FuNGI

A0A4S4MYX1

Protein Details

Accession

A0A4S4MYX1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
274-298	PDAQAVRKGKKRRLDKKKSSTTEAE	Hydrophilic
300-319	EKSKEKEKERESRKLKPRCY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
280-316	RKGKKRRLDKKKSSTTEAEVEKSKEKEKERESRKLKP

Subcellular Location(s)

plas 7, E.R. 6, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKLVTTFHSPSSVTSSLTCILTPDTEFGHLVVAKTNRIEVSAITGEGLRQECDLEIWGRVLTIRAVPVKRASGQCNNILVMTDHPDPRIIVLAYEKENGVSRLVDASSTSLHDRIARHAEFCNDVVVDPTGRIAVVSCYAGKLRILVFGEGVVEEEFDVTLPELNLLTLAFLHTAQDQYSLAIAHVDYLQRMQMISRDLNIESQELSPDISQILPSTVLSPAIFPFVDLAPILVPVPSFPLSASDEDKSEDRECPGGVLVVGGRKILFYEVAPPDAQAVRKGKKRRLDKKKSSTTEAEVEKSKEKEKERESRKLKPRCYVRWPWSEVMSSTTIDVKERKFLLGDKYGRMALLVLDGTPRLALLPIGETSPSTSLAYLSNQVVFVGSHLGPSQLLRIHQEIVGTSSGDTLPIPSGVAAVLSLSNPDGDDDDEGPIDNRKPKGIIIRNKGNHVEVLDTYRNIAPIMDAVLADTESSGQPQIVTCSGGASTGSLNIIRSGAEVKELATVEGLSCVTAIFPIRSRYESQTHSHLLISTSYESYILRLDGAETMTRLDSKNSPFVTTAPTLALSNISRRTTTNVGGKTTSSYVDSALVVQVTEKGIRVLEFDEDLGVFHVVGDGWSPQSLDHTWQGRDVVAASVNASQFVLAFRGGRLALFNLADGGIVKLIKFQDFLDAKHGPKEISSVSCVPFDWTKHFSLYIAISFWESRTVTILSLEKPDRYMTPICTTSELPSLPRSVILHNFGSGNKYKDEDYQPFVLAGLTDGTVVSFAFRNNQLLDKKVFGLGITPATLSSCLVEGRHAIFASGSRAAILHWDRKRLRQSAVMLKDIVTGVSLNTSSFPSALVTATSSGLIIGQVGGVDQMQVRSILLGSDNPTRIAHDLVTNMFGVACLHTSPNRVGDAETIESSFNIFDGNFRRLAQYTCGADEEITAIATSTTLSVSIGGRQHSCFLVGSVRHQLGQPEPKLGGLMVFVASPSGGSIQPLVSTKTDGCVYGIAALDNFIVAAVNTAIILYRINSTEDEDGLVLEQLSQWNHNYFITSLVAREGNIIAGDAISSVTVLNIQDTVLKTVVRDFAPLWPVAVEMTRNSGIVGADCDCNLFTFSMGTSGTRTVLERDGSYHVGEVINKFLPGGIGAPDSCEDTQFQPEHLFFTSSGRIGQTVQVADDVALHLTALQRNMAKVIKGPGDVSHTKTRAPTSPRGRTDAEFAFGFLDGDFLESFLVDSRQAQFLQGEFEVEHVGLQLSEAEALLEKLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.25
4	0.25
5	0.23
6	0.17
7	0.17
8	0.18
9	0.18
10	0.17
11	0.16
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.19
16	0.18
17	0.17
18	0.22
19	0.23
20	0.23
21	0.24
22	0.27
23	0.22
24	0.23
25	0.23
26	0.17
27	0.21
28	0.2
29	0.19
30	0.17
31	0.17
32	0.16
33	0.19
34	0.2
35	0.14
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.16
41	0.14
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.17
51	0.23
52	0.25
53	0.28
54	0.33
55	0.36
56	0.41
57	0.44
58	0.46
59	0.49
60	0.53
61	0.55
62	0.54
63	0.5
64	0.43
65	0.39
66	0.33
67	0.25
68	0.26
69	0.25
70	0.23
71	0.23
72	0.24
73	0.23
74	0.23
75	0.25
76	0.19
77	0.16
78	0.19
79	0.23
80	0.24
81	0.26
82	0.24
83	0.21
84	0.24
85	0.23
86	0.2
87	0.16
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.14
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.15
96	0.17
97	0.15
98	0.16
99	0.2
100	0.2
101	0.25
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.33
106	0.35
107	0.35
108	0.34
109	0.3
110	0.21
111	0.2
112	0.2
113	0.19
114	0.16
115	0.13
116	0.13
117	0.1
118	0.1
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.1
123	0.11
124	0.11
125	0.13
126	0.14
127	0.15
128	0.14
129	0.15
130	0.14
131	0.17
132	0.19
133	0.18
134	0.17
135	0.16
136	0.17
137	0.14
138	0.15
139	0.09
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.05
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.05
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.1
180	0.12
181	0.16
182	0.16
183	0.17
184	0.19
185	0.19
186	0.21
187	0.22
188	0.2
189	0.16
190	0.16
191	0.15
192	0.13
193	0.14
194	0.11
195	0.11
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.09
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.09
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.1
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.1
216	0.1
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.13
228	0.15
229	0.18
230	0.21
231	0.18
232	0.18
233	0.2
234	0.21
235	0.22
236	0.22
237	0.21
238	0.2
239	0.2
240	0.19
241	0.18
242	0.18
243	0.14
244	0.12
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.11
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.07
256	0.15
257	0.16
258	0.18
259	0.18
260	0.18
261	0.2
262	0.21
263	0.22
264	0.2
265	0.26
266	0.31
267	0.39
268	0.48
269	0.52
270	0.59
271	0.7
272	0.74
273	0.78
274	0.83
275	0.86
276	0.89
277	0.92
278	0.89
279	0.85
280	0.79
281	0.72
282	0.68
283	0.6
284	0.52
285	0.45
286	0.42
287	0.4
288	0.38
289	0.39
290	0.38
291	0.41
292	0.47
293	0.52
294	0.59
295	0.62
296	0.7
297	0.71
298	0.75
299	0.8
300	0.8
301	0.78
302	0.77
303	0.78
304	0.76
305	0.79
306	0.79
307	0.77
308	0.76
309	0.75
310	0.68
311	0.62
312	0.55
313	0.46
314	0.39
315	0.32
316	0.23
317	0.19
318	0.19
319	0.16
320	0.17
321	0.2
322	0.18
323	0.22
324	0.22
325	0.22
326	0.21
327	0.24
328	0.28
329	0.33
330	0.35
331	0.31
332	0.32
333	0.32
334	0.3
335	0.27
336	0.21
337	0.12
338	0.1
339	0.08
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.11
368	0.11
369	0.09
370	0.08
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.12
379	0.1
380	0.11
381	0.13
382	0.14
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.16
423	0.16
424	0.16
425	0.17
426	0.2
427	0.29
428	0.36
429	0.43
430	0.46
431	0.55
432	0.57
433	0.6
434	0.59
435	0.5
436	0.42
437	0.33
438	0.27
439	0.18
440	0.21
441	0.18
442	0.17
443	0.18
444	0.17
445	0.16
446	0.14
447	0.13
448	0.08
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.07
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.07
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.07
504	0.11
505	0.12
506	0.15
507	0.18
508	0.21
509	0.26
510	0.28
511	0.29
512	0.31
513	0.31
514	0.3
515	0.28
516	0.24
517	0.2
518	0.17
519	0.16
520	0.12
521	0.1
522	0.09
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.07
528	0.06
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.06
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.08
539	0.09
540	0.12
541	0.14
542	0.21
543	0.2
544	0.21
545	0.21
546	0.21
547	0.23
548	0.2
549	0.19
550	0.13
551	0.13
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.09
556	0.12
557	0.15
558	0.15
559	0.15
560	0.16
561	0.2
562	0.2
563	0.24
564	0.27
565	0.25
566	0.26
567	0.26
568	0.25
569	0.23
570	0.21
571	0.18
572	0.12
573	0.11
574	0.09
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.04
600	0.03
601	0.04
602	0.03
603	0.03
604	0.04
605	0.03
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.06
611	0.07
612	0.09
613	0.12
614	0.15
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.15
619	0.14
620	0.12
621	0.09
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.08
626	0.08
627	0.08
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.15
658	0.16
659	0.17
660	0.21
661	0.23
662	0.23
663	0.25
664	0.26
665	0.18
666	0.17
667	0.18
668	0.14
669	0.13
670	0.15
671	0.14
672	0.15
673	0.15
674	0.15
675	0.15
676	0.16
677	0.15
678	0.17
679	0.18
680	0.18
681	0.18
682	0.19
683	0.17
684	0.17
685	0.16
686	0.12
687	0.1
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.1
693	0.09
694	0.08
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.12
699	0.13
700	0.11
701	0.16
702	0.17
703	0.15
704	0.15
705	0.16
706	0.15
707	0.17
708	0.18
709	0.16
710	0.2
711	0.22
712	0.21
713	0.23
714	0.23
715	0.21
716	0.22
717	0.19
718	0.16
719	0.15
720	0.16
721	0.13
722	0.14
723	0.13
724	0.13
725	0.15
726	0.18
727	0.16
728	0.16
729	0.17
730	0.16
731	0.18
732	0.19
733	0.18
734	0.15
735	0.16
736	0.16
737	0.2
738	0.26
739	0.26
740	0.27
741	0.26
742	0.26
743	0.25
744	0.24
745	0.19
746	0.13
747	0.1
748	0.07
749	0.05
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.05
757	0.05
758	0.08
759	0.09
760	0.11
761	0.11
762	0.17
763	0.18
764	0.2
765	0.22
766	0.2
767	0.2
768	0.19
769	0.18
770	0.13
771	0.13
772	0.11
773	0.1
774	0.09
775	0.08
776	0.07
777	0.08
778	0.08
779	0.07
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.08
786	0.09
787	0.11
788	0.1
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.12
793	0.11
794	0.1
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.14
799	0.16
800	0.22
801	0.23
802	0.32
803	0.34
804	0.41
805	0.48
806	0.46
807	0.47
808	0.45
809	0.49
810	0.5
811	0.52
812	0.47
813	0.41
814	0.37
815	0.35
816	0.28
817	0.22
818	0.12
819	0.08
820	0.06
821	0.07
822	0.07
823	0.05
824	0.06
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.08
837	0.07
838	0.06
839	0.06
840	0.05
841	0.05
842	0.03
843	0.03
844	0.03
845	0.03
846	0.03
847	0.03
848	0.04
849	0.04
850	0.04
851	0.05
852	0.05
853	0.05
854	0.05
855	0.05
856	0.05
857	0.06
858	0.07
859	0.09
860	0.14
861	0.15
862	0.16
863	0.16
864	0.17
865	0.17
866	0.17
867	0.15
868	0.12
869	0.13
870	0.13
871	0.14
872	0.13
873	0.11
874	0.1
875	0.09
876	0.08
877	0.06
878	0.06
879	0.06
880	0.07
881	0.09
882	0.11
883	0.13
884	0.15
885	0.15
886	0.15
887	0.15
888	0.15
889	0.17
890	0.17
891	0.16
892	0.14
893	0.13
894	0.13
895	0.12
896	0.11
897	0.07
898	0.06
899	0.05
900	0.08
901	0.12
902	0.14
903	0.15
904	0.16
905	0.18
906	0.19
907	0.21
908	0.21
909	0.23
910	0.22
911	0.22
912	0.22
913	0.2
914	0.19
915	0.17
916	0.15
917	0.09
918	0.08
919	0.06
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.05
924	0.04
925	0.04
926	0.04
927	0.04
928	0.06
929	0.06
930	0.1
931	0.12
932	0.14
933	0.16
934	0.17
935	0.18
936	0.17
937	0.18
938	0.14
939	0.13
940	0.16
941	0.16
942	0.18
943	0.23
944	0.23
945	0.23
946	0.23
947	0.25
948	0.26
949	0.34
950	0.32
951	0.28
952	0.28
953	0.27
954	0.27
955	0.24
956	0.18
957	0.1
958	0.09
959	0.06
960	0.06
961	0.06
962	0.05
963	0.05
964	0.05
965	0.05
966	0.06
967	0.05
968	0.06
969	0.07
970	0.07
971	0.09
972	0.11
973	0.13
974	0.12
975	0.14
976	0.14
977	0.16
978	0.17
979	0.15
980	0.15
981	0.13
982	0.12
983	0.13
984	0.13
985	0.1
986	0.09
987	0.09
988	0.08
989	0.07
990	0.07
991	0.04
992	0.04
993	0.03
994	0.04
995	0.04
996	0.04
997	0.04
998	0.04
999	0.04
1000	0.05
1001	0.05
1002	0.05
1003	0.07
1004	0.08
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.15
1010	0.15
1011	0.13
1012	0.12
1013	0.11
1014	0.11
1015	0.07
1016	0.06
1017	0.07
1018	0.08
1019	0.09
1020	0.11
1021	0.12
1022	0.14
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.14
1027	0.16
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.14
1031	0.15
1032	0.15
1033	0.13
1034	0.15
1035	0.12
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.06
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.04
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.04
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.1
1054	0.11
1055	0.14
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.17
1060	0.21
1061	0.18
1062	0.19
1063	0.17
1064	0.21
1065	0.24
1066	0.24
1067	0.21
1068	0.17
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.16
1072	0.12
1073	0.09
1074	0.15
1075	0.15
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.14
1080	0.13
1081	0.15
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.11
1087	0.12
1088	0.12
1089	0.1
1090	0.08
1091	0.08
1092	0.09
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.11
1096	0.11
1097	0.12
1098	0.13
1099	0.13
1100	0.14
1101	0.15
1102	0.18
1103	0.2
1104	0.18
1105	0.2
1106	0.24
1107	0.24
1108	0.24
1109	0.21
1110	0.19
1111	0.18
1112	0.2
1113	0.18
1114	0.18
1115	0.17
1116	0.16
1117	0.16
1118	0.15
1119	0.13
1120	0.12
1121	0.12
1122	0.09
1123	0.1
1124	0.1
1125	0.12
1126	0.13
1127	0.16
1128	0.16
1129	0.15
1130	0.16
1131	0.16
1132	0.23
1133	0.22
1134	0.23
1135	0.24
1136	0.24
1137	0.26
1138	0.26
1139	0.25
1140	0.19
1141	0.23
1142	0.25
1143	0.21
1144	0.22
1145	0.2
1146	0.2
1147	0.19
1148	0.22
1149	0.21
1150	0.18
1151	0.18
1152	0.17
1153	0.16
1154	0.15
1155	0.15
1156	0.12
1157	0.08
1158	0.07
1159	0.07
1160	0.07
1161	0.1
1162	0.12
1163	0.13
1164	0.16
1165	0.17
1166	0.18
1167	0.22
1168	0.24
1169	0.22
1170	0.23
1171	0.29
1172	0.29
1173	0.29
1174	0.3
1175	0.28
1176	0.33
1177	0.36
1178	0.38
1179	0.41
1180	0.38
1181	0.4
1182	0.43
1183	0.45
1184	0.45
1185	0.49
1186	0.53
1187	0.54
1188	0.63
1189	0.66
1190	0.67
1191	0.66
1192	0.6
1193	0.6
1194	0.52
1195	0.46
1196	0.35
1197	0.31
1198	0.26
1199	0.22
1200	0.2
1201	0.13
1202	0.11
1203	0.07
1204	0.09
1205	0.08
1206	0.07
1207	0.07
1208	0.06
1209	0.07
1210	0.08
1211	0.09
1212	0.08
1213	0.11
1214	0.14
1215	0.17
1216	0.17
1217	0.19
1218	0.19
1219	0.19
1220	0.23
1221	0.2
1222	0.19
1223	0.16
1224	0.17
1225	0.16
1226	0.14
1227	0.13
1228	0.09
1229	0.09
1230	0.07
1231	0.08
1232	0.07
1233	0.06
1234	0.07
1235	0.07
1236	0.07
1237	0.07
1238	0.08
1239	0.09
1240	0.08

A0A4S4MYX1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer