Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N0U2

Protein Details
Accession A0A4S4N0U2    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-152REINKKTRSGDKKFEKQVKSVKIKRKRKGDITSANFPHydrophilic
580-610SGAIRSKKKASLRDKQKKLRAHIDKSKKTKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-143RREINKKTRSGDKKFEKQVKSVKIKRKRK
418-423KSKKKK
524-529RKKAKS
533-610ERVASIAKGREGREKFGSMKGKKNKEAPSSSTNREKARNKPLMMVIASGAIRSKKKASLRDKQKKLRAHIDKSKKTKH
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 10, cyto_mito 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MRSKNHKLNRAVQTMLFGMIEKGMEAEVVGDKGKAKAITHDSDDAMWAVVLTKELWKKGVWSDAKTVSIVALGSAHPAIKVRSASIHFFLGEDDDAVDSDDEEEEIPSVKGLQHRREINKKTRSGDKKFEKQVKSVKIKRKRKGDITSANFPALQLLNDPQTFCEKLYDMLNRYDKRYSLEHKILIMQLLSRVMGAHKLHVLSFYTYIMKYLTYHQLRIPSILVGLAQSVHEYTPPDALLPCVRKIAHEFVHPGVGSEVVAAGINAIREICRRQPWAMEEDLLGDLVAYRKSRVKAVTAAARGLLQQFRDVNPGMLKRRERGKEASMGMTTGARPFGHSSDAAVDIEGLVLLEDHLQRLRDEEGAEAGDADKDDEAAWENWDVESDSSDESSDGWQDVPSDGDSDLEVSDSEDEDDKKSKKKKGEGEDVDKMDVDEEATKQDEDEAPVDPARVSILATTKILTPADFAMLNDLRIQAAKESVEKGGGSATKRKLAALEADKKARAQSGNMDDAFVSENDILGPRKKAKSDYAERVASIAKGREGREKFGSMKGKKNKEAPSSSTNREKARNKPLMMVIASGAIRSKKKASLRDKQKKLRAHIDKSKKTKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.3
4 0.21
5 0.16
6 0.14
7 0.13
8 0.09
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.13
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.24
24 0.31
25 0.35
26 0.38
27 0.4
28 0.37
29 0.35
30 0.35
31 0.28
32 0.21
33 0.16
34 0.11
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.14
40 0.18
41 0.2
42 0.22
43 0.21
44 0.24
45 0.28
46 0.36
47 0.35
48 0.35
49 0.41
50 0.43
51 0.44
52 0.41
53 0.37
54 0.27
55 0.23
56 0.19
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.21
70 0.24
71 0.27
72 0.28
73 0.29
74 0.25
75 0.24
76 0.23
77 0.19
78 0.16
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.16
98 0.23
99 0.29
100 0.36
101 0.44
102 0.53
103 0.63
104 0.7
105 0.74
106 0.76
107 0.76
108 0.74
109 0.76
110 0.77
111 0.75
112 0.76
113 0.76
114 0.76
115 0.79
116 0.83
117 0.77
118 0.74
119 0.76
120 0.75
121 0.76
122 0.75
123 0.76
124 0.77
125 0.83
126 0.85
127 0.86
128 0.85
129 0.84
130 0.84
131 0.84
132 0.84
133 0.81
134 0.79
135 0.71
136 0.62
137 0.52
138 0.43
139 0.36
140 0.25
141 0.18
142 0.12
143 0.12
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.19
152 0.15
153 0.16
154 0.21
155 0.25
156 0.24
157 0.3
158 0.38
159 0.37
160 0.4
161 0.41
162 0.37
163 0.35
164 0.39
165 0.37
166 0.38
167 0.42
168 0.4
169 0.38
170 0.4
171 0.37
172 0.31
173 0.26
174 0.17
175 0.13
176 0.12
177 0.1
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.17
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.14
199 0.22
200 0.21
201 0.23
202 0.24
203 0.3
204 0.3
205 0.3
206 0.27
207 0.18
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.07
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.21
233 0.26
234 0.23
235 0.23
236 0.25
237 0.23
238 0.26
239 0.24
240 0.21
241 0.16
242 0.13
243 0.1
244 0.08
245 0.07
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.08
257 0.12
258 0.16
259 0.19
260 0.2
261 0.23
262 0.25
263 0.27
264 0.26
265 0.22
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.12
270 0.09
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.11
278 0.12
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.2
283 0.24
284 0.29
285 0.26
286 0.25
287 0.22
288 0.21
289 0.19
290 0.17
291 0.15
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.15
300 0.19
301 0.2
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.35
306 0.37
307 0.39
308 0.39
309 0.39
310 0.39
311 0.4
312 0.38
313 0.3
314 0.27
315 0.23
316 0.19
317 0.16
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.04
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.17
403 0.19
404 0.27
405 0.34
406 0.4
407 0.46
408 0.54
409 0.61
410 0.64
411 0.73
412 0.74
413 0.74
414 0.75
415 0.69
416 0.61
417 0.52
418 0.42
419 0.31
420 0.22
421 0.15
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.09
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.15
448 0.15
449 0.13
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.15
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.13
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.16
473 0.18
474 0.19
475 0.25
476 0.27
477 0.31
478 0.32
479 0.32
480 0.3
481 0.29
482 0.35
483 0.36
484 0.42
485 0.42
486 0.46
487 0.46
488 0.46
489 0.45
490 0.41
491 0.33
492 0.26
493 0.3
494 0.32
495 0.38
496 0.37
497 0.36
498 0.31
499 0.3
500 0.29
501 0.2
502 0.16
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.12
507 0.14
508 0.15
509 0.21
510 0.26
511 0.31
512 0.34
513 0.39
514 0.45
515 0.53
516 0.59
517 0.63
518 0.64
519 0.61
520 0.58
521 0.55
522 0.48
523 0.39
524 0.33
525 0.26
526 0.23
527 0.26
528 0.28
529 0.36
530 0.38
531 0.41
532 0.42
533 0.44
534 0.42
535 0.46
536 0.54
537 0.5
538 0.58
539 0.62
540 0.67
541 0.69
542 0.75
543 0.75
544 0.75
545 0.76
546 0.72
547 0.72
548 0.7
549 0.7
550 0.71
551 0.68
552 0.65
553 0.67
554 0.68
555 0.68
556 0.72
557 0.74
558 0.66
559 0.67
560 0.65
561 0.62
562 0.56
563 0.47
564 0.37
565 0.32
566 0.29
567 0.23
568 0.22
569 0.2
570 0.22
571 0.24
572 0.28
573 0.32
574 0.4
575 0.5
576 0.57
577 0.63
578 0.72
579 0.8
580 0.86
581 0.89
582 0.9
583 0.89
584 0.87
585 0.88
586 0.87
587 0.86
588 0.86
589 0.87
590 0.88