Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4MYC1

Protein Details
Accession A0A4S4MYC1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-441DKQICRKCYARLPPRATNCRKRSCGHSSQLRPKKKLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-441RPKKKLK
Subcellular Location(s) mito 7, cyto_nucl 6.5, cyto 6, nucl 5, extr 5, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR038587  L40e_sf  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR001975  Ribosomal_L40e  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
PF01020  Ribosomal_L40e  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00502  POLYGALACTURONASE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01803  Ubl_ubiquitin  
Amino Acid Sequences MYLAELSRSMVKINFTLLMCTDLTTGTDGLGQAWWDASQQVNRPHGWAFSKINNGVIRDMKLWKPIGWNFATSGSSNLHIFNNKIVAVSTTNSFPFNTDGFSAGGSNMLFENNHVQNGDDCLTVGSGAKNIHFRNSICEGGHGLSIGSLGEGGTVADVQDVLFENVQMTNTLYGARFKSWTGGNGLAPNVTWKNIQFTNVPFPIYVTQNYWDQGVGPRPNSSTINNTHIQDFLFQNFVGAIEDVPYVEGSCVSDPCWFAVPGATGKEVVIFDLYPGTTTNIVAKDIFGRTETGAQVRAMCNATKAPPHPTVTKMQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLKVLASKYNCDKQICRKCYARLPPRATNCRKRSCGHSSQLRPKKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.21
3 0.23
4 0.22
5 0.22
6 0.2
7 0.2
8 0.17
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.12
25 0.16
26 0.23
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.36
31 0.37
32 0.38
33 0.37
34 0.36
35 0.34
36 0.35
37 0.42
38 0.41
39 0.46
40 0.44
41 0.42
42 0.4
43 0.39
44 0.35
45 0.31
46 0.35
47 0.31
48 0.34
49 0.35
50 0.32
51 0.37
52 0.38
53 0.41
54 0.38
55 0.37
56 0.33
57 0.33
58 0.33
59 0.25
60 0.24
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.18
71 0.18
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.15
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.19
105 0.19
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.17
117 0.17
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.27
122 0.3
123 0.31
124 0.26
125 0.26
126 0.24
127 0.21
128 0.21
129 0.15
130 0.1
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.14
174 0.13
175 0.15
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.13
181 0.14
182 0.16
183 0.15
184 0.17
185 0.23
186 0.23
187 0.23
188 0.19
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.18
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.23
212 0.25
213 0.25
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.18
218 0.16
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.14
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.15
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.19
291 0.2
292 0.23
293 0.27
294 0.3
295 0.31
296 0.33
297 0.37
298 0.39
299 0.41
300 0.38
301 0.37
302 0.37
303 0.37
304 0.35
305 0.34
306 0.31
307 0.27
308 0.27
309 0.25
310 0.21
311 0.2
312 0.22
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.11
324 0.12
325 0.1
326 0.14
327 0.17
328 0.2
329 0.24
330 0.26
331 0.3
332 0.3
333 0.38
334 0.39
335 0.38
336 0.38
337 0.4
338 0.4
339 0.4
340 0.39
341 0.32
342 0.3
343 0.31
344 0.29
345 0.27
346 0.29
347 0.23
348 0.28
349 0.28
350 0.26
351 0.23
352 0.23
353 0.22
354 0.18
355 0.19
356 0.15
357 0.21
358 0.24
359 0.26
360 0.29
361 0.27
362 0.25
363 0.26
364 0.28
365 0.25
366 0.24
367 0.2
368 0.23
369 0.26
370 0.27
371 0.29
372 0.26
373 0.21
374 0.19
375 0.2
376 0.16
377 0.15
378 0.16
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.21
386 0.21
387 0.29
388 0.34
389 0.42
390 0.48
391 0.52
392 0.57
393 0.6
394 0.68
395 0.65
396 0.65
397 0.64
398 0.65
399 0.7
400 0.75
401 0.74
402 0.74
403 0.77
404 0.79
405 0.83
406 0.87
407 0.87
408 0.87
409 0.87
410 0.86
411 0.84
412 0.79
413 0.78
414 0.76
415 0.76
416 0.75
417 0.76
418 0.76
419 0.81
420 0.87
421 0.88