FuNGI

A0A4S4MR21

Protein Details

Accession

A0A4S4MR21

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-38	AELRRQKEFRLKKKTGIRSAAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-44	RQKEFRLKKKTGIRSAAALTPKRR

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10, plas 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010920 LSM_dom_sf IPR016654 U6_snRNA_Lsm2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006397 P:mRNA processing
CDD	cd01725 LSm2

Amino Acid Sequences

MAKAEEQRIQELQAEIAELRRQKEFRLKKKTGIRSAAALTPKRRTPTSKLKSASLLSPSSPDAAEHSFWNTPAAAARTLHFSDDSLLTDEHMDLSAPSLASPLMASGSKPPLRAKPPPVTAARQLSFELSPRDDWKTREAVEETGFDDSFEHIGAPVDDTIQQDDADDADDDDDDEDDKTVMFKKPLPPVNAEVTFELPSPPPAPSVAHVQPNPKKQKYKITEEMEGVVLKIWMTMGEVVMPANPFDLTGSGIGVKPPRAKETLAHLQQLSLQITSPGSPTTSVSSATSATQSQPAATTQQILIAHVLLALLAAPPSYSMSLNKLKENLAEKNGGVTAQAVTRPIYSCVAKRLLKIERGGGEQVVSQAQGSSNVVPNNALYFLQPLRVCASLLLIFSVFKTLTDQTVTVELKNDLSITGVLKSVDQLRLPLCTLSSSKLTAFLVVLRRFLNIRLDSIKVLDEARHPHMMAVKNCFIRGSVVRYVQLPSDRVDTQLLEDATRREASGQAKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.16
3	0.18
4	0.21
5	0.21
6	0.22
7	0.28
8	0.29
9	0.34
10	0.44
11	0.52
12	0.58
13	0.65
14	0.68
15	0.7
16	0.8
17	0.84
18	0.83
19	0.8
20	0.72
21	0.67
22	0.65
23	0.61
24	0.59
25	0.55
26	0.5
27	0.5
28	0.52
29	0.52
30	0.54
31	0.54
32	0.56
33	0.61
34	0.64
35	0.67
36	0.65
37	0.64
38	0.64
39	0.6
40	0.56
41	0.5
42	0.43
43	0.35
44	0.34
45	0.31
46	0.27
47	0.24
48	0.19
49	0.18
50	0.19
51	0.19
52	0.18
53	0.21
54	0.2
55	0.21
56	0.22
57	0.18
58	0.15
59	0.18
60	0.19
61	0.17
62	0.17
63	0.18
64	0.22
65	0.22
66	0.23
67	0.2
68	0.17
69	0.18
70	0.18
71	0.19
72	0.16
73	0.15
74	0.14
75	0.15
76	0.14
77	0.12
78	0.11
79	0.09
80	0.06
81	0.08
82	0.09
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.11
94	0.2
95	0.22
96	0.24
97	0.28
98	0.34
99	0.41
100	0.48
101	0.52
102	0.53
103	0.56
104	0.6
105	0.61
106	0.58
107	0.58
108	0.58
109	0.51
110	0.44
111	0.39
112	0.35
113	0.31
114	0.29
115	0.26
116	0.2
117	0.21
118	0.23
119	0.28
120	0.29
121	0.3
122	0.32
123	0.33
124	0.32
125	0.35
126	0.34
127	0.3
128	0.29
129	0.28
130	0.24
131	0.21
132	0.2
133	0.15
134	0.14
135	0.12
136	0.11
137	0.09
138	0.08
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.09
168	0.11
169	0.12
170	0.16
171	0.22
172	0.3
173	0.36
174	0.38
175	0.38
176	0.4
177	0.45
178	0.42
179	0.37
180	0.3
181	0.26
182	0.24
183	0.2
184	0.18
185	0.11
186	0.12
187	0.12
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.18
194	0.19
195	0.24
196	0.25
197	0.33
198	0.38
199	0.47
200	0.54
201	0.53
202	0.56
203	0.55
204	0.64
205	0.62
206	0.65
207	0.66
208	0.61
209	0.59
210	0.54
211	0.51
212	0.41
213	0.34
214	0.25
215	0.15
216	0.1
217	0.07
218	0.06
219	0.04
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.07
241	0.08
242	0.1
243	0.12
244	0.14
245	0.16
246	0.17
247	0.18
248	0.19
249	0.26
250	0.32
251	0.31
252	0.32
253	0.29
254	0.28
255	0.29
256	0.3
257	0.22
258	0.13
259	0.11
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.09
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.04
296	0.04
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.02
301	0.02
302	0.03
303	0.04
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.12
308	0.2
309	0.22
310	0.23
311	0.24
312	0.24
313	0.28
314	0.32
315	0.3
316	0.26
317	0.26
318	0.24
319	0.24
320	0.24
321	0.19
322	0.14
323	0.11
324	0.09
325	0.08
326	0.09
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.15
333	0.15
334	0.17
335	0.21
336	0.27
337	0.28
338	0.29
339	0.34
340	0.36
341	0.39
342	0.39
343	0.39
344	0.34
345	0.35
346	0.34
347	0.27
348	0.22
349	0.18
350	0.17
351	0.13
352	0.11
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.13
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.12
367	0.08
368	0.11
369	0.11
370	0.16
371	0.16
372	0.16
373	0.18
374	0.18
375	0.18
376	0.15
377	0.17
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.12
385	0.09
386	0.07
387	0.11
388	0.11
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.21
394	0.21
395	0.18
396	0.2
397	0.19
398	0.18
399	0.18
400	0.17
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.12
410	0.15
411	0.17
412	0.17
413	0.18
414	0.18
415	0.2
416	0.21
417	0.2
418	0.16
419	0.16
420	0.18
421	0.18
422	0.2
423	0.2
424	0.19
425	0.21
426	0.21
427	0.19
428	0.18
429	0.19
430	0.25
431	0.25
432	0.27
433	0.24
434	0.26
435	0.25
436	0.27
437	0.31
438	0.24
439	0.27
440	0.28
441	0.3
442	0.29
443	0.3
444	0.28
445	0.21
446	0.21
447	0.19
448	0.2
449	0.24
450	0.28
451	0.3
452	0.29
453	0.3
454	0.35
455	0.41
456	0.4
457	0.42
458	0.44
459	0.43
460	0.43
461	0.42
462	0.36
463	0.33
464	0.33
465	0.32
466	0.32
467	0.33
468	0.34
469	0.36
470	0.37
471	0.36
472	0.37
473	0.31
474	0.27
475	0.29
476	0.28
477	0.28
478	0.29
479	0.25
480	0.23
481	0.28
482	0.26
483	0.22
484	0.24
485	0.24
486	0.26
487	0.26
488	0.23
489	0.18
490	0.23

A0A4S4MR21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer