FuNGI

C5FBI1

Protein Details

Accession

C5FBI1

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-77	RRERDGSRDRDRDRDRRRRDRSRDRRRERDVDGDE	Basic
86-121	RASANGSHRSRKRSRSRDSERKRSRRDRDRGDDAYR	Basic
159-188	GDDRDDDKRRSRRDRDGRRRSPSNSRRPSK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-73	DRDGRRERDGSRDRDRDRDRRRRDRSRDRRRERDV
78-115	EMKSPKSDRASANGSHRSRKRSRSRDSERKRSRRDRDR
153-188	GRPRRDGDDRDDDKRRSRRDRDGRRRSPSNSRRPSK
477-481	RKAPK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSGIDVEALLDSTADPGPNATKPSGTSDQKDHDIEKKTDRDGRRERDGSRDRDRDRDRRRRDRSRDRRRERDVDGDEEMKSPKSDRASANGSHRSRKRSRSRDSERKRSRRDRDRGDDAYRSSGGGGDFYRGGGRTRSRSRSPLDDRYYRPTGRPRRDGDDRDDDKRRSRRDRDGRRRSPSNSRRPSKTPEPQLTEDERDRRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKIGPVKEAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVPLAIQLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARNPDSHANSNHQAIPFHRLYVGNIHFSITESDLQNVFEPFGELDFVQLQREEAGRSKGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFSHDPAQLMQRLQQQGHNQGSSYSHHGGRGANSGGSSGGNFDRAGGRDNDKGAGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAAEPAPDEKRKAPKARTEAKPLPVTVNMASRCVLLRNMFDPAQEEGESWVKELEDDVRAECEEKYGHVVHISLDPNTQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQISAQPVVDAVYSSLFSRTKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.08
3	0.1
4	0.14
5	0.16
6	0.2
7	0.19
8	0.2
9	0.22
10	0.3
11	0.37
12	0.39
13	0.41
14	0.45
15	0.49
16	0.53
17	0.55
18	0.51
19	0.49
20	0.51
21	0.51
22	0.53
23	0.53
24	0.54
25	0.59
26	0.61
27	0.64
28	0.66
29	0.69
30	0.71
31	0.72
32	0.67
33	0.7
34	0.73
35	0.71
36	0.71
37	0.73
38	0.67
39	0.71
40	0.78
41	0.77
42	0.8
43	0.82
44	0.83
45	0.84
46	0.91
47	0.91
48	0.93
49	0.94
50	0.94
51	0.95
52	0.96
53	0.95
54	0.95
55	0.93
56	0.9
57	0.85
58	0.84
59	0.77
60	0.71
61	0.65
62	0.56
63	0.48
64	0.42
65	0.37
66	0.28
67	0.24
68	0.21
69	0.21
70	0.24
71	0.29
72	0.29
73	0.35
74	0.38
75	0.43
76	0.5
77	0.55
78	0.54
79	0.57
80	0.6
81	0.63
82	0.66
83	0.71
84	0.73
85	0.74
86	0.8
87	0.82
88	0.87
89	0.89
90	0.91
91	0.92
92	0.92
93	0.92
94	0.93
95	0.93
96	0.93
97	0.93
98	0.93
99	0.92
100	0.9
101	0.88
102	0.85
103	0.8
104	0.74
105	0.65
106	0.6
107	0.49
108	0.4
109	0.31
110	0.25
111	0.19
112	0.16
113	0.14
114	0.12
115	0.11
116	0.11
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.17
121	0.21
122	0.28
123	0.37
124	0.44
125	0.47
126	0.53
127	0.56
128	0.61
129	0.64
130	0.65
131	0.64
132	0.65
133	0.64
134	0.65
135	0.67
136	0.58
137	0.56
138	0.56
139	0.59
140	0.61
141	0.65
142	0.63
143	0.64
144	0.72
145	0.71
146	0.68
147	0.68
148	0.64
149	0.62
150	0.65
151	0.6
152	0.6
153	0.63
154	0.65
155	0.64
156	0.67
157	0.71
158	0.75
159	0.83
160	0.86
161	0.89
162	0.89
163	0.88
164	0.87
165	0.82
166	0.82
167	0.81
168	0.81
169	0.8
170	0.77
171	0.75
172	0.73
173	0.76
174	0.75
175	0.74
176	0.72
177	0.7
178	0.7
179	0.66
180	0.67
181	0.63
182	0.58
183	0.54
184	0.5
185	0.43
186	0.39
187	0.37
188	0.32
189	0.29
190	0.3
191	0.27
192	0.26
193	0.29
194	0.27
195	0.32
196	0.33
197	0.34
198	0.29
199	0.27
200	0.24
201	0.21
202	0.2
203	0.18
204	0.17
205	0.18
206	0.2
207	0.21
208	0.19
209	0.2
210	0.21
211	0.18
212	0.18
213	0.15
214	0.12
215	0.12
216	0.17
217	0.16
218	0.17
219	0.24
220	0.25
221	0.25
222	0.3
223	0.3
224	0.3
225	0.32
226	0.32
227	0.27
228	0.31
229	0.3
230	0.25
231	0.26
232	0.24
233	0.24
234	0.25
235	0.26
236	0.21
237	0.21
238	0.21
239	0.19
240	0.16
241	0.14
242	0.11
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.14
268	0.19
269	0.22
270	0.25
271	0.27
272	0.29
273	0.35
274	0.38
275	0.4
276	0.4
277	0.42
278	0.41
279	0.41
280	0.38
281	0.34
282	0.31
283	0.26
284	0.23
285	0.18
286	0.23
287	0.18
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.21
293	0.22
294	0.17
295	0.17
296	0.17
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.13
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.17
330	0.17
331	0.23
332	0.22
333	0.2
334	0.27
335	0.29
336	0.29
337	0.35
338	0.35
339	0.31
340	0.31
341	0.32
342	0.26
343	0.26
344	0.28
345	0.19
346	0.21
347	0.19
348	0.18
349	0.16
350	0.15
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.13
362	0.15
363	0.19
364	0.21
365	0.22
366	0.25
367	0.25
368	0.25
369	0.26
370	0.2
371	0.16
372	0.15
373	0.22
374	0.21
375	0.21
376	0.25
377	0.28
378	0.31
379	0.31
380	0.34
381	0.31
382	0.36
383	0.39
384	0.35
385	0.29
386	0.27
387	0.28
388	0.26
389	0.27
390	0.23
391	0.2
392	0.2
393	0.22
394	0.22
395	0.22
396	0.24
397	0.19
398	0.16
399	0.15
400	0.15
401	0.13
402	0.12
403	0.1
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.12
410	0.12
411	0.15
412	0.16
413	0.19
414	0.2
415	0.22
416	0.22
417	0.19
418	0.18
419	0.16
420	0.13
421	0.09
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.11
440	0.11
441	0.15
442	0.15
443	0.17
444	0.25
445	0.27
446	0.27
447	0.3
448	0.32
449	0.31
450	0.34
451	0.36
452	0.32
453	0.3
454	0.31
455	0.28
456	0.26
457	0.24
458	0.23
459	0.26
460	0.26
461	0.26
462	0.31
463	0.4
464	0.49
465	0.57
466	0.6
467	0.62
468	0.69
469	0.76
470	0.76
471	0.77
472	0.75
473	0.73
474	0.7
475	0.62
476	0.56
477	0.47
478	0.43
479	0.35
480	0.35
481	0.29
482	0.26
483	0.25
484	0.22
485	0.22
486	0.2
487	0.21
488	0.17
489	0.19
490	0.19
491	0.24
492	0.23
493	0.23
494	0.24
495	0.23
496	0.23
497	0.2
498	0.19
499	0.18
500	0.22
501	0.22
502	0.19
503	0.18
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.14
509	0.15
510	0.15
511	0.16
512	0.17
513	0.18
514	0.17
515	0.16
516	0.14
517	0.14
518	0.18
519	0.17
520	0.18
521	0.18
522	0.18
523	0.17
524	0.23
525	0.23
526	0.19
527	0.19
528	0.19
529	0.18
530	0.19
531	0.17
532	0.12
533	0.12
534	0.13
535	0.18
536	0.21
537	0.22
538	0.22
539	0.24
540	0.27
541	0.26
542	0.27
543	0.24
544	0.27
545	0.28
546	0.27
547	0.27
548	0.24
549	0.23
550	0.21
551	0.22
552	0.19
553	0.17
554	0.19
555	0.19
556	0.19
557	0.26
558	0.28
559	0.26
560	0.25
561	0.28
562	0.3
563	0.31
564	0.31
565	0.24
566	0.2
567	0.2
568	0.17
569	0.14
570	0.11
571	0.1
572	0.1
573	0.11
574	0.15
575	0.15

C5FBI1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer