FuNGI

C5FQ74

Protein Details

Accession

C5FQ74

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
440-460	EEDRQRKNNNHEHARKRRRGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
140-143	KKQK
422-460	RRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRKNNNHEHARKRRRGS
879-884	GGRGRG

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_mito 11.5, mito 10.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSSKYPKIVSAVVEEQPQEIDGQEIPVDTTKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEGEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKAEDEKKVEFARLLKKQKRGKTDVTIAEEVITKTWDTNVITPGTPFMDILALALRYWVAYKLSTDPGWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRACPEYDPNTRHVIYGLVSDTNIYTSRLDDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQESKARTCKLCGQAGHVEEACTGKAKEKQGEFDEKQKGSPLKPFIWLHVSILREYLAVEMQVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPQMGGYLTKDGRVDLAKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRKNNNHEHARKRRRGSHGAEPAPDIPPLVVPGKGELTRAERELTHSMVVNRGAVYKANMANKSAAAALKAQLLSGGTAEDNADSEDVTEPAGSSLRKKRKSDVFENSNPDTEAEEDTEAVLEKPKEDEMPPDTVRLWEDGYADRYYEQKFKVDRKDIAFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGAMDVQFTKGIPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFRDLMSDENSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLKAMDKRYPLLSEEEQARNAMGKDVLLLSEKHPLYESLTANFYSKKQGSAKLKLNMRISEGLGGKVEKNESYLPHSALSLSVDGADIPTLDEDRSISVYYEMPKSMHAHKSMLLRGVKFKEPALDKTDLEITRNKARHSGRSFGGAPLHSNRGGRGRGGGGGRGGQISYASNDRPNPFAAHLPPGYVPPPQPPGWNPAPPGVYNGPDRYRSQGHPRGGSGGYGGGYGGHYQQPPPQNWTQHNPPGYGNAPHNSYQDRPHYQSGGSGGYGRGGGGSYDGRGGYHSSRGSGRGRGRGDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.45
3	0.46
4	0.46
5	0.41
6	0.4
7	0.38
8	0.35
9	0.34
10	0.33
11	0.29
12	0.27
13	0.24
14	0.18
15	0.13
16	0.13
17	0.1
18	0.11
19	0.11
20	0.1
21	0.11
22	0.13
23	0.14
24	0.13
25	0.19
26	0.26
27	0.3
28	0.33
29	0.34
30	0.35
31	0.38
32	0.4
33	0.39
34	0.34
35	0.33
36	0.3
37	0.28
38	0.25
39	0.2
40	0.18
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.44
55	0.5
56	0.49
57	0.51
58	0.51
59	0.52
60	0.44
61	0.38
62	0.31
63	0.25
64	0.24
65	0.17
66	0.13
67	0.11
68	0.11
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.13
73	0.13
74	0.17
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.76
109	0.73
110	0.73
111	0.66
112	0.61
113	0.65
114	0.59
115	0.49
116	0.43
117	0.36
118	0.32
119	0.31
120	0.29
121	0.23
122	0.28
123	0.36
124	0.42
125	0.52
126	0.55
127	0.63
128	0.71
129	0.75
130	0.79
131	0.77
132	0.75
133	0.73
134	0.75
135	0.73
136	0.71
137	0.65
138	0.55
139	0.48
140	0.42
141	0.34
142	0.25
143	0.19
144	0.12
145	0.11
146	0.12
147	0.14
148	0.14
149	0.17
150	0.19
151	0.21
152	0.21
153	0.21
154	0.21
155	0.19
156	0.17
157	0.14
158	0.11
159	0.09
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.08
171	0.09
172	0.11
173	0.15
174	0.19
175	0.19
176	0.22
177	0.23
178	0.28
179	0.32
180	0.3
181	0.27
182	0.27
183	0.32
184	0.29
185	0.29
186	0.24
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.16
204	0.25
205	0.26
206	0.26
207	0.31
208	0.33
209	0.33
210	0.32
211	0.38
212	0.35
213	0.43
214	0.45
215	0.42
216	0.46
217	0.45
218	0.42
219	0.34
220	0.28
221	0.19
222	0.19
223	0.17
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.09
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.07
249	0.08
250	0.11
251	0.13
252	0.13
253	0.17
254	0.19
255	0.23
256	0.25
257	0.25
258	0.24
259	0.27
260	0.27
261	0.23
262	0.27
263	0.24
264	0.25
265	0.28
266	0.28
267	0.24
268	0.28
269	0.35
270	0.35
271	0.39
272	0.36
273	0.38
274	0.42
275	0.42
276	0.42
277	0.34
278	0.28
279	0.23
280	0.23
281	0.17
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.19
286	0.23
287	0.29
288	0.3
289	0.35
290	0.39
291	0.48
292	0.46
293	0.49
294	0.52
295	0.46
296	0.45
297	0.45
298	0.43
299	0.36
300	0.4
301	0.37
302	0.31
303	0.38
304	0.38
305	0.35
306	0.36
307	0.34
308	0.3
309	0.29
310	0.28
311	0.21
312	0.21
313	0.18
314	0.13
315	0.13
316	0.11
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.1
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.15
328	0.17
329	0.17
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.16
334	0.16
335	0.17
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.09
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.12
357	0.15
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.15
362	0.15
363	0.14
364	0.09
365	0.05
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.12
390	0.15
391	0.14
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.14
396	0.13
397	0.11
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.08
403	0.09
404	0.12
405	0.14
406	0.2
407	0.26
408	0.28
409	0.37
410	0.39
411	0.43
412	0.49
413	0.58
414	0.62
415	0.66
416	0.71
417	0.71
418	0.76
419	0.77
420	0.77
421	0.74
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.57
426	0.6
427	0.64
428	0.66
429	0.69
430	0.71
431	0.73
432	0.76
433	0.79
434	0.77
435	0.74
436	0.73
437	0.71
438	0.73
439	0.78
440	0.82
441	0.81
442	0.79
443	0.78
444	0.76
445	0.75
446	0.71
447	0.7
448	0.69
449	0.63
450	0.58
451	0.51
452	0.45
453	0.37
454	0.31
455	0.21
456	0.11
457	0.08
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.08
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.16
471	0.14
472	0.17
473	0.19
474	0.18
475	0.15
476	0.15
477	0.14
478	0.15
479	0.15
480	0.12
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.08
485	0.09
486	0.11
487	0.14
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.18
492	0.18
493	0.17
494	0.15
495	0.12
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.03
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.1
525	0.19
526	0.28
527	0.36
528	0.37
529	0.44
530	0.52
531	0.59
532	0.63
533	0.64
534	0.63
535	0.62
536	0.66
537	0.6
538	0.52
539	0.45
540	0.36
541	0.27
542	0.2
543	0.15
544	0.1
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.08
552	0.07
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.1
557	0.1
558	0.13
559	0.14
560	0.2
561	0.2
562	0.2
563	0.2
564	0.19
565	0.19
566	0.17
567	0.14
568	0.1
569	0.11
570	0.11
571	0.13
572	0.13
573	0.13
574	0.12
575	0.14
576	0.15
577	0.18
578	0.18
579	0.2
580	0.24
581	0.31
582	0.39
583	0.43
584	0.45
585	0.46
586	0.54
587	0.52
588	0.57
589	0.55
590	0.49
591	0.48
592	0.47
593	0.44
594	0.36
595	0.35
596	0.28
597	0.26
598	0.24
599	0.19
600	0.15
601	0.13
602	0.12
603	0.09
604	0.07
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.14
615	0.17
616	0.16
617	0.19
618	0.2
619	0.25
620	0.28
621	0.3
622	0.28
623	0.24
624	0.24
625	0.21
626	0.2
627	0.15
628	0.12
629	0.09
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.08
644	0.11
645	0.13
646	0.15
647	0.17
648	0.22
649	0.23
650	0.22
651	0.21
652	0.2
653	0.18
654	0.18
655	0.16
656	0.1
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.08
661	0.07
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.1
667	0.11
668	0.11
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.14
673	0.15
674	0.13
675	0.1
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.09
680	0.07
681	0.07
682	0.06
683	0.07
684	0.08
685	0.08
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.14
691	0.14
692	0.13
693	0.16
694	0.15
695	0.17
696	0.18
697	0.16
698	0.15
699	0.14
700	0.14
701	0.16
702	0.17
703	0.15
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.12
708	0.12
709	0.1
710	0.09
711	0.12
712	0.15
713	0.15
714	0.2
715	0.28
716	0.37
717	0.43
718	0.45
719	0.44
720	0.43
721	0.44
722	0.4
723	0.38
724	0.3
725	0.26
726	0.29
727	0.29
728	0.28
729	0.26
730	0.25
731	0.2
732	0.19
733	0.17
734	0.11
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.1
739	0.1
740	0.1
741	0.1
742	0.18
743	0.18
744	0.17
745	0.18
746	0.18
747	0.2
748	0.25
749	0.25
750	0.19
751	0.21
752	0.21
753	0.22
754	0.23
755	0.2
756	0.22
757	0.22
758	0.25
759	0.27
760	0.35
761	0.42
762	0.49
763	0.57
764	0.56
765	0.61
766	0.62
767	0.64
768	0.57
769	0.52
770	0.46
771	0.39
772	0.37
773	0.32
774	0.26
775	0.22
776	0.22
777	0.18
778	0.18
779	0.19
780	0.13
781	0.15
782	0.17
783	0.18
784	0.22
785	0.24
786	0.24
787	0.23
788	0.23
789	0.2
790	0.18
791	0.18
792	0.12
793	0.09
794	0.08
795	0.08
796	0.07
797	0.07
798	0.06
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.06
803	0.06
804	0.06
805	0.07
806	0.08
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.11
811	0.13
812	0.16
813	0.18
814	0.18
815	0.16
816	0.18
817	0.21
818	0.27
819	0.3
820	0.3
821	0.29
822	0.32
823	0.38
824	0.39
825	0.43
826	0.4
827	0.35
828	0.4
829	0.43
830	0.43
831	0.38
832	0.36
833	0.37
834	0.37
835	0.39
836	0.38
837	0.37
838	0.33
839	0.34
840	0.41
841	0.34
842	0.32
843	0.33
844	0.32
845	0.38
846	0.41
847	0.39
848	0.4
849	0.44
850	0.52
851	0.52
852	0.53
853	0.46
854	0.49
855	0.5
856	0.44
857	0.44
858	0.35
859	0.33
860	0.31
861	0.34
862	0.3
863	0.29
864	0.29
865	0.31
866	0.31
867	0.29
868	0.28
869	0.25
870	0.27
871	0.28
872	0.27
873	0.22
874	0.22
875	0.22
876	0.19
877	0.18
878	0.13
879	0.12
880	0.12
881	0.13
882	0.15
883	0.16
884	0.19
885	0.25
886	0.26
887	0.28
888	0.29
889	0.29
890	0.28
891	0.31
892	0.3
893	0.32
894	0.3
895	0.3
896	0.28
897	0.28
898	0.28
899	0.25
900	0.24
901	0.23
902	0.29
903	0.28
904	0.33
905	0.32
906	0.38
907	0.41
908	0.45
909	0.41
910	0.41
911	0.43
912	0.38
913	0.42
914	0.37
915	0.34
916	0.34
917	0.38
918	0.37
919	0.38
920	0.39
921	0.4
922	0.42
923	0.45
924	0.5
925	0.53
926	0.56
927	0.56
928	0.56
929	0.55
930	0.49
931	0.44
932	0.34
933	0.27
934	0.2
935	0.15
936	0.13
937	0.09
938	0.09
939	0.1
940	0.11
941	0.13
942	0.14
943	0.16
944	0.23
945	0.3
946	0.33
947	0.39
948	0.44
949	0.48
950	0.53
951	0.6
952	0.63
953	0.63
954	0.63
955	0.58
956	0.53
957	0.5
958	0.48
959	0.45
960	0.41
961	0.37
962	0.37
963	0.38
964	0.41
965	0.39
966	0.38
967	0.41
968	0.45
969	0.48
970	0.5
971	0.52
972	0.51
973	0.47
974	0.48
975	0.43
976	0.37
977	0.3
978	0.26
979	0.2
980	0.19
981	0.19
982	0.15
983	0.12
984	0.09
985	0.08
986	0.1
987	0.11
988	0.1
989	0.12
990	0.13
991	0.12
992	0.13
993	0.17
994	0.17
995	0.23
996	0.23
997	0.24
998	0.27
999	0.32
1000	0.35
1001	0.4
1002	0.44
1003	0.46
1004	0.48
1005	0.49
1006	0.5
1007	0.52

C5FQ74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer