FuNGI

A0A5C3LT40

Protein Details

Accession

A0A5C3LT40

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-145	PSQATGHKRKCEQKGRYRPTLSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 13, nucl 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041988 KOW_RPL26/RPL24 IPR005825 Ribosomal_L24/26_CS IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005840 C:ribosome GO:0003723 F:RNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF00467 KOW
PROSITE	View protein in PROSITE PS01108 RIBOSOMAL_L24
CDD	cd06089 KOW_RPL26

Amino Acid Sequences

MPGVCAFIDIEVAVADSEEEEEEVEEISDFIKSDDENQDEGVLPSHIHLQQLMTEGDDPGNFMEYLAKKYLKTSSSKFTPSEHTWIRVRKGRYHGDLAFVISVSEAPTSLEVGIVVMPCITYPSQATGHKRKCEQKGRYRPTLSLFEPGKCASGCVAIRDTANKIVGYSYQRREFDSEGWEIIRNMASHMYHSMEVITSIQELFAFKPCPYVKHHIFDQAMEQAESAQVKLDDKVWARLTVGLHIQEWKATVVDVSDREVTVRMRHSSQEVPLSHSQVRKAFSVGDSVQVVWGADKGKSGWVVGIFRHKKQFVTIFDHQAGNDFVIHTVLIDFYNREFRFTSKDRQELATTVVDALGKYINMRDDPYKQLAGLHVVICDGPEKGKQAIIKTVNSQGLAQIETQSTLLFSLKLYDASVEMLAIYQQGRLVPIKMLPLGVLCLAKDLWHSLPAPAIAAWLGLQTPAYSTPLQSTTPAWDPSSSTCLWSQEQCNQPSSSSTPSLSILPTLASSSFIADTLSSKGPLKGKHVGMVKVLPLPSKFAEVKVLKIKTHLEDGRCNLMSTKRKATMETVAVLPLTDLCTLWP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.05
4	0.06
5	0.06
6	0.06
7	0.06
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.06
13	0.06
14	0.06
15	0.07
16	0.06
17	0.07
18	0.08
19	0.08
20	0.14
21	0.2
22	0.23
23	0.24
24	0.24
25	0.25
26	0.25
27	0.25
28	0.21
29	0.14
30	0.11
31	0.11
32	0.17
33	0.17
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.18
38	0.21
39	0.2
40	0.16
41	0.15
42	0.16
43	0.16
44	0.15
45	0.13
46	0.1
47	0.12
48	0.11
49	0.1
50	0.16
51	0.17
52	0.21
53	0.25
54	0.27
55	0.25
56	0.28
57	0.35
58	0.33
59	0.38
60	0.39
61	0.43
62	0.48
63	0.52
64	0.51
65	0.48
66	0.51
67	0.49
68	0.53
69	0.48
70	0.46
71	0.48
72	0.53
73	0.57
74	0.56
75	0.56
76	0.55
77	0.6
78	0.64
79	0.63
80	0.64
81	0.58
82	0.55
83	0.51
84	0.44
85	0.36
86	0.27
87	0.21
88	0.13
89	0.12
90	0.08
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.07
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.08
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.12
111	0.17
112	0.23
113	0.31
114	0.4
115	0.48
116	0.53
117	0.6
118	0.65
119	0.71
120	0.76
121	0.78
122	0.79
123	0.82
124	0.84
125	0.86
126	0.8
127	0.73
128	0.68
129	0.64
130	0.55
131	0.52
132	0.46
133	0.37
134	0.37
135	0.34
136	0.31
137	0.24
138	0.23
139	0.15
140	0.19
141	0.18
142	0.18
143	0.19
144	0.18
145	0.18
146	0.2
147	0.22
148	0.19
149	0.2
150	0.17
151	0.16
152	0.16
153	0.19
154	0.23
155	0.28
156	0.31
157	0.36
158	0.37
159	0.39
160	0.42
161	0.4
162	0.36
163	0.33
164	0.29
165	0.23
166	0.23
167	0.22
168	0.19
169	0.17
170	0.16
171	0.12
172	0.11
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.13
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.18
195	0.19
196	0.21
197	0.26
198	0.34
199	0.36
200	0.39
201	0.4
202	0.4
203	0.4
204	0.38
205	0.35
206	0.29
207	0.25
208	0.21
209	0.19
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.09
214	0.07
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.12
220	0.13
221	0.18
222	0.19
223	0.19
224	0.18
225	0.21
226	0.2
227	0.18
228	0.19
229	0.15
230	0.14
231	0.15
232	0.14
233	0.12
234	0.12
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.15
250	0.15
251	0.16
252	0.17
253	0.2
254	0.21
255	0.22
256	0.26
257	0.23
258	0.27
259	0.27
260	0.3
261	0.3
262	0.29
263	0.3
264	0.26
265	0.27
266	0.22
267	0.21
268	0.19
269	0.16
270	0.19
271	0.16
272	0.15
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.1
277	0.1
278	0.06
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.2
292	0.21
293	0.23
294	0.28
295	0.28
296	0.27
297	0.29
298	0.35
299	0.29
300	0.35
301	0.36
302	0.36
303	0.37
304	0.37
305	0.33
306	0.28
307	0.24
308	0.16
309	0.13
310	0.09
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.04
316	0.05
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.15
322	0.15
323	0.17
324	0.17
325	0.18
326	0.25
327	0.28
328	0.37
329	0.34
330	0.4
331	0.39
332	0.41
333	0.41
334	0.35
335	0.34
336	0.26
337	0.2
338	0.15
339	0.14
340	0.11
341	0.1
342	0.09
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.11
350	0.13
351	0.16
352	0.2
353	0.23
354	0.22
355	0.21
356	0.21
357	0.2
358	0.2
359	0.18
360	0.15
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.07
367	0.06
368	0.08
369	0.1
370	0.1
371	0.13
372	0.15
373	0.16
374	0.24
375	0.27
376	0.27
377	0.27
378	0.32
379	0.31
380	0.3
381	0.28
382	0.22
383	0.19
384	0.18
385	0.16
386	0.12
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.07
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.08
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.12
418	0.14
419	0.14
420	0.14
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.12
432	0.11
433	0.14
434	0.14
435	0.13
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.12
440	0.11
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.07
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.14
455	0.16
456	0.17
457	0.17
458	0.18
459	0.19
460	0.24
461	0.26
462	0.24
463	0.22
464	0.23
465	0.25
466	0.28
467	0.24
468	0.21
469	0.21
470	0.24
471	0.25
472	0.28
473	0.3
474	0.33
475	0.4
476	0.41
477	0.43
478	0.4
479	0.39
480	0.38
481	0.37
482	0.34
483	0.29
484	0.27
485	0.25
486	0.25
487	0.26
488	0.23
489	0.2
490	0.15
491	0.13
492	0.12
493	0.12
494	0.1
495	0.11
496	0.1
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.11
503	0.13
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.21
508	0.26
509	0.29
510	0.34
511	0.38
512	0.38
513	0.43
514	0.48
515	0.46
516	0.44
517	0.44
518	0.4
519	0.36
520	0.35
521	0.32
522	0.27
523	0.29
524	0.26
525	0.3
526	0.28
527	0.25
528	0.33
529	0.31
530	0.38
531	0.43
532	0.45
533	0.39
534	0.43
535	0.47
536	0.4
537	0.49
538	0.47
539	0.43
540	0.47
541	0.51
542	0.56
543	0.51
544	0.49
545	0.43
546	0.46
547	0.5
548	0.49
549	0.54
550	0.52
551	0.53
552	0.55
553	0.57
554	0.56
555	0.51
556	0.47
557	0.39
558	0.33
559	0.31
560	0.28
561	0.23
562	0.16
563	0.13
564	0.11

A0A5C3LT40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer