Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4MYL1

Protein Details
Accession A0A4S4MYL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-213PEILRRVRAKHLKKRKLRLQNDPTLIRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-112AATPGRTRTKAPAATTKRAARTTKKPATKKTAGAKTKAAPKPKKKAVNQVAPPKLTK
191-203RRVRAKHLKKRKL
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MFSLFVRRIVTRVPSTPALVNATPRLSTVTRSTWSRAFTTTPRMLEPAAATKPKTAATPGRTRTKAPAATTKRAARTTKKPATKKTAGAKTKAAPKPKKKAVNQVAPPKLTKEQLPPKRPMKPYTIYATEFYATNPSTDKLPVRAKAAGEAWKSLSDAEKEPYRERYQEARAAYQVVIEEYTKNTPPEILRRVRAKHLKKRKLRLQNDPTLIRTAGPFPYFYKTWYNTDGKAIHGSAVSEAMKAAAEKWRTMPDAEKQTWKEASLEAASQQKAKAVAAHAATST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.38
4 0.37
5 0.35
6 0.31
7 0.32
8 0.3
9 0.29
10 0.26
11 0.25
12 0.27
13 0.22
14 0.24
15 0.25
16 0.27
17 0.3
18 0.33
19 0.37
20 0.36
21 0.38
22 0.37
23 0.34
24 0.34
25 0.33
26 0.39
27 0.4
28 0.38
29 0.37
30 0.36
31 0.34
32 0.31
33 0.29
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.27
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.26
42 0.25
43 0.27
44 0.31
45 0.4
46 0.45
47 0.53
48 0.54
49 0.55
50 0.56
51 0.57
52 0.55
53 0.49
54 0.53
55 0.51
56 0.56
57 0.61
58 0.6
59 0.57
60 0.58
61 0.6
62 0.57
63 0.59
64 0.64
65 0.66
66 0.69
67 0.71
68 0.73
69 0.77
70 0.75
71 0.73
72 0.72
73 0.73
74 0.68
75 0.64
76 0.61
77 0.56
78 0.6
79 0.58
80 0.58
81 0.58
82 0.63
83 0.69
84 0.74
85 0.78
86 0.73
87 0.79
88 0.79
89 0.79
90 0.77
91 0.77
92 0.73
93 0.66
94 0.61
95 0.53
96 0.47
97 0.38
98 0.32
99 0.32
100 0.37
101 0.45
102 0.5
103 0.54
104 0.58
105 0.65
106 0.67
107 0.61
108 0.57
109 0.52
110 0.5
111 0.48
112 0.46
113 0.39
114 0.35
115 0.33
116 0.26
117 0.22
118 0.18
119 0.16
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.15
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.23
132 0.22
133 0.23
134 0.25
135 0.25
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.17
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.17
147 0.19
148 0.21
149 0.26
150 0.27
151 0.27
152 0.29
153 0.32
154 0.33
155 0.35
156 0.35
157 0.31
158 0.29
159 0.29
160 0.26
161 0.2
162 0.16
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.16
174 0.23
175 0.29
176 0.31
177 0.35
178 0.42
179 0.45
180 0.52
181 0.6
182 0.62
183 0.66
184 0.72
185 0.77
186 0.79
187 0.87
188 0.87
189 0.88
190 0.86
191 0.87
192 0.85
193 0.84
194 0.82
195 0.74
196 0.66
197 0.58
198 0.5
199 0.39
200 0.3
201 0.24
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.28
210 0.28
211 0.32
212 0.37
213 0.39
214 0.35
215 0.41
216 0.39
217 0.33
218 0.33
219 0.29
220 0.24
221 0.21
222 0.2
223 0.14
224 0.17
225 0.15
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.2
236 0.25
237 0.26
238 0.28
239 0.32
240 0.34
241 0.42
242 0.44
243 0.5
244 0.47
245 0.52
246 0.52
247 0.48
248 0.41
249 0.32
250 0.33
251 0.26
252 0.25
253 0.22
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.26
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.24
262 0.2
263 0.25
264 0.24