Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4MR92

Protein Details
Accession A0A4S4MR92    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35AAKSGKLNVKKQPQKIPKQPLPLPDRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-247EKKVRVKRVPK
265-266KN
268-268R
272-282HTGHKRKKGGG
304-317GGAGAGKGKGKKKK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12.333, nucl 8, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
Amino Acid Sequences MPPKSTSSAAAKSGKLNVKKQPQKIPKQPLPLPDRLKRLFTSLCAQVEGGHFANAVKTCDKILVLDPDDQDALQTKLYLLLQTEQYAAALALVDDAGEHAFEGMYALYRLHRETEVESTLAELKEANNEDDRGVIHLEAQLNYRQGAYQSAYDLYNDLLDTTEPDTEEHSDIVTNIEATQKHLDFINSGYSRALSALPAAITTGLETSPPPAPAQSTSLYVAAQAAEQQKKVEAPAEKKVRVKRVPKGVVPGVTPAADPERWMKKNERSTFHTGHKRKKGGGGGGATQGSVESAGGAVSSGGGGGAGAGKGKGKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.54
4 0.56
5 0.62
6 0.69
7 0.74
8 0.77
9 0.79
10 0.83
11 0.86
12 0.88
13 0.85
14 0.86
15 0.82
16 0.8
17 0.77
18 0.76
19 0.74
20 0.7
21 0.71
22 0.64
23 0.64
24 0.56
25 0.55
26 0.48
27 0.43
28 0.42
29 0.39
30 0.37
31 0.33
32 0.32
33 0.28
34 0.26
35 0.27
36 0.22
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.17
41 0.16
42 0.18
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.14
49 0.16
50 0.21
51 0.22
52 0.26
53 0.25
54 0.25
55 0.26
56 0.24
57 0.2
58 0.15
59 0.14
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.09
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.16
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.12
109 0.09
110 0.08
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.1
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.18
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.12
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.21
220 0.22
221 0.24
222 0.34
223 0.42
224 0.45
225 0.51
226 0.57
227 0.61
228 0.64
229 0.68
230 0.67
231 0.69
232 0.72
233 0.69
234 0.7
235 0.64
236 0.58
237 0.51
238 0.45
239 0.36
240 0.29
241 0.25
242 0.19
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.2
247 0.28
248 0.3
249 0.35
250 0.41
251 0.47
252 0.57
253 0.64
254 0.63
255 0.61
256 0.68
257 0.7
258 0.72
259 0.73
260 0.72
261 0.74
262 0.78
263 0.76
264 0.71
265 0.72
266 0.7
267 0.65
268 0.64
269 0.57
270 0.5
271 0.48
272 0.45
273 0.37
274 0.29
275 0.22
276 0.15
277 0.11
278 0.08
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.06
296 0.11
297 0.18