Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N1Z9

Protein Details
Accession A0A4S4N1Z9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
701-726SGPATQKSNKRSRKPWEPPKVKTLTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-304RGRRGRDRGGRGGRGGRGGRGGGGRS
360-383WSKRGGGGGRGGGRGGRGGGADRG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MSTIRDHDTTEDLERSSKRRKVESYDVADLEDVAMEDATTSANDLASAAKPAETVEGKAVLPPSHAMLGKAPVFEEDGSLRISETDVGISEYVGFDVPRIEGIIKQRFTDFLVYEVDLDGNVIHVKSLDKPESARKKDDSKGKAKADGPSVPATEASAEAIVDTAPDAVAEDTSAPQASTPVTEEVTTNPASSAETPVVPPVDNEPWPERFDIALKPFFSEGVLGKVKALYLEGPEPPLVSDSGWGGRQAKVPTEAEGATEPVAEEQPEDTPAPSSSDRGRRGRDRGGRGGRGGRGGRGGGGRSSWREDTRKVLSDPIASKATRTGLHQVIRELFNGKLETETDLTAPASDDGSRIVIKWSKRGGGGGRGGGRGGRGGGADRGGGRDSGERQSYPPYIHFTMQKTNRDTQDALSHLCRSLRCNIKDLSVAGTKDKRGVTVQRVSLKRGNKQVEQVWKLANGVGPRRTAQEAVNQRGERGIRVADFKYSKASLELGMLKGNAFVITLRNVQVDSMDTLDRAMDIIKTKGFINYYGMQRFGTASIPTHSIGLALLKSDWHLAVSLILGKRPGEHPEVEAARDAWLVQGDLDRALEMMPRRVVAERCILESYQKQGGETRNAMGALSTIPRNLRLMYVHAYQSYVWNAIVSERIRIHGVDKPVVGDLVFEAESEDPDIAVDATEGVLEVDGAEDPKAAEDAGESGPATQKSNKRSRKPWEPPKVKTLTEADLHRHSIFDVIMPLPGRDVAFPGGSLGERYREFLKTDGLDPDNFERKQKEYSLGGSYRKILHLPKELSWSVLKYTDPDVSLAQADEDKLLGFDPPAIVEDGKFIALQIELQLGTAAYATMALREVTKTETSSYFQTQLTQLSEDQKYKASAESAEAEAELEAGAGES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.43
4 0.45
5 0.47
6 0.53
7 0.59
8 0.62
9 0.69
10 0.72
11 0.7
12 0.73
13 0.66
14 0.59
15 0.51
16 0.42
17 0.32
18 0.22
19 0.14
20 0.07
21 0.07
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.06
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.2
44 0.2
45 0.22
46 0.24
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.25
56 0.26
57 0.25
58 0.23
59 0.19
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.15
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.21
90 0.3
91 0.3
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.33
96 0.34
97 0.26
98 0.2
99 0.21
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.11
105 0.11
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.13
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.27
118 0.37
119 0.47
120 0.52
121 0.53
122 0.52
123 0.56
124 0.62
125 0.68
126 0.67
127 0.65
128 0.7
129 0.68
130 0.69
131 0.65
132 0.63
133 0.6
134 0.54
135 0.49
136 0.43
137 0.4
138 0.33
139 0.29
140 0.24
141 0.19
142 0.15
143 0.12
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.17
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.24
193 0.26
194 0.28
195 0.28
196 0.24
197 0.2
198 0.22
199 0.24
200 0.25
201 0.27
202 0.26
203 0.27
204 0.26
205 0.25
206 0.22
207 0.19
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.09
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.11
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.22
243 0.19
244 0.18
245 0.17
246 0.12
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.14
262 0.16
263 0.2
264 0.28
265 0.35
266 0.4
267 0.46
268 0.49
269 0.55
270 0.62
271 0.64
272 0.63
273 0.66
274 0.67
275 0.64
276 0.6
277 0.59
278 0.51
279 0.48
280 0.42
281 0.33
282 0.27
283 0.24
284 0.22
285 0.19
286 0.19
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.2
292 0.21
293 0.24
294 0.27
295 0.28
296 0.33
297 0.36
298 0.38
299 0.35
300 0.35
301 0.32
302 0.34
303 0.34
304 0.31
305 0.29
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.23
310 0.19
311 0.2
312 0.22
313 0.24
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.29
318 0.29
319 0.27
320 0.23
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.15
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.1
344 0.13
345 0.14
346 0.19
347 0.21
348 0.22
349 0.22
350 0.25
351 0.24
352 0.26
353 0.28
354 0.26
355 0.26
356 0.24
357 0.23
358 0.2
359 0.18
360 0.12
361 0.1
362 0.07
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.19
380 0.2
381 0.2
382 0.19
383 0.21
384 0.21
385 0.22
386 0.25
387 0.24
388 0.31
389 0.36
390 0.4
391 0.39
392 0.42
393 0.42
394 0.41
395 0.39
396 0.32
397 0.31
398 0.26
399 0.24
400 0.21
401 0.2
402 0.17
403 0.19
404 0.18
405 0.15
406 0.22
407 0.28
408 0.28
409 0.31
410 0.32
411 0.31
412 0.32
413 0.3
414 0.26
415 0.21
416 0.2
417 0.19
418 0.21
419 0.19
420 0.22
421 0.21
422 0.18
423 0.18
424 0.22
425 0.25
426 0.28
427 0.32
428 0.36
429 0.37
430 0.39
431 0.42
432 0.41
433 0.4
434 0.43
435 0.43
436 0.38
437 0.41
438 0.42
439 0.45
440 0.44
441 0.41
442 0.33
443 0.29
444 0.28
445 0.24
446 0.21
447 0.14
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.18
453 0.18
454 0.18
455 0.17
456 0.22
457 0.26
458 0.29
459 0.35
460 0.33
461 0.32
462 0.33
463 0.32
464 0.24
465 0.19
466 0.16
467 0.1
468 0.13
469 0.14
470 0.16
471 0.17
472 0.17
473 0.18
474 0.18
475 0.17
476 0.15
477 0.15
478 0.11
479 0.12
480 0.14
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.09
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.07
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.15
518 0.18
519 0.22
520 0.23
521 0.23
522 0.21
523 0.21
524 0.2
525 0.17
526 0.14
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.11
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.06
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.1
550 0.09
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.13
556 0.16
557 0.15
558 0.16
559 0.17
560 0.22
561 0.23
562 0.22
563 0.21
564 0.18
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.08
580 0.08
581 0.11
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.16
586 0.17
587 0.17
588 0.24
589 0.21
590 0.23
591 0.24
592 0.23
593 0.23
594 0.24
595 0.26
596 0.23
597 0.23
598 0.21
599 0.24
600 0.28
601 0.3
602 0.29
603 0.26
604 0.23
605 0.23
606 0.22
607 0.17
608 0.14
609 0.09
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.11
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.13
619 0.16
620 0.18
621 0.21
622 0.21
623 0.2
624 0.21
625 0.19
626 0.2
627 0.18
628 0.15
629 0.12
630 0.11
631 0.1
632 0.1
633 0.15
634 0.13
635 0.16
636 0.15
637 0.17
638 0.17
639 0.18
640 0.2
641 0.19
642 0.22
643 0.21
644 0.21
645 0.2
646 0.2
647 0.19
648 0.17
649 0.12
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.08
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.07
685 0.08
686 0.09
687 0.08
688 0.09
689 0.13
690 0.14
691 0.16
692 0.2
693 0.25
694 0.34
695 0.45
696 0.54
697 0.59
698 0.68
699 0.75
700 0.8
701 0.85
702 0.87
703 0.88
704 0.88
705 0.84
706 0.84
707 0.81
708 0.7
709 0.64
710 0.57
711 0.5
712 0.46
713 0.44
714 0.39
715 0.37
716 0.4
717 0.34
718 0.3
719 0.26
720 0.23
721 0.2
722 0.16
723 0.14
724 0.11
725 0.14
726 0.14
727 0.14
728 0.12
729 0.14
730 0.13
731 0.1
732 0.12
733 0.12
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.11
741 0.14
742 0.14
743 0.17
744 0.19
745 0.2
746 0.22
747 0.22
748 0.26
749 0.24
750 0.27
751 0.3
752 0.3
753 0.28
754 0.3
755 0.35
756 0.37
757 0.36
758 0.37
759 0.34
760 0.35
761 0.4
762 0.4
763 0.39
764 0.35
765 0.38
766 0.42
767 0.44
768 0.45
769 0.42
770 0.42
771 0.39
772 0.37
773 0.37
774 0.34
775 0.36
776 0.41
777 0.43
778 0.42
779 0.47
780 0.46
781 0.44
782 0.42
783 0.36
784 0.3
785 0.29
786 0.26
787 0.21
788 0.24
789 0.25
790 0.23
791 0.22
792 0.2
793 0.2
794 0.2
795 0.18
796 0.16
797 0.13
798 0.13
799 0.11
800 0.11
801 0.09
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.07
806 0.08
807 0.08
808 0.08
809 0.1
810 0.11
811 0.11
812 0.11
813 0.13
814 0.12
815 0.12
816 0.12
817 0.1
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.08
822 0.1
823 0.09
824 0.09
825 0.09
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.06
830 0.04
831 0.06
832 0.05
833 0.06
834 0.07
835 0.07
836 0.09
837 0.1
838 0.11
839 0.14
840 0.17
841 0.17
842 0.2
843 0.23
844 0.24
845 0.29
846 0.32
847 0.32
848 0.3
849 0.32
850 0.3
851 0.31
852 0.31
853 0.29
854 0.27
855 0.31
856 0.36
857 0.35
858 0.35
859 0.35
860 0.34
861 0.33
862 0.33
863 0.28
864 0.24
865 0.25
866 0.27
867 0.24
868 0.23
869 0.21
870 0.19
871 0.16
872 0.14
873 0.1
874 0.06