Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N877

Protein Details
Accession A0A4S4N877    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MWGKGKKKKAQPVKEDDDVEBasic
41-65ESSSLPSTSQKPKKRRVVDSDEDDEHydrophilic
90-109SKEAKPPKTLESRSKPRRMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-9GKKKK
92-107EAKPPKTLESRSKPRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
Amino Acid Sequences MWGKGKKKKAQPVKEDDDVEMAGEKAADAEVQGTKRKQSLESSSLPSTSQKPKKRRVVDSDEDDEAESTRGPALALPMAKSNPPAVAGPSKEAKPPKTLESRSKPRRMQSPPPPSPPSENPVTDEAEDVDAQTEPEELEEDDGESEIDEDEVVASKNVEAAMDKTKEVDIKGGWKEGSHVPYAALAQAFSLIEATTKRLEKTALLTALFLLVIRRSGQNDSQSLLQTVYLCINRLCPDYMGVELGIGESLLVKAIGESTGRNLNTIKSELKKEGDLGLVAMNSKNSQKTLFKPKPLTVPFVFANLREIAMSTGHSSQNKKVSIITKLLAACQGTEAKYIVRSLEGKLRIGNAERTVLVALSHAAVLAEQERSNKRLSKDKLTARLEEASGIIKSVYSELPSHDVVIPALLEGGIDQLRQSCKLTPGVPLKPMLAKPTKAIGEVLDRFEGKRFTCEYKYDGERAQASHFVYRKLRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.76
3 0.67
4 0.59
5 0.48
6 0.38
7 0.29
8 0.21
9 0.14
10 0.11
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.08
17 0.12
18 0.15
19 0.22
20 0.24
21 0.28
22 0.32
23 0.34
24 0.35
25 0.39
26 0.45
27 0.45
28 0.49
29 0.51
30 0.49
31 0.47
32 0.45
33 0.4
34 0.38
35 0.42
36 0.46
37 0.5
38 0.58
39 0.67
40 0.77
41 0.83
42 0.86
43 0.85
44 0.85
45 0.85
46 0.83
47 0.77
48 0.68
49 0.59
50 0.5
51 0.4
52 0.31
53 0.22
54 0.15
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.19
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.22
74 0.22
75 0.25
76 0.28
77 0.29
78 0.33
79 0.38
80 0.37
81 0.38
82 0.4
83 0.43
84 0.49
85 0.54
86 0.59
87 0.63
88 0.72
89 0.75
90 0.82
91 0.8
92 0.77
93 0.8
94 0.78
95 0.78
96 0.77
97 0.79
98 0.77
99 0.79
100 0.76
101 0.69
102 0.68
103 0.62
104 0.56
105 0.5
106 0.44
107 0.38
108 0.37
109 0.36
110 0.29
111 0.26
112 0.22
113 0.17
114 0.16
115 0.13
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.12
157 0.18
158 0.19
159 0.21
160 0.2
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.24
165 0.19
166 0.18
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.1
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.1
197 0.06
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.11
204 0.14
205 0.17
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.19
210 0.18
211 0.16
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.17
253 0.19
254 0.17
255 0.21
256 0.22
257 0.24
258 0.23
259 0.22
260 0.21
261 0.18
262 0.15
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.13
274 0.16
275 0.23
276 0.34
277 0.39
278 0.44
279 0.48
280 0.5
281 0.56
282 0.55
283 0.55
284 0.44
285 0.42
286 0.36
287 0.35
288 0.33
289 0.23
290 0.24
291 0.18
292 0.17
293 0.12
294 0.12
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.14
301 0.18
302 0.2
303 0.24
304 0.3
305 0.31
306 0.3
307 0.31
308 0.32
309 0.33
310 0.34
311 0.29
312 0.27
313 0.26
314 0.26
315 0.23
316 0.2
317 0.15
318 0.14
319 0.16
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.21
331 0.22
332 0.22
333 0.23
334 0.24
335 0.24
336 0.25
337 0.27
338 0.22
339 0.21
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.16
344 0.13
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.14
357 0.17
358 0.2
359 0.24
360 0.29
361 0.31
362 0.39
363 0.44
364 0.48
365 0.55
366 0.61
367 0.67
368 0.66
369 0.65
370 0.59
371 0.56
372 0.47
373 0.38
374 0.31
375 0.23
376 0.19
377 0.16
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.13
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.18
390 0.18
391 0.16
392 0.15
393 0.13
394 0.09
395 0.09
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.11
404 0.14
405 0.16
406 0.18
407 0.19
408 0.23
409 0.28
410 0.29
411 0.33
412 0.4
413 0.43
414 0.44
415 0.42
416 0.41
417 0.42
418 0.43
419 0.43
420 0.41
421 0.38
422 0.37
423 0.43
424 0.42
425 0.37
426 0.36
427 0.3
428 0.33
429 0.34
430 0.35
431 0.31
432 0.3
433 0.29
434 0.32
435 0.34
436 0.27
437 0.29
438 0.31
439 0.34
440 0.39
441 0.42
442 0.41
443 0.45
444 0.49
445 0.48
446 0.46
447 0.45
448 0.43
449 0.42
450 0.43
451 0.39
452 0.36
453 0.4
454 0.39
455 0.4