Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4N7Z3

Protein Details
Accession A0A4S4N7Z3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61FQELSRRKRKDVKVEDIQVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-283KKKG
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012309  DNA_ligase_ATP-dep_C  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF04679  DNA_ligase_A_C  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07900  Adenylation_DNA_ligase_I_Euk  
cd07969  OBF_DNA_ligase_I  
Amino Acid Sequences MSKKYPDLVEQLPKFVKENTTSFVLDAEAVAIDRTTAKLMPFQELSRRKRKDVKVEDIQVRVCLFAFDLLYLNGEPLLHKSLLGRRELLREHFQPVVGEFDFAKASDGETTEEIQMFLEESVKDGCEGLMVKMLETDASFYEPSRRSVNWLKLKKDYLAGVGDSLDLVVVGAYYGKGKRTNVYGAFLLACYDADGEEYQTICKIGTGFSEEALQSHYDTLRPLEISKPRGDIKADERGISLRFPRFIRIRDDKSADDATSSEQIAEMYERQALAQTKGSKKKGKGGGDADDGFW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.38
4 0.34
5 0.35
6 0.32
7 0.34
8 0.33
9 0.31
10 0.29
11 0.23
12 0.18
13 0.15
14 0.11
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.06
19 0.05
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.15
26 0.17
27 0.21
28 0.23
29 0.24
30 0.33
31 0.41
32 0.48
33 0.53
34 0.57
35 0.59
36 0.67
37 0.74
38 0.75
39 0.75
40 0.77
41 0.76
42 0.8
43 0.79
44 0.72
45 0.64
46 0.55
47 0.45
48 0.36
49 0.26
50 0.17
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.12
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.19
69 0.22
70 0.24
71 0.24
72 0.23
73 0.28
74 0.31
75 0.33
76 0.34
77 0.32
78 0.34
79 0.32
80 0.3
81 0.26
82 0.24
83 0.23
84 0.16
85 0.15
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.04
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.22
134 0.28
135 0.38
136 0.41
137 0.46
138 0.47
139 0.49
140 0.51
141 0.46
142 0.42
143 0.33
144 0.26
145 0.21
146 0.18
147 0.13
148 0.12
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.04
161 0.05
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.14
166 0.17
167 0.22
168 0.22
169 0.25
170 0.23
171 0.21
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.1
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.18
211 0.24
212 0.28
213 0.29
214 0.32
215 0.33
216 0.35
217 0.36
218 0.34
219 0.33
220 0.39
221 0.38
222 0.34
223 0.33
224 0.32
225 0.31
226 0.3
227 0.3
228 0.23
229 0.26
230 0.27
231 0.34
232 0.37
233 0.39
234 0.45
235 0.5
236 0.53
237 0.56
238 0.6
239 0.54
240 0.54
241 0.53
242 0.44
243 0.35
244 0.29
245 0.25
246 0.23
247 0.21
248 0.16
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.17
259 0.19
260 0.19
261 0.25
262 0.33
263 0.41
264 0.5
265 0.58
266 0.62
267 0.64
268 0.71
269 0.72
270 0.72
271 0.71
272 0.68
273 0.67
274 0.66