FuNGI

A0A4S4LMJ9

Protein Details

Accession

A0A4S4LMJ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-67	FGKPGAQKFSKPKDSEKKKKKCDYCKKSGHVKEECRKMKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-48	KPGAQKFSKPKDSEKKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 9, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

STDLVITQILVEEKTQRDPAAVAYAAKFGKPGAQKFSKPKDSEKKKKKCDYCKKSGHVKEECRKMKADNEAKAAEKPKELVAKIVTIDEPEPQALSFSLFMAEALATRQDVRTKWIVDSGASATMCSHRDWFMYYSPLSSPIKVWLGDERFINAIGKGRVSLNVPTGNGSTHNVVLVDVYYVPDLNGNLLSVSQFTNRGGHVNFVGSGCELSDARATVKVQARNRQGLYILDATVDTSKSALIAHLSPSSSDPPTPLVANFAGVDKVSKATLDTWHRRLGHVNFKSVLKMVRKGLVDGMEITGDKVSKHTCKPCFEGKHARTPIRTISEVDNPRLLHRIYADIVGPMQTVTRQGYRFSNNHVEAKSHYNMVRLQKTKEETADETRYVIERAEMETGQKLNFLRTDGGGEYDSTRFRQYLKSKGIHHEKTTAYTPQHNGVEERFNRTIFEMARTMLNDAGLPNSYWGDAVLYASYILNRTPTRALPNGITPYEAYTGNRPYLGHIRIFGCKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.24
4	0.24
5	0.24
6	0.25
7	0.26
8	0.25
9	0.22
10	0.2
11	0.25
12	0.24
13	0.24
14	0.21
15	0.16
16	0.22
17	0.27
18	0.31
19	0.35
20	0.42
21	0.49
22	0.59
23	0.69
24	0.72
25	0.69
26	0.75
27	0.77
28	0.8
29	0.84
30	0.85
31	0.86
32	0.87
33	0.94
34	0.93
35	0.94
36	0.94
37	0.93
38	0.93
39	0.92
40	0.9
41	0.9
42	0.88
43	0.86
44	0.85
45	0.85
46	0.83
47	0.84
48	0.82
49	0.74
50	0.69
51	0.62
52	0.6
53	0.6
54	0.59
55	0.55
56	0.54
57	0.54
58	0.53
59	0.55
60	0.53
61	0.45
62	0.39
63	0.34
64	0.33
65	0.37
66	0.35
67	0.34
68	0.31
69	0.3
70	0.29
71	0.29
72	0.24
73	0.19
74	0.19
75	0.17
76	0.16
77	0.14
78	0.14
79	0.11
80	0.12
81	0.1
82	0.11
83	0.1
84	0.08
85	0.09
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.1
96	0.13
97	0.14
98	0.19
99	0.24
100	0.25
101	0.25
102	0.28
103	0.27
104	0.23
105	0.25
106	0.22
107	0.2
108	0.18
109	0.17
110	0.14
111	0.17
112	0.17
113	0.16
114	0.16
115	0.13
116	0.14
117	0.17
118	0.19
119	0.18
120	0.21
121	0.2
122	0.2
123	0.19
124	0.24
125	0.22
126	0.2
127	0.19
128	0.19
129	0.21
130	0.2
131	0.21
132	0.23
133	0.24
134	0.26
135	0.25
136	0.22
137	0.2
138	0.21
139	0.2
140	0.14
141	0.15
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.13
146	0.14
147	0.16
148	0.17
149	0.16
150	0.18
151	0.18
152	0.18
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.14
158	0.11
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.1
184	0.11
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.08
194	0.08
195	0.06
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.1
203	0.1
204	0.15
205	0.21
206	0.26
207	0.3
208	0.37
209	0.41
210	0.45
211	0.45
212	0.4
213	0.35
214	0.3
215	0.29
216	0.22
217	0.17
218	0.12
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.1
236	0.12
237	0.11
238	0.11
239	0.1
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.05
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.07
258	0.13
259	0.2
260	0.26
261	0.28
262	0.34
263	0.34
264	0.35
265	0.39
266	0.39
267	0.41
268	0.38
269	0.38
270	0.34
271	0.34
272	0.34
273	0.3
274	0.29
275	0.22
276	0.23
277	0.22
278	0.25
279	0.25
280	0.25
281	0.25
282	0.22
283	0.19
284	0.16
285	0.15
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.06
292	0.07
293	0.11
294	0.15
295	0.21
296	0.28
297	0.33
298	0.37
299	0.42
300	0.49
301	0.51
302	0.54
303	0.59
304	0.54
305	0.59
306	0.62
307	0.6
308	0.53
309	0.5
310	0.48
311	0.42
312	0.4
313	0.31
314	0.29
315	0.35
316	0.36
317	0.35
318	0.34
319	0.29
320	0.29
321	0.3
322	0.26
323	0.19
324	0.17
325	0.18
326	0.15
327	0.16
328	0.15
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.1
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.08
337	0.1
338	0.14
339	0.14
340	0.17
341	0.22
342	0.28
343	0.29
344	0.33
345	0.4
346	0.39
347	0.43
348	0.42
349	0.38
350	0.35
351	0.39
352	0.34
353	0.29
354	0.27
355	0.25
356	0.3
357	0.36
358	0.42
359	0.39
360	0.4
361	0.43
362	0.46
363	0.46
364	0.44
365	0.4
366	0.36
367	0.4
368	0.42
369	0.35
370	0.32
371	0.3
372	0.28
373	0.24
374	0.2
375	0.14
376	0.11
377	0.12
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.16
382	0.17
383	0.16
384	0.18
385	0.17
386	0.16
387	0.17
388	0.18
389	0.16
390	0.16
391	0.19
392	0.16
393	0.18
394	0.16
395	0.15
396	0.16
397	0.17
398	0.18
399	0.17
400	0.18
401	0.17
402	0.18
403	0.27
404	0.3
405	0.38
406	0.45
407	0.5
408	0.53
409	0.63
410	0.71
411	0.68
412	0.65
413	0.62
414	0.55
415	0.54
416	0.52
417	0.48
418	0.41
419	0.41
420	0.41
421	0.41
422	0.42
423	0.39
424	0.37
425	0.34
426	0.41
427	0.36
428	0.42
429	0.37
430	0.35
431	0.34
432	0.33
433	0.35
434	0.27
435	0.29
436	0.23
437	0.22
438	0.24
439	0.24
440	0.24
441	0.2
442	0.18
443	0.15
444	0.13
445	0.14
446	0.13
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.1
463	0.15
464	0.15
465	0.19
466	0.22
467	0.26
468	0.32
469	0.35
470	0.38
471	0.36
472	0.42
473	0.45
474	0.41
475	0.39
476	0.33
477	0.31
478	0.3
479	0.28
480	0.23
481	0.24
482	0.28
483	0.28
484	0.3
485	0.26
486	0.3
487	0.37
488	0.38
489	0.35
490	0.35
491	0.36

A0A4S4LMJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer