Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MDC0

Protein Details
Accession A0A5C3MDC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-366AAKAKLRKERREEQERNVKRKKALARQNSGNTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-356KSKKQIADLKAEHAAKAKLRKERREEQERNVKRKKA
430-439RKKVRIRGKR
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARKRKNRTHLKGGAAPVTTSDGAPKSFIIKHGQVGSSVTQLVRDMRKVMEPNTASRLKERNRNKLKDYLTLAPTLQVTHLLAFTLTPIAPSLRLVRLSAGPTLSFRIERYSLMKDVMNNSRRARGVGMEYLSPPLLVLASFPPPSSTTPPHLPLLMKSFQSLFPPLSPNTLSLSSARRVVLVAYNPDRGTVDFRHYIIKVKPYGVSKRVRRVLEGASSKTRVINLGNEKDVADFLLRRRGEPGPEGGYESAASSAESVAGDDGDAVDLAGDYVGRNNKKGQRRAVRLDEVGPRMELRLVKIAEGVPGKEGAILYHEFVKKSKKQIADLKAEHAAKAKLRKERREEQERNVKRKKALARQNSGNTEGEDEDEEMEDVEDVGSEEEGGEEIDGGEDGAWDEEEEISEGEDSEVEQGSDMESSEDEAESQPRKKVRIRGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.61
3 0.51
4 0.42
5 0.38
6 0.3
7 0.23
8 0.23
9 0.19
10 0.19
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.21
15 0.24
16 0.28
17 0.29
18 0.33
19 0.37
20 0.37
21 0.33
22 0.34
23 0.32
24 0.27
25 0.26
26 0.21
27 0.16
28 0.17
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.31
35 0.34
36 0.34
37 0.38
38 0.36
39 0.38
40 0.43
41 0.45
42 0.4
43 0.42
44 0.49
45 0.46
46 0.54
47 0.6
48 0.63
49 0.7
50 0.77
51 0.76
52 0.75
53 0.73
54 0.71
55 0.67
56 0.63
57 0.55
58 0.49
59 0.44
60 0.37
61 0.33
62 0.26
63 0.2
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.2
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.24
100 0.25
101 0.26
102 0.23
103 0.28
104 0.36
105 0.36
106 0.38
107 0.38
108 0.41
109 0.41
110 0.4
111 0.35
112 0.29
113 0.28
114 0.26
115 0.26
116 0.21
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.16
121 0.12
122 0.08
123 0.07
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.16
133 0.2
134 0.22
135 0.24
136 0.28
137 0.31
138 0.31
139 0.32
140 0.29
141 0.26
142 0.28
143 0.26
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.21
149 0.2
150 0.16
151 0.15
152 0.18
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.19
162 0.17
163 0.19
164 0.18
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.18
171 0.18
172 0.21
173 0.2
174 0.21
175 0.2
176 0.18
177 0.2
178 0.16
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.21
183 0.21
184 0.25
185 0.23
186 0.27
187 0.24
188 0.24
189 0.26
190 0.28
191 0.33
192 0.35
193 0.41
194 0.41
195 0.48
196 0.54
197 0.51
198 0.48
199 0.46
200 0.42
201 0.41
202 0.39
203 0.33
204 0.29
205 0.3
206 0.28
207 0.26
208 0.23
209 0.17
210 0.14
211 0.18
212 0.21
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.21
218 0.2
219 0.14
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.19
227 0.2
228 0.21
229 0.22
230 0.24
231 0.19
232 0.19
233 0.21
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.13
238 0.1
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.06
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.2
265 0.28
266 0.37
267 0.44
268 0.51
269 0.56
270 0.64
271 0.7
272 0.71
273 0.68
274 0.61
275 0.59
276 0.55
277 0.47
278 0.39
279 0.32
280 0.25
281 0.2
282 0.21
283 0.17
284 0.13
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.19
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.19
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.2
306 0.29
307 0.31
308 0.38
309 0.44
310 0.42
311 0.49
312 0.57
313 0.63
314 0.65
315 0.61
316 0.57
317 0.57
318 0.53
319 0.46
320 0.4
321 0.35
322 0.3
323 0.37
324 0.39
325 0.42
326 0.5
327 0.58
328 0.63
329 0.7
330 0.76
331 0.79
332 0.79
333 0.8
334 0.82
335 0.82
336 0.84
337 0.83
338 0.78
339 0.71
340 0.73
341 0.72
342 0.72
343 0.73
344 0.73
345 0.73
346 0.76
347 0.8
348 0.76
349 0.7
350 0.61
351 0.51
352 0.43
353 0.35
354 0.27
355 0.2
356 0.17
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.17
413 0.23
414 0.26
415 0.31
416 0.35
417 0.41
418 0.48
419 0.56