0.52
110 0.5
111 0.42
112 0.35
113 0.31
114 0.25
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.15
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.15
138 0.19
139 0.21
140 0.23
141 0.27
142 0.29
143 0.36
144 0.37
145 0.33
146 0.36
147 0.35
148 0.33
149 0.29
150 0.26
151 0.19
152 0.18
153 0.17
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.17
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.22
176 0.22
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.24
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.14
186 0.17
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.2
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.12
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.17
240 0.2
241 0.2
242 0.22
243 0.23
244 0.22
245 0.25
246 0.26
247 0.22
248 0.22
249 0.21
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.12
254 0.07
255 0.06
256 0.03
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.1
285 0.12
286 0.14
287 0.16
288 0.16
289 0.18
290 0.24
291 0.25
292 0.22
293 0.25
294 0.25
295 0.27
296 0.34
297 0.35
298 0.36
299 0.42
300 0.49
301 0.5
302 0.53
303 0.55
304 0.5
305 0.49
306 0.43
307 0.36
308 0.28
309 0.23
310 0.19
311 0.13
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.16
340 0.18
341 0.17
342 0.14
343 0.14
344 0.17
345 0.21
346 0.22
347 0.31
348 0.36
349 0.41
350 0.47
351 0.51
352 0.53
353 0.52
354 0.51
355 0.45
356 0.4
357 0.35
358 0.29
359 0.23
360 0.19
361 0.15
362 0.11
363 0.09
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.16
377 0.18
378 0.2
379 0.22
380 0.22
381 0.22
382 0.23
383 0.22
384 0.17
385 0.14
386 0.13
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.13
415 0.12
416 0.12
417 0.19
418 0.24
419 0.28
420 0.29
421 0.31
422 0.32
423 0.34
424 0.35
425 0.29
426 0.29
427 0.32
428 0.36
429 0.39
430 0.43
431 0.45
432 0.52
433 0.54
434 0.5
435 0.44
436 0.45
437 0.4
438 0.4
439 0.39
440 0.33
441 0.3
442 0.3
443 0.31
444 0.26
445 0.25
446 0.21
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.22
451 0.25
452 0.28
453 0.28
454 0.31
455 0.3
456 0.3
457 0.32
458 0.29
459 0.25
460 0.22
461 0.2
462 0.18
463 0.24
464 0.25
465 0.25
466 0.26
467 0.3
468 0.38
469 0.47
470 0.48
471 0.43
472 0.44
473 0.43
474 0.4
475 0.35
476 0.26
477 0.16
478 0.14
479 0.12
480 0.07
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.11
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.14
507 0.21
508 0.21
509 0.22
510 0.23
511 0.29
512 0.34
513 0.4
514 0.4
515 0.34
516 0.36
517 0.45
518 0.52
519 0.49
520 0.51
521 0.48
522 0.47
523 0.51
524 0.55
525 0.51
526 0.5
527 0.48
528 0.46
529 0.45
530 0.47
531 0.44
532 0.37
533 0.34
534 0.34
535 0.38
536 0.42
537 0.47
538 0.44
539 0.47
540 0.49
541 0.5
542 0.47
543 0.42
544 0.41
545 0.39
546 0.45
547 0.43
548 0.41
549 0.39
550 0.34
551 0.31
552 0.24
553 0.19
554 0.13
555 0.1
556 0.12
557 0.13
558 0.17
559 0.23
560 0.22
561 0.24
562 0.27
563 0.28
564 0.29
565 0.31
566 0.28
567 0.23
568 0.24
569 0.21
570 0.19
571 0.19
572 0.18
573 0.15
574 0.17
575 0.19
576 0.19
577 0.24
578 0.29
579 0.31
580 0.3
581 0.34
582 0.39
583 0.43
584 0.46