FuNGI

C5G175

Protein Details

Accession

C5G175

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-428	ESPLHCHKPPSPKTRRRTVAEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 10.5, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAVSTKPMAHPGKIKRPPPPTFVQSGASGSRPAQTSPSSGSASANWTGSFKQFGNFSASGTAVNGASGRLVARVNGDPSQRTQDPSSRLQRPSTRRHAMGNGSADGRHTKKLVEPYVKTTSYILKKFAKFPPSLTMHLHPTHFRFDKQDGSFPYNSEMKVVIEHLKDGTVPHDMMEELIMGNVRFYDGCLIVQVIDHRSPSAEPTPVTKASTGQKLTPFSIHNYNEHMTPSSYVPYPKQNQATASSQPITGDQPPQAAKSPDSTEAPDTNKSKGKQPPAGEVTNAVTTGPKVFTTVLHPTPRSLQAELTLLSTIPDTRAQQRRQSQGFSTSRTSTSTSLTQPSTPLSAVAPPLERGHPAKRQKMLVEPYELPEVESKLILATAPPLYLDPVDSLEASQNLLKLLESPLHCHKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAAEERFMLIMDERLEPAISGAANAAKSAVADGDGGAVPFEP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.64
3	0.68
4	0.68
5	0.75
6	0.76
7	0.74
8	0.73
9	0.67
10	0.64
11	0.61
12	0.54
13	0.46
14	0.44
15	0.4
16	0.33
17	0.29
18	0.24
19	0.25
20	0.24
21	0.22
22	0.23
23	0.22
24	0.24
25	0.27
26	0.31
27	0.28
28	0.27
29	0.28
30	0.25
31	0.27
32	0.26
33	0.23
34	0.19
35	0.18
36	0.19
37	0.2
38	0.22
39	0.18
40	0.19
41	0.19
42	0.21
43	0.27
44	0.25
45	0.24
46	0.22
47	0.22
48	0.19
49	0.18
50	0.18
51	0.1
52	0.1
53	0.09
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.12
62	0.15
63	0.18
64	0.22
65	0.24
66	0.24
67	0.27
68	0.34
69	0.32
70	0.33
71	0.34
72	0.37
73	0.4
74	0.47
75	0.52
76	0.53
77	0.55
78	0.58
79	0.63
80	0.65
81	0.69
82	0.71
83	0.69
84	0.63
85	0.65
86	0.64
87	0.6
88	0.58
89	0.51
90	0.43
91	0.37
92	0.34
93	0.31
94	0.3
95	0.27
96	0.23
97	0.2
98	0.19
99	0.23
100	0.32
101	0.39
102	0.42
103	0.42
104	0.46
105	0.53
106	0.52
107	0.48
108	0.41
109	0.41
110	0.4
111	0.4
112	0.39
113	0.4
114	0.42
115	0.48
116	0.52
117	0.51
118	0.45
119	0.45
120	0.47
121	0.44
122	0.45
123	0.42
124	0.39
125	0.38
126	0.39
127	0.39
128	0.33
129	0.31
130	0.36
131	0.33
132	0.32
133	0.31
134	0.31
135	0.38
136	0.37
137	0.41
138	0.36
139	0.41
140	0.4
141	0.36
142	0.37
143	0.31
144	0.28
145	0.23
146	0.2
147	0.14
148	0.14
149	0.16
150	0.16
151	0.14
152	0.15
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.12
158	0.1
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.07
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.13
190	0.14
191	0.13
192	0.13
193	0.16
194	0.2
195	0.2
196	0.21
197	0.18
198	0.19
199	0.21
200	0.27
201	0.25
202	0.23
203	0.26
204	0.27
205	0.28
206	0.27
207	0.25
208	0.21
209	0.28
210	0.26
211	0.24
212	0.26
213	0.25
214	0.24
215	0.23
216	0.21
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.13
224	0.19
225	0.22
226	0.26
227	0.28
228	0.28
229	0.29
230	0.31
231	0.33
232	0.28
233	0.28
234	0.23
235	0.2
236	0.19
237	0.18
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.14
243	0.15
244	0.16
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.17
249	0.19
250	0.18
251	0.19
252	0.19
253	0.19
254	0.21
255	0.23
256	0.25
257	0.25
258	0.26
259	0.3
260	0.3
261	0.35
262	0.38
263	0.43
264	0.44
265	0.45
266	0.49
267	0.49
268	0.49
269	0.41
270	0.36
271	0.31
272	0.25
273	0.22
274	0.14
275	0.09
276	0.08
277	0.1
278	0.09
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.14
284	0.19
285	0.23
286	0.26
287	0.27
288	0.27
289	0.3
290	0.34
291	0.32
292	0.27
293	0.22
294	0.2
295	0.21
296	0.21
297	0.18
298	0.13
299	0.11
300	0.1
301	0.1
302	0.08
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.19
307	0.28
308	0.32
309	0.4
310	0.47
311	0.55
312	0.55
313	0.57
314	0.51
315	0.52
316	0.52
317	0.48
318	0.45
319	0.38
320	0.36
321	0.34
322	0.35
323	0.26
324	0.26
325	0.25
326	0.24
327	0.25
328	0.26
329	0.24
330	0.23
331	0.23
332	0.21
333	0.17
334	0.15
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.14
339	0.14
340	0.13
341	0.15
342	0.16
343	0.18
344	0.2
345	0.26
346	0.33
347	0.41
348	0.47
349	0.5
350	0.54
351	0.53
352	0.58
353	0.58
354	0.53
355	0.5
356	0.44
357	0.41
358	0.41
359	0.38
360	0.3
361	0.25
362	0.23
363	0.18
364	0.16
365	0.13
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.12
393	0.16
394	0.16
395	0.21
396	0.29
397	0.36
398	0.36
399	0.39
400	0.43
401	0.49
402	0.58
403	0.64
404	0.66
405	0.69
406	0.77
407	0.84
408	0.86
409	0.82
410	0.8
411	0.76
412	0.74
413	0.7
414	0.63
415	0.55
416	0.46
417	0.39
418	0.31
419	0.23
420	0.13
421	0.08
422	0.07
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.09
432	0.11
433	0.13
434	0.14
435	0.15
436	0.15
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.1
441	0.09
442	0.1
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.09
448	0.1
449	0.1
450	0.09
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.09
455	0.09
456	0.09

C5G175

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer