Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FRC3

Protein Details
Accession C5FRC3    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-194MANRWHPKEKRKVRRSLEIYHydrophilic
447-469AHITGRRHKRAIKSAINKQRREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-186KEKRK
452-462RRHKRAIKSAI
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MASPNPPTKPLIAVVGATGTGKSKLAVDLAVRFNGEIINADAMQMYKGLPITTNQIPIEERHGIPHHLIGCVDLDQNPWRIGVFKRESLKIIDEIRSRGKVPILVGGTHYYTQSVLFHEPLLDEGVSGDETSKQSEQLQNNEISTTDSSNAVDFSILDATPEEVYQKLKEVDPVMANRWHPKEKRKVRRSLEIYLQTGRPASEIYEEQKRKIRQVGTQDDGPHGEELEDSDSQLGQARFPLLVFWVYTEKEELRKRLDKRVHGMINQGLLQEAQKMFKYLQDKTSEGVEVDRTRGIWMSIGFKELEPYINELLLSKGESSSELDKVKDECIESIQSATKVYAKHQTRWIKRKLWKALGTAGMTDRLYIVDSTNVDEWDTVVRQPAEDITSKFLSGNTPPHPKDTSEAANEFFASVDVPAPFEVDDIPQMRLCPVCNTTMTGTDTWSAHITGRRHKRAIKSAINKQRREEYFRKLREESNNAPSTES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.18
4 0.15
5 0.13
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.22
16 0.25
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.17
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.09
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.17
39 0.2
40 0.25
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.31
46 0.3
47 0.27
48 0.28
49 0.3
50 0.3
51 0.3
52 0.33
53 0.28
54 0.24
55 0.24
56 0.18
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.27
70 0.29
71 0.32
72 0.37
73 0.39
74 0.41
75 0.41
76 0.42
77 0.37
78 0.36
79 0.36
80 0.34
81 0.36
82 0.39
83 0.38
84 0.36
85 0.34
86 0.32
87 0.28
88 0.26
89 0.28
90 0.25
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.23
95 0.21
96 0.2
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.24
123 0.27
124 0.3
125 0.33
126 0.32
127 0.32
128 0.31
129 0.27
130 0.23
131 0.2
132 0.16
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.16
157 0.16
158 0.18
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.24
163 0.25
164 0.28
165 0.31
166 0.36
167 0.38
168 0.45
169 0.53
170 0.6
171 0.7
172 0.73
173 0.79
174 0.77
175 0.83
176 0.8
177 0.74
178 0.72
179 0.66
180 0.59
181 0.51
182 0.45
183 0.36
184 0.3
185 0.24
186 0.16
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.13
192 0.22
193 0.23
194 0.25
195 0.32
196 0.33
197 0.34
198 0.38
199 0.38
200 0.34
201 0.42
202 0.47
203 0.43
204 0.45
205 0.42
206 0.37
207 0.34
208 0.3
209 0.21
210 0.14
211 0.1
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.16
238 0.19
239 0.21
240 0.25
241 0.32
242 0.35
243 0.43
244 0.49
245 0.47
246 0.49
247 0.55
248 0.52
249 0.46
250 0.46
251 0.38
252 0.33
253 0.29
254 0.24
255 0.15
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.14
265 0.18
266 0.17
267 0.22
268 0.25
269 0.25
270 0.25
271 0.27
272 0.23
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.13
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.1
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.1
307 0.11
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.17
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.16
328 0.24
329 0.26
330 0.3
331 0.39
332 0.48
333 0.55
334 0.64
335 0.7
336 0.7
337 0.74
338 0.79
339 0.79
340 0.79
341 0.74
342 0.68
343 0.65
344 0.61
345 0.54
346 0.46
347 0.37
348 0.3
349 0.25
350 0.21
351 0.16
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.21
378 0.21
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.26
383 0.28
384 0.36
385 0.37
386 0.42
387 0.43
388 0.41
389 0.41
390 0.4
391 0.39
392 0.36
393 0.37
394 0.33
395 0.32
396 0.31
397 0.27
398 0.21
399 0.15
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.13
412 0.14
413 0.16
414 0.16
415 0.17
416 0.18
417 0.19
418 0.19
419 0.2
420 0.2
421 0.22
422 0.22
423 0.25
424 0.25
425 0.29
426 0.3
427 0.25
428 0.25
429 0.25
430 0.24
431 0.22
432 0.22
433 0.18
434 0.19
435 0.24
436 0.28
437 0.35
438 0.46
439 0.52
440 0.57
441 0.63
442 0.69
443 0.73
444 0.78
445 0.79
446 0.78
447 0.8
448 0.85
449 0.88
450 0.83
451 0.78
452 0.78
453 0.74
454 0.73
455 0.7
456 0.69
457 0.7
458 0.73
459 0.75
460 0.69
461 0.7
462 0.71
463 0.73
464 0.69
465 0.69
466 0.67