FuNGI

A0A4S4N3K4

Protein Details

Accession

A0A4S4N3K4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
242-279	GSEEDRPRPSKERNKRSKKVKEKRIKAPTKKEREETEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
247-276	RPRPSKERNKRSKKVKEKRIKAPTKKEREE
500-510	AKKKRGKGDAR
928-941	KRPGGGRLKRRRAS
980-980	K

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010920 LSM_dom_sf IPR034110 LSMD1_Sm IPR018564 Repl_chkpnt_MRC1_dom IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0031417 C:NatC complex GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF09444 MRC1
CDD	cd06168 LSMD1

Amino Acid Sequences

MSDSSHVIQRARVTYGRRTRDIDADLSLADTSVVSTGSSVEEPPESDGVDTSTFMDGLAEDEDSPLRVHDDSDTQDPAGTGKFEFGWRKELRKMDDSDDEDVQVSVRATAAGVANDKGKSRSFSEEVEEELDSDHDGHCPLRPGPEHAESSRPTFITEVSSPERASAVPRRAARSRRTIRSDTEEEREPSSPQTPARDLHHLNTPQRHSSPTPPTSTETAPRKGKAAAAKTAPPRFVSPDDGSEEDRPRPSKERNKRSKKVKEKRIKAPTKKEREETEKATARIKAAQAADVPRAQTKIMAIGRLFQLFPDQNLQSLAHSVIPSSDPIESFSSSPRATAFFNPRPSPPAASVHLPRTVSLPSAPSGSREFPAKLEDSDDELPDLANAIKQREEENEARKRSARMAELVQRKQRLLEQQQQRQVVDESSDDGDIIVTNDMHTIAQDESEQRRRQRLHGQYITKNQRELSKVRPIAARAVKFEEPGESSLQIAAVGAFGTPAKKKRGKGDARQLKPAELNEILRRKMTTEAQKVTEEKERVWRSMGGHVSGRPNPQGQAKASEARIQLLQRGLRNIEQDQGQEDVQLSDESDQEWRPDDEQTREDEDAIMVTGVEKEVDGAASVDEGEGDEDAIMLAPKHRARARIVAVTDSDDEENIAPRGSSEENAENETDKENNATLMFDQGEDKENTSIHFSPTPPSPPLGLFQDSRIGRTLSLSSDFGDHGPLRDIAKDDDPFLTPSARMPPPGALSLDLGLEEQVADPENPFCLKPAPILDAGFSQLFEASAGSSSKIKSFSQFITPAKGTGGLKDLRKPGGLVLPLSFNPSLQPALEVTDSVRKKADNIFEKEQEYMAGDEEPAGASEPQMFVNENGFLTQTRPSNMDVARLMSSTQSTRIGVSPSILDSIQSRATQRRPLGEIELDIPGNEKRPGGGRLKRRRASPDRDGGYSSSGGSPSPSPIKRPIESVFAQMKEARNPLKKPKFRRSDFVNDQAQESDEEEHFGFGERLQKQDQDDDDEDNAEELQKLRKEMVDDAAMDETTLNEEKVLEKHRQQVEADDAVEMKIAQDAATGKLRVKQRSRGVGYEDDEDSDEDEENEARRYKMMRRHRELGDADTLVALGKDKESAPFVESYQKDLDDDNQEFSYLNESQQPTLVEKDEGDEDEDEEEDRQVTMAELRKELQGAAQGRTTVDAPDPQDLSWLDQGDDDMVVDDTVAVKEVTKVRTGSRSSGRAEWDLERPLLRRGDADTPALAQVKQLLHKSLRITIDDGRIFLGTFAGTDKQLNILLINADEFRLSPLEHANPNGRFVGLVMVPRRMIVRVEAPLTADGGGERDMYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.54
3	0.58
4	0.57
5	0.59
6	0.58
7	0.6
8	0.59
9	0.51
10	0.44
11	0.37
12	0.32
13	0.28
14	0.24
15	0.16
16	0.12
17	0.09
18	0.07
19	0.06
20	0.06
21	0.05
22	0.06
23	0.07
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.12
29	0.13
30	0.16
31	0.16
32	0.15
33	0.14
34	0.14
35	0.15
36	0.15
37	0.14
38	0.13
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.09
44	0.09
45	0.1
46	0.09
47	0.08
48	0.09
49	0.1
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.11
54	0.11
55	0.12
56	0.13
57	0.18
58	0.21
59	0.25
60	0.27
61	0.25
62	0.25
63	0.24
64	0.23
65	0.2
66	0.17
67	0.12
68	0.12
69	0.13
70	0.19
71	0.26
72	0.26
73	0.34
74	0.38
75	0.43
76	0.49
77	0.55
78	0.56
79	0.57
80	0.59
81	0.55
82	0.59
83	0.57
84	0.54
85	0.48
86	0.42
87	0.35
88	0.31
89	0.25
90	0.18
91	0.14
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.1
97	0.11
98	0.11
99	0.13
100	0.14
101	0.17
102	0.19
103	0.21
104	0.21
105	0.23
106	0.24
107	0.26
108	0.33
109	0.32
110	0.33
111	0.37
112	0.35
113	0.35
114	0.33
115	0.3
116	0.22
117	0.2
118	0.17
119	0.12
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.1
124	0.1
125	0.12
126	0.16
127	0.17
128	0.23
129	0.25
130	0.3
131	0.35
132	0.41
133	0.43
134	0.41
135	0.46
136	0.41
137	0.44
138	0.42
139	0.36
140	0.31
141	0.27
142	0.25
143	0.25
144	0.24
145	0.25
146	0.25
147	0.28
148	0.27
149	0.27
150	0.27
151	0.21
152	0.26
153	0.28
154	0.31
155	0.35
156	0.4
157	0.46
158	0.53
159	0.6
160	0.62
161	0.64
162	0.67
163	0.7
164	0.73
165	0.72
166	0.7
167	0.71
168	0.71
169	0.65
170	0.61
171	0.57
172	0.51
173	0.5
174	0.45
175	0.38
176	0.34
177	0.32
178	0.31
179	0.27
180	0.31
181	0.31
182	0.33
183	0.37
184	0.42
185	0.42
186	0.4
187	0.47
188	0.47
189	0.5
190	0.55
191	0.55
192	0.52
193	0.52
194	0.54
195	0.48
196	0.51
197	0.54
198	0.51
199	0.51
200	0.48
201	0.5
202	0.49
203	0.48
204	0.48
205	0.45
206	0.48
207	0.49
208	0.47
209	0.46
210	0.43
211	0.45
212	0.44
213	0.43
214	0.41
215	0.4
216	0.46
217	0.52
218	0.55
219	0.52
220	0.46
221	0.43
222	0.41
223	0.4
224	0.4
225	0.34
226	0.33
227	0.36
228	0.36
229	0.37
230	0.37
231	0.37
232	0.34
233	0.37
234	0.35
235	0.36
236	0.41
237	0.48
238	0.54
239	0.61
240	0.69
241	0.75
242	0.83
243	0.88
244	0.92
245	0.93
246	0.93
247	0.93
248	0.93
249	0.93
250	0.91
251	0.93
252	0.93
253	0.93
254	0.91
255	0.92
256	0.92
257	0.91
258	0.89
259	0.85
260	0.81
261	0.79
262	0.76
263	0.71
264	0.7
265	0.65
266	0.6
267	0.57
268	0.51
269	0.44
270	0.41
271	0.36
272	0.32
273	0.26
274	0.27
275	0.26
276	0.27
277	0.28
278	0.25
279	0.25
280	0.22
281	0.22
282	0.2
283	0.17
284	0.15
285	0.2
286	0.2
287	0.22
288	0.2
289	0.22
290	0.24
291	0.24
292	0.24
293	0.16
294	0.21
295	0.18
296	0.2
297	0.22
298	0.2
299	0.19
300	0.21
301	0.22
302	0.16
303	0.17
304	0.16
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.09
314	0.12
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.16
319	0.2
320	0.19
321	0.19
322	0.17
323	0.17
324	0.18
325	0.24
326	0.31
327	0.33
328	0.41
329	0.42
330	0.43
331	0.45
332	0.45
333	0.42
334	0.35
335	0.33
336	0.29
337	0.32
338	0.35
339	0.34
340	0.36
341	0.33
342	0.3
343	0.27
344	0.25
345	0.21
346	0.18
347	0.16
348	0.13
349	0.15
350	0.15
351	0.16
352	0.18
353	0.19
354	0.19
355	0.2
356	0.2
357	0.19
358	0.22
359	0.22
360	0.19
361	0.19
362	0.19
363	0.21
364	0.22
365	0.21
366	0.18
367	0.16
368	0.15
369	0.12
370	0.12
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.11
376	0.12
377	0.14
378	0.16
379	0.22
380	0.26
381	0.34
382	0.4
383	0.41
384	0.43
385	0.44
386	0.43
387	0.42
388	0.42
389	0.36
390	0.31
391	0.34
392	0.4
393	0.47
394	0.52
395	0.52
396	0.49
397	0.47
398	0.45
399	0.43
400	0.44
401	0.43
402	0.46
403	0.5
404	0.55
405	0.62
406	0.63
407	0.58
408	0.51
409	0.45
410	0.36
411	0.27
412	0.2
413	0.15
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.09
418	0.08
419	0.07
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.08
432	0.11
433	0.17
434	0.25
435	0.3
436	0.31
437	0.39
438	0.41
439	0.46
440	0.52
441	0.56
442	0.58
443	0.62
444	0.66
445	0.65
446	0.72
447	0.76
448	0.68
449	0.6
450	0.51
451	0.48
452	0.45
453	0.42
454	0.38
455	0.39
456	0.39
457	0.4
458	0.41
459	0.37
460	0.42
461	0.44
462	0.4
463	0.32
464	0.36
465	0.33
466	0.31
467	0.3
468	0.24
469	0.19
470	0.19
471	0.18
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.11
476	0.09
477	0.07
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.04
484	0.06
485	0.08
486	0.13
487	0.2
488	0.26
489	0.29
490	0.37
491	0.48
492	0.55
493	0.62
494	0.7
495	0.72
496	0.71
497	0.76
498	0.68
499	0.59
500	0.53
501	0.44
502	0.37
503	0.28
504	0.27
505	0.26
506	0.29
507	0.28
508	0.26
509	0.26
510	0.23
511	0.25
512	0.28
513	0.31
514	0.34
515	0.36
516	0.38
517	0.41
518	0.4
519	0.39
520	0.4
521	0.32
522	0.26
523	0.32
524	0.32
525	0.3
526	0.31
527	0.31
528	0.26
529	0.31
530	0.32
531	0.24
532	0.23
533	0.24
534	0.27
535	0.27
536	0.27
537	0.22
538	0.22
539	0.21
540	0.24
541	0.25
542	0.22
543	0.24
544	0.24
545	0.26
546	0.26
547	0.29
548	0.26
549	0.23
550	0.24
551	0.2
552	0.2
553	0.2
554	0.22
555	0.18
556	0.2
557	0.2
558	0.2
559	0.22
560	0.21
561	0.19
562	0.18
563	0.17
564	0.16
565	0.16
566	0.14
567	0.12
568	0.11
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.08
577	0.08
578	0.08
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.13
583	0.16
584	0.18
585	0.19
586	0.21
587	0.23
588	0.23
589	0.22
590	0.19
591	0.16
592	0.13
593	0.11
594	0.08
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.02
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.04
622	0.07
623	0.08
624	0.13
625	0.15
626	0.18
627	0.21
628	0.28
629	0.3
630	0.31
631	0.31
632	0.28
633	0.26
634	0.25
635	0.23
636	0.17
637	0.13
638	0.09
639	0.09
640	0.07
641	0.08
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.09
650	0.12
651	0.13
652	0.15
653	0.15
654	0.13
655	0.13
656	0.14
657	0.12
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.08
662	0.07
663	0.07
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.1
671	0.1
672	0.11
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.14
677	0.14
678	0.13
679	0.14
680	0.14
681	0.15
682	0.17
683	0.2
684	0.17
685	0.17
686	0.16
687	0.15
688	0.16
689	0.17
690	0.17
691	0.15
692	0.15
693	0.21
694	0.2
695	0.2
696	0.2
697	0.17
698	0.15
699	0.16
700	0.16
701	0.1
702	0.12
703	0.11
704	0.1
705	0.11
706	0.11
707	0.1
708	0.12
709	0.1
710	0.09
711	0.1
712	0.11
713	0.1
714	0.11
715	0.12
716	0.11
717	0.15
718	0.15
719	0.15
720	0.14
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.13
725	0.1
726	0.11
727	0.16
728	0.15
729	0.15
730	0.15
731	0.15
732	0.16
733	0.18
734	0.17
735	0.12
736	0.11
737	0.11
738	0.1
739	0.09
740	0.07
741	0.05
742	0.05
743	0.04
744	0.04
745	0.03
746	0.04
747	0.04
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.09
756	0.1
757	0.11
758	0.13
759	0.14
760	0.14
761	0.14
762	0.12
763	0.14
764	0.12
765	0.1
766	0.08
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.05
771	0.04
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.08
776	0.08
777	0.1
778	0.12
779	0.13
780	0.14
781	0.17
782	0.18
783	0.22
784	0.26
785	0.25
786	0.28
787	0.28
788	0.26
789	0.23
790	0.25
791	0.2
792	0.16
793	0.19
794	0.18
795	0.19
796	0.23
797	0.26
798	0.24
799	0.24
800	0.23
801	0.2
802	0.21
803	0.21
804	0.17
805	0.15
806	0.15
807	0.15
808	0.18
809	0.16
810	0.12
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.09
815	0.1
816	0.07
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.16
822	0.17
823	0.17
824	0.18
825	0.16
826	0.18
827	0.23
828	0.31
829	0.31
830	0.37
831	0.42
832	0.44
833	0.45
834	0.43
835	0.38
836	0.3
837	0.23
838	0.16
839	0.12
840	0.09
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.06
845	0.05
846	0.06
847	0.05
848	0.05
849	0.06
850	0.07
851	0.07
852	0.08
853	0.08
854	0.08
855	0.09
856	0.1
857	0.09
858	0.09
859	0.09
860	0.08
861	0.09
862	0.12
863	0.12
864	0.13
865	0.14
866	0.15
867	0.2
868	0.2
869	0.22
870	0.2
871	0.2
872	0.2
873	0.18
874	0.17
875	0.13
876	0.14
877	0.11
878	0.13
879	0.12
880	0.12
881	0.13
882	0.14
883	0.15
884	0.14
885	0.14
886	0.12
887	0.11
888	0.12
889	0.11
890	0.1
891	0.09
892	0.11
893	0.13
894	0.14
895	0.15
896	0.2
897	0.24
898	0.3
899	0.32
900	0.33
901	0.33
902	0.34
903	0.35
904	0.31
905	0.28
906	0.23
907	0.22
908	0.18
909	0.15
910	0.14
911	0.11
912	0.13
913	0.13
914	0.11
915	0.1
916	0.14
917	0.19
918	0.26
919	0.33
920	0.42
921	0.52
922	0.62
923	0.66
924	0.68
925	0.73
926	0.73
927	0.75
928	0.73
929	0.72
930	0.64
931	0.62
932	0.58
933	0.49
934	0.42
935	0.34
936	0.26
937	0.17
938	0.14
939	0.12
940	0.12
941	0.12
942	0.12
943	0.2
944	0.2
945	0.23
946	0.31
947	0.37
948	0.36
949	0.4
950	0.39
951	0.38
952	0.38
953	0.41
954	0.38
955	0.32
956	0.33
957	0.32
958	0.32
959	0.29
960	0.33
961	0.34
962	0.36
963	0.4
964	0.5
965	0.57
966	0.63
967	0.69
968	0.74
969	0.78
970	0.75
971	0.78
972	0.75
973	0.75
974	0.75
975	0.73
976	0.7
977	0.6
978	0.56
979	0.49
980	0.41
981	0.31
982	0.25
983	0.2
984	0.13
985	0.14
986	0.13
987	0.12
988	0.11
989	0.12
990	0.11
991	0.09
992	0.17
993	0.16
994	0.19
995	0.21
996	0.23
997	0.24
998	0.29
999	0.3
1000	0.29
1001	0.3
1002	0.29
1003	0.28
1004	0.27
1005	0.25
1006	0.19
1007	0.18
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.09
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.19
1016	0.21
1017	0.22
1018	0.25
1019	0.22
1020	0.21
1021	0.21
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.16
1025	0.14
1026	0.1
1027	0.1
1028	0.1
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.08
1032	0.1
1033	0.15
1034	0.19
1035	0.22
1036	0.25
1037	0.34
1038	0.38
1039	0.42
1040	0.4
1041	0.4
1042	0.42
1043	0.39
1044	0.35
1045	0.26
1046	0.22
1047	0.19
1048	0.18
1049	0.14
1050	0.08
1051	0.07
1052	0.06
1053	0.05
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.12
1057	0.16
1058	0.17
1059	0.17
1060	0.23
1061	0.29
1062	0.36
1063	0.41
1064	0.47
1065	0.51
1066	0.61
1067	0.64
1068	0.63
1069	0.61
1070	0.59
1071	0.55
1072	0.5
1073	0.42
1074	0.32
1075	0.29
1076	0.25
1077	0.21
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.1
1083	0.1
1084	0.14
1085	0.15
1086	0.14
1087	0.16
1088	0.2
1089	0.26
1090	0.35
1091	0.45
1092	0.52
1093	0.59
1094	0.66
1095	0.66
1096	0.71
1097	0.66
1098	0.61
1099	0.55
1100	0.45
1101	0.37
1102	0.29
1103	0.26
1104	0.18
1105	0.15
1106	0.11
1107	0.06
1108	0.06
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.1
1112	0.13
1113	0.14
1114	0.15
1115	0.16
1116	0.17
1117	0.25
1118	0.25
1119	0.27
1120	0.27
1121	0.26
1122	0.25
1123	0.25
1124	0.28
1125	0.27
1126	0.28
1127	0.27
1128	0.24
1129	0.24
1130	0.23
1131	0.23
1132	0.23
1133	0.16
1134	0.16
1135	0.19
1136	0.2
1137	0.21
1138	0.23
1139	0.25
1140	0.22
1141	0.24
1142	0.25
1143	0.19
1144	0.18
1145	0.2
1146	0.19
1147	0.18
1148	0.19
1149	0.16
1150	0.15
1151	0.15
1152	0.15
1153	0.13
1154	0.12
1155	0.11
1156	0.09
1157	0.09
1158	0.08
1159	0.07
1160	0.07
1161	0.12
1162	0.17
1163	0.19
1164	0.21
1165	0.22
1166	0.23
1167	0.24
1168	0.23
1169	0.2
1170	0.21
1171	0.22
1172	0.23
1173	0.23
1174	0.23
1175	0.22
1176	0.24
1177	0.22
1178	0.17
1179	0.16
1180	0.18
1181	0.18
1182	0.22
1183	0.23
1184	0.21
1185	0.25
1186	0.24
1187	0.26
1188	0.25
1189	0.23
1190	0.19
1191	0.18
1192	0.19
1193	0.16
1194	0.15
1195	0.11
1196	0.08
1197	0.08
1198	0.07
1199	0.06
1200	0.06
1201	0.06
1202	0.06
1203	0.07
1204	0.06
1205	0.06
1206	0.12
1207	0.17
1208	0.19
1209	0.23
1210	0.24
1211	0.27
1212	0.36
1213	0.39
1214	0.42
1215	0.44
1216	0.48
1217	0.48
1218	0.51
1219	0.52
1220	0.47
1221	0.47
1222	0.43
1223	0.4
1224	0.38
1225	0.36
1226	0.34
1227	0.32
1228	0.35
1229	0.34
1230	0.31
1231	0.28
1232	0.29
1233	0.33
1234	0.33
1235	0.34
1236	0.29
1237	0.27
1238	0.29
1239	0.29
1240	0.25
1241	0.18
1242	0.21
1243	0.22
1244	0.27
1245	0.28
1246	0.31
1247	0.32
1248	0.37
1249	0.4
1250	0.41
1251	0.41
1252	0.38
1253	0.39
1254	0.38
1255	0.44
1256	0.41
1257	0.38
1258	0.32
1259	0.28
1260	0.26
1261	0.22
1262	0.18
1263	0.09
1264	0.08
1265	0.1
1266	0.11
1267	0.11
1268	0.12
1269	0.13
1270	0.14
1271	0.16
1272	0.16
1273	0.14
1274	0.14
1275	0.14
1276	0.13
1277	0.14
1278	0.12
1279	0.11
1280	0.11
1281	0.11
1282	0.11
1283	0.12
1284	0.12
1285	0.12
1286	0.18
1287	0.23
1288	0.26
1289	0.3
1290	0.36
1291	0.36
1292	0.39
1293	0.38
1294	0.32
1295	0.26
1296	0.24
1297	0.25
1298	0.18
1299	0.23
1300	0.23
1301	0.25
1302	0.25
1303	0.26
1304	0.27
1305	0.23
1306	0.23
1307	0.21
1308	0.25
1309	0.26
1310	0.28
1311	0.28
1312	0.29
1313	0.28
1314	0.27
1315	0.23
1316	0.17
1317	0.12
1318	0.11
1319	0.11

A0A4S4N3K4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer