Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FRB1

Protein Details
Accession C5FRB1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-428AEEQKKYLAKEKEREQKREMKRQTRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-428KRMKRADLDEKAEERKTAAEKIKKEERDRLLRSMSAEEQKKYLAKEKEREQKREMKRQTRKG
Subcellular Location(s) plas 14, nucl 4, cyto 3, E.R. 3, vacu 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MDGFKALFGGKATGAPQKADGGFADFAPPSATGSGPQTTAVSSVPYTKWYRVWERTSPQDFIQEAFIIPFIIIIAILHMWGAGKNRRKAKTWAQANIPVLCDEFAVVGYNGVPHNASSGEGIEVDGKMLKERALNEFTTYATGRQNIAFVDITIKMLKRYNPLLLFGEMVLGLFFDAMVPSTEKVEIIAYPFDGREKDLVPPTPMDVETDKRSKSTPSTYDGFVFAVVHKNAMRRLREDRYDVSLTFTKDNAKLPSWLTVMSESAEITDSILVPELVKAIEEAGDLFDHLIVTDQPMEKPATTEEAVPRKRLILSLRIPSSSDASDYVSSSNLLKIFIRLSDRLVTLAHFRPEVTRKLRNTREEEIKRMKRADLDEKAEERKTAAEKIKKEERDRLLRSMSAEEQKKYLAKEKEREQKREMKRQTRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.24
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.22
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.15
21 0.17
22 0.16
23 0.17
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.16
31 0.16
32 0.21
33 0.25
34 0.27
35 0.31
36 0.36
37 0.45
38 0.48
39 0.54
40 0.57
41 0.6
42 0.68
43 0.68
44 0.64
45 0.56
46 0.54
47 0.48
48 0.4
49 0.36
50 0.26
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.06
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.06
68 0.12
69 0.19
70 0.27
71 0.35
72 0.44
73 0.48
74 0.53
75 0.59
76 0.64
77 0.67
78 0.68
79 0.67
80 0.64
81 0.67
82 0.66
83 0.6
84 0.51
85 0.41
86 0.32
87 0.26
88 0.19
89 0.12
90 0.09
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.14
119 0.19
120 0.21
121 0.21
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.15
144 0.17
145 0.19
146 0.22
147 0.26
148 0.26
149 0.28
150 0.28
151 0.26
152 0.24
153 0.19
154 0.17
155 0.11
156 0.1
157 0.07
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.14
195 0.17
196 0.2
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.2
201 0.22
202 0.25
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.27
207 0.27
208 0.26
209 0.22
210 0.16
211 0.14
212 0.1
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.18
219 0.23
220 0.24
221 0.24
222 0.3
223 0.35
224 0.37
225 0.39
226 0.37
227 0.38
228 0.38
229 0.34
230 0.32
231 0.29
232 0.28
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.2
237 0.23
238 0.22
239 0.2
240 0.21
241 0.2
242 0.24
243 0.21
244 0.19
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.12
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.18
291 0.22
292 0.31
293 0.33
294 0.33
295 0.33
296 0.31
297 0.31
298 0.31
299 0.28
300 0.28
301 0.31
302 0.38
303 0.39
304 0.38
305 0.38
306 0.36
307 0.35
308 0.27
309 0.22
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.14
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.16
325 0.19
326 0.18
327 0.2
328 0.23
329 0.23
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.21
334 0.24
335 0.23
336 0.2
337 0.2
338 0.26
339 0.3
340 0.38
341 0.39
342 0.43
343 0.48
344 0.58
345 0.67
346 0.69
347 0.71
348 0.71
349 0.75
350 0.72
351 0.74
352 0.75
353 0.74
354 0.72
355 0.68
356 0.62
357 0.58
358 0.59
359 0.6
360 0.57
361 0.56
362 0.56
363 0.58
364 0.6
365 0.55
366 0.49
367 0.39
368 0.36
369 0.33
370 0.35
371 0.39
372 0.42
373 0.46
374 0.54
375 0.63
376 0.66
377 0.69
378 0.7
379 0.71
380 0.73
381 0.74
382 0.72
383 0.67
384 0.61
385 0.57
386 0.53
387 0.5
388 0.49
389 0.49
390 0.44
391 0.41
392 0.43
393 0.44
394 0.42
395 0.45
396 0.45
397 0.49
398 0.57
399 0.65
400 0.71
401 0.77
402 0.8
403 0.79
404 0.8
405 0.81
406 0.83
407 0.84
408 0.85