Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FFM1

Protein Details
Accession C5FFM1    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-114EPSTYRRREPLRRDSLKRRESLBasic
173-204KEQARRRSKRNQDSSDKKTKKKKTEGDAKKAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-125RREPLRRDSLKRRESLLKGKEGSRRRQ
176-225ARRRSKRNQDSSDKKTKKKKTEGDAKKAHANAELEKISKELRAKLKHARA
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025952  R3H-assoc_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13902  R3H-assoc  
CDD cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MAVHPTLSASPAPAGSTTTTTQALTPQQVFAISSWSEQAIESLSLESSPIPYRNSAPLTIPLDDDVRQPASPTPVRLGRSVRVADGAAVATAEPSTYRRREPLRRDSLKRRESLLKGKEGSRRRQRWENDRLLSNPWAQPPSANDWQVQPTHPRHNPVPYYLASLWDSHQAAKEQARRRSKRNQDSSDKKTKKKKTEGDAKKAHANAELEKISKELRAKLKHARAARGLVQELEEEIRLFVREWVETQTWHRSRETESERCSDDSEDGDDDEVVFTGRKMQQSTVQKQRPSSSLHALSGEKMVFESPAEDRAAGFGRWLVHSLASYYGLRTWSVTVGNPPRREAYVGIDEFSQNLLLAAGRGLSDNKPDGILPRPLWVSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.18
4 0.17
5 0.19
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.22
10 0.25
11 0.27
12 0.27
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.24
17 0.19
18 0.19
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.18
39 0.22
40 0.28
41 0.31
42 0.29
43 0.28
44 0.33
45 0.35
46 0.33
47 0.31
48 0.26
49 0.25
50 0.24
51 0.23
52 0.19
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.18
57 0.24
58 0.26
59 0.26
60 0.29
61 0.32
62 0.34
63 0.37
64 0.39
65 0.35
66 0.39
67 0.38
68 0.33
69 0.29
70 0.27
71 0.23
72 0.2
73 0.16
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.07
82 0.14
83 0.17
84 0.19
85 0.26
86 0.35
87 0.45
88 0.53
89 0.62
90 0.66
91 0.73
92 0.79
93 0.83
94 0.85
95 0.83
96 0.76
97 0.7
98 0.67
99 0.64
100 0.65
101 0.6
102 0.57
103 0.53
104 0.56
105 0.59
106 0.58
107 0.62
108 0.63
109 0.65
110 0.65
111 0.71
112 0.74
113 0.76
114 0.79
115 0.78
116 0.72
117 0.67
118 0.62
119 0.56
120 0.51
121 0.45
122 0.37
123 0.31
124 0.27
125 0.23
126 0.22
127 0.21
128 0.26
129 0.27
130 0.26
131 0.24
132 0.24
133 0.27
134 0.28
135 0.26
136 0.26
137 0.26
138 0.34
139 0.36
140 0.38
141 0.38
142 0.44
143 0.44
144 0.4
145 0.39
146 0.3
147 0.34
148 0.29
149 0.29
150 0.22
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.2
160 0.27
161 0.3
162 0.38
163 0.48
164 0.5
165 0.56
166 0.64
167 0.69
168 0.72
169 0.75
170 0.75
171 0.75
172 0.79
173 0.81
174 0.82
175 0.78
176 0.75
177 0.75
178 0.76
179 0.75
180 0.76
181 0.76
182 0.74
183 0.79
184 0.81
185 0.81
186 0.79
187 0.72
188 0.66
189 0.6
190 0.51
191 0.43
192 0.35
193 0.26
194 0.24
195 0.23
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.18
203 0.25
204 0.29
205 0.34
206 0.42
207 0.48
208 0.51
209 0.53
210 0.51
211 0.46
212 0.45
213 0.45
214 0.4
215 0.33
216 0.28
217 0.25
218 0.2
219 0.18
220 0.15
221 0.1
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.19
235 0.27
236 0.29
237 0.31
238 0.31
239 0.28
240 0.31
241 0.39
242 0.44
243 0.4
244 0.41
245 0.43
246 0.44
247 0.43
248 0.41
249 0.33
250 0.26
251 0.2
252 0.19
253 0.16
254 0.14
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.11
264 0.14
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.28
269 0.38
270 0.47
271 0.51
272 0.55
273 0.55
274 0.57
275 0.6
276 0.55
277 0.52
278 0.48
279 0.46
280 0.43
281 0.41
282 0.41
283 0.37
284 0.35
285 0.32
286 0.26
287 0.18
288 0.14
289 0.13
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.09
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.17
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.15
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.17
322 0.23
323 0.32
324 0.4
325 0.42
326 0.43
327 0.44
328 0.44
329 0.45
330 0.38
331 0.35
332 0.36
333 0.34
334 0.33
335 0.31
336 0.29
337 0.27
338 0.26
339 0.19
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.17
352 0.19
353 0.19
354 0.2
355 0.21
356 0.23
357 0.26
358 0.32
359 0.28
360 0.32