FuNGI

A0A4S4LWA4

Protein Details

Accession

A0A4S4LWA4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-114	PDPPAPKPPNQPPPPPPNPD	Hydrophilic
376-399	HTGGKGKKSGKDRRKDSKKPESSD	Basic
966-990	VPEGVVTGKRKRKPSSKVRAIMDGK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
365-395	PKKPDSANAASHTGGKGKKSGKDRRKDSKKP
974-982	KRKRKPSSK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MGPDPNNLPTPYCYYNERQDSYNFCEDSPCPNRNTVPLGSTKGNENWASEISVNQIAQIVARKRKQQEDANPTTAIELDLDSEPEDSEHAPVPVPDPPAPKPPNQPPPPPPNPDPQGPAQIPDPAPAPSPPPRPNPPPPPPPPPQPNPPTTVVPLPKRKMPDIFKVFSDVPKLQRDGANYRIWVERVNFTAMGCAVKAYLTAAAPADKQDQSDILLAALMGRLPDSIFFTLKASTRPDEIMSALRSRFGQQNTLTNAHAEERLFSLKCTDGAPKAVQAHLDELLTLREELAASDIKISDKTFVNAVISSMPHAYKTVITTHESAVRVHNMINPSALHTITPDAIIALLRGEAQTRATLSASASKPKKPDSANAASHTGGKGKKSGKDRRKDSKKPESSDDSGVTCYRCQGKGHRANVCPSKSKAPRPKDQANAADEKKPDPKSDEKGKGRAVETASIVQIDSDDEDAWAAYSAVEIIEADGPEIATMANDSQISRSEMEVYDSGATKHMTPFRDQLRNYRSVPRRNIKAADEKFFPAYGVGDMHLSVPNGSKWNTLRVKGVLYAPTMGSTLISLGKLDDDGYSMNIGGGRCTISNPDGTQIGSIAKENGLYIVRHNERALAARIPSISLAEIHRRLGHASYGYIRKLVASGTLLGLNVDLKSGEPECDVCLRAKASRKPILSRRLNPRASNFGDVIHMDVWGPAPVQTIHHSLYTCTMLDDATLWLEEPLLRTKGESFAKYVGYEARLFTQFGVRIKCAHSDRGGEFLGNDFTAHLECQGTTRKLTVHDTPEHNGDAERSHLTLGNMRRCMLIASGLPKWLWGEAHKHAVWLWNRTPHAAIGFSTPYEAQFGKKPDLSGLKPFGAVCYVRKEKSDKLGARADEGRWLGFDDTLNGIRVYSTSKNSVSVERNIVVSSREISPLEGEDYSIEMPTIDSIDNERNLITHDPVAQPIEDVNPAEEIQEPVPEGVVTGKRKRKPSSKVRAIMDGKAITGDELDEAHFTIEMNLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.46
3	0.52
4	0.51
5	0.48
6	0.49
7	0.52
8	0.55
9	0.57
10	0.47
11	0.39
12	0.41
13	0.39
14	0.44
15	0.45
16	0.42
17	0.37
18	0.4
19	0.43
20	0.43
21	0.48
22	0.4
23	0.37
24	0.38
25	0.41
26	0.39
27	0.39
28	0.39
29	0.36
30	0.39
31	0.36
32	0.33
33	0.3
34	0.28
35	0.29
36	0.25
37	0.22
38	0.2
39	0.23
40	0.21
41	0.18
42	0.18
43	0.15
44	0.17
45	0.24
46	0.28
47	0.33
48	0.39
49	0.47
50	0.52
51	0.61
52	0.68
53	0.7
54	0.73
55	0.74
56	0.77
57	0.73
58	0.66
59	0.58
60	0.5
61	0.4
62	0.3
63	0.2
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.1
72	0.11
73	0.09
74	0.11
75	0.12
76	0.12
77	0.12
78	0.13
79	0.14
80	0.17
81	0.21
82	0.23
83	0.26
84	0.29
85	0.39
86	0.42
87	0.46
88	0.51
89	0.57
90	0.64
91	0.66
92	0.72
93	0.71
94	0.78
95	0.8
96	0.79
97	0.73
98	0.72
99	0.69
100	0.65
101	0.6
102	0.54
103	0.55
104	0.47
105	0.46
106	0.37
107	0.39
108	0.34
109	0.31
110	0.29
111	0.21
112	0.22
113	0.21
114	0.25
115	0.26
116	0.34
117	0.39
118	0.45
119	0.52
120	0.59
121	0.68
122	0.72
123	0.74
124	0.75
125	0.76
126	0.77
127	0.75
128	0.77
129	0.76
130	0.72
131	0.73
132	0.7
133	0.68
134	0.65
135	0.63
136	0.57
137	0.51
138	0.52
139	0.49
140	0.51
141	0.56
142	0.55
143	0.55
144	0.56
145	0.58
146	0.59
147	0.57
148	0.59
149	0.57
150	0.56
151	0.52
152	0.53
153	0.5
154	0.43
155	0.43
156	0.36
157	0.33
158	0.36
159	0.37
160	0.35
161	0.36
162	0.39
163	0.38
164	0.4
165	0.4
166	0.35
167	0.36
168	0.35
169	0.33
170	0.32
171	0.29
172	0.26
173	0.24
174	0.27
175	0.24
176	0.21
177	0.23
178	0.2
179	0.18
180	0.14
181	0.12
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.08
187	0.07
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.11
192	0.13
193	0.16
194	0.15
195	0.16
196	0.16
197	0.15
198	0.16
199	0.17
200	0.15
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.06
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.06
212	0.09
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.16
218	0.17
219	0.19
220	0.2
221	0.2
222	0.22
223	0.22
224	0.22
225	0.21
226	0.21
227	0.22
228	0.2
229	0.22
230	0.2
231	0.2
232	0.2
233	0.22
234	0.26
235	0.24
236	0.28
237	0.26
238	0.34
239	0.37
240	0.39
241	0.36
242	0.31
243	0.3
244	0.25
245	0.25
246	0.18
247	0.14
248	0.14
249	0.18
250	0.17
251	0.16
252	0.17
253	0.16
254	0.17
255	0.17
256	0.18
257	0.16
258	0.2
259	0.21
260	0.22
261	0.23
262	0.23
263	0.23
264	0.2
265	0.2
266	0.18
267	0.16
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.11
301	0.1
302	0.12
303	0.14
304	0.15
305	0.17
306	0.19
307	0.19
308	0.24
309	0.23
310	0.23
311	0.22
312	0.22
313	0.2
314	0.19
315	0.2
316	0.17
317	0.16
318	0.17
319	0.14
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.12
324	0.11
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.16
347	0.17
348	0.24
349	0.26
350	0.28
351	0.31
352	0.34
353	0.4
354	0.34
355	0.4
356	0.4
357	0.46
358	0.47
359	0.47
360	0.46
361	0.4
362	0.39
363	0.33
364	0.29
365	0.22
366	0.18
367	0.22
368	0.23
369	0.29
370	0.38
371	0.48
372	0.52
373	0.61
374	0.69
375	0.74
376	0.81
377	0.85
378	0.85
379	0.86
380	0.85
381	0.8
382	0.77
383	0.73
384	0.65
385	0.59
386	0.51
387	0.41
388	0.33
389	0.3
390	0.25
391	0.18
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.18
396	0.23
397	0.33
398	0.41
399	0.47
400	0.52
401	0.51
402	0.56
403	0.61
404	0.57
405	0.51
406	0.45
407	0.48
408	0.46
409	0.54
410	0.57
411	0.57
412	0.62
413	0.66
414	0.71
415	0.68
416	0.69
417	0.64
418	0.58
419	0.58
420	0.51
421	0.47
422	0.4
423	0.37
424	0.37
425	0.33
426	0.3
427	0.28
428	0.32
429	0.35
430	0.44
431	0.52
432	0.49
433	0.53
434	0.55
435	0.54
436	0.49
437	0.45
438	0.37
439	0.29
440	0.26
441	0.21
442	0.18
443	0.14
444	0.13
445	0.09
446	0.08
447	0.06
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.03
472	0.02
473	0.03
474	0.03
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.11
486	0.11
487	0.1
488	0.1
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.11
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.22
499	0.27
500	0.33
501	0.33
502	0.39
503	0.4
504	0.44
505	0.44
506	0.49
507	0.5
508	0.51
509	0.59
510	0.57
511	0.57
512	0.56
513	0.57
514	0.51
515	0.54
516	0.49
517	0.44
518	0.39
519	0.35
520	0.32
521	0.29
522	0.25
523	0.15
524	0.12
525	0.09
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.1
537	0.1
538	0.13
539	0.13
540	0.22
541	0.24
542	0.25
543	0.26
544	0.26
545	0.26
546	0.25
547	0.26
548	0.19
549	0.17
550	0.16
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.1
555	0.08
556	0.05
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.09
580	0.08
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.17
600	0.18
601	0.19
602	0.19
603	0.19
604	0.19
605	0.22
606	0.23
607	0.16
608	0.15
609	0.15
610	0.15
611	0.14
612	0.13
613	0.11
614	0.09
615	0.08
616	0.1
617	0.14
618	0.15
619	0.16
620	0.17
621	0.17
622	0.18
623	0.17
624	0.17
625	0.13
626	0.13
627	0.17
628	0.19
629	0.19
630	0.18
631	0.17
632	0.15
633	0.15
634	0.14
635	0.1
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.07
644	0.06
645	0.05
646	0.05
647	0.04
648	0.06
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.1
654	0.12
655	0.13
656	0.11
657	0.13
658	0.14
659	0.18
660	0.26
661	0.3
662	0.37
663	0.43
664	0.46
665	0.52
666	0.58
667	0.64
668	0.65
669	0.68
670	0.69
671	0.72
672	0.74
673	0.7
674	0.66
675	0.63
676	0.57
677	0.52
678	0.42
679	0.33
680	0.29
681	0.26
682	0.23
683	0.15
684	0.12
685	0.09
686	0.09
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.06
691	0.07
692	0.08
693	0.09
694	0.12
695	0.15
696	0.16
697	0.17
698	0.17
699	0.16
700	0.19
701	0.18
702	0.16
703	0.13
704	0.12
705	0.09
706	0.09
707	0.1
708	0.07
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.06
714	0.06
715	0.08
716	0.11
717	0.12
718	0.12
719	0.13
720	0.14
721	0.21
722	0.24
723	0.24
724	0.22
725	0.24
726	0.25
727	0.24
728	0.24
729	0.2
730	0.18
731	0.18
732	0.16
733	0.18
734	0.17
735	0.18
736	0.17
737	0.19
738	0.2
739	0.23
740	0.26
741	0.23
742	0.25
743	0.26
744	0.33
745	0.31
746	0.32
747	0.3
748	0.32
749	0.32
750	0.34
751	0.33
752	0.25
753	0.23
754	0.2
755	0.19
756	0.13
757	0.12
758	0.08
759	0.08
760	0.09
761	0.09
762	0.08
763	0.07
764	0.07
765	0.1
766	0.17
767	0.18
768	0.19
769	0.2
770	0.21
771	0.24
772	0.29
773	0.32
774	0.32
775	0.37
776	0.4
777	0.42
778	0.43
779	0.4
780	0.36
781	0.3
782	0.24
783	0.18
784	0.17
785	0.16
786	0.13
787	0.13
788	0.15
789	0.15
790	0.2
791	0.27
792	0.32
793	0.32
794	0.32
795	0.32
796	0.3
797	0.3
798	0.24
799	0.2
800	0.15
801	0.18
802	0.18
803	0.19
804	0.19
805	0.18
806	0.18
807	0.16
808	0.15
809	0.14
810	0.19
811	0.22
812	0.3
813	0.3
814	0.3
815	0.29
816	0.35
817	0.36
818	0.37
819	0.37
820	0.37
821	0.38
822	0.4
823	0.4
824	0.34
825	0.32
826	0.27
827	0.22
828	0.19
829	0.19
830	0.18
831	0.18
832	0.16
833	0.14
834	0.16
835	0.16
836	0.14
837	0.18
838	0.23
839	0.27
840	0.28
841	0.29
842	0.32
843	0.39
844	0.39
845	0.41
846	0.42
847	0.38
848	0.37
849	0.36
850	0.31
851	0.28
852	0.26
853	0.21
854	0.26
855	0.31
856	0.31
857	0.35
858	0.4
859	0.42
860	0.49
861	0.57
862	0.51
863	0.52
864	0.58
865	0.54
866	0.55
867	0.52
868	0.44
869	0.4
870	0.37
871	0.31
872	0.24
873	0.25
874	0.2
875	0.18
876	0.17
877	0.13
878	0.16
879	0.17
880	0.18
881	0.16
882	0.15
883	0.14
884	0.14
885	0.17
886	0.18
887	0.21
888	0.24
889	0.25
890	0.29
891	0.31
892	0.38
893	0.37
894	0.38
895	0.39
896	0.36
897	0.36
898	0.32
899	0.31
900	0.26
901	0.22
902	0.19
903	0.16
904	0.18
905	0.17
906	0.18
907	0.18
908	0.19
909	0.2
910	0.17
911	0.16
912	0.13
913	0.15
914	0.14
915	0.13
916	0.11
917	0.08
918	0.08
919	0.08
920	0.1
921	0.08
922	0.08
923	0.12
924	0.18
925	0.19
926	0.19
927	0.18
928	0.17
929	0.2
930	0.22
931	0.21
932	0.18
933	0.21
934	0.22
935	0.25
936	0.26
937	0.23
938	0.21
939	0.19
940	0.19
941	0.17
942	0.16
943	0.15
944	0.15
945	0.15
946	0.15
947	0.15
948	0.15
949	0.14
950	0.15
951	0.15
952	0.13
953	0.14
954	0.13
955	0.11
956	0.14
957	0.21
958	0.26
959	0.35
960	0.44
961	0.5
962	0.59
963	0.69
964	0.73
965	0.77
966	0.81
967	0.83
968	0.85
969	0.87
970	0.83
971	0.83
972	0.77
973	0.7
974	0.66
975	0.55
976	0.45
977	0.37
978	0.32
979	0.22
980	0.19
981	0.15
982	0.09
983	0.09
984	0.09
985	0.09
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.09

A0A4S4LWA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer