Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LTY4

Protein Details
Accession A0A5C3LTY4    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-49EAEAIKRERERKIREERRKKEEQDAKDREBasic
371-398ARSTSRSESPPLKKKRRHSFEDPNRVDGHydrophilic
449-473ALEEERRHEEEKRRRKKEKERAMARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-60KRERERKIREERRKKEEQDAKDREMERKRREKYLA
64-70KAEERRK
367-387KHRPARSTSRSESPPLKKKRR
454-473RRHEEEKRRRKKEKERAMAR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTSFTALMALSASQTKQAQAEAEAIKRERERKIREERRKKEEQDAKDREMERKRREKYLADLQKAEERRKQEEAAQKAREAAAQKREDEQRNILLHGPKKAAKLSSTTDGSSSKWPSSSSNTRENVRKRRLPDDDDDNSGPTPLTREELRARKEEKEMMKIFHPTKRPSQGSGYSRPGRMLRGGAVDMMKTTSESPDTSGKSVKARISAAPNALVKLNTVKRDTRTIDEIMQDRAKAKELKVLDGDAAKEFDDWFGTKKKDSRKPSPTDRAGSSAVPSGASTPSRSAWPTPVVPSSSTKKTSNAPRPSSLNTSSLPKSSGPSSAAPKSANPTSRSVPSKSSLPSGKIPKTTDRPSTVHKSSTPSSSKHRPARSTSRSESPPLKKKRRHSFEDPNRVDGDAIWKLFGRDRSAYVERDVFSDDEDMEVDARILEREEKMSAKIAKREEQLALEEERRHEEEKRRRKKEKERAMAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.32
11 0.32
12 0.36
13 0.4
14 0.45
15 0.47
16 0.53
17 0.58
18 0.62
19 0.72
20 0.78
21 0.83
22 0.88
23 0.89
24 0.88
25 0.9
26 0.85
27 0.84
28 0.83
29 0.81
30 0.81
31 0.79
32 0.75
33 0.73
34 0.71
35 0.69
36 0.69
37 0.7
38 0.69
39 0.71
40 0.71
41 0.72
42 0.75
43 0.72
44 0.7
45 0.71
46 0.7
47 0.66
48 0.63
49 0.57
50 0.59
51 0.59
52 0.57
53 0.51
54 0.46
55 0.46
56 0.49
57 0.48
58 0.48
59 0.52
60 0.55
61 0.59
62 0.56
63 0.52
64 0.49
65 0.47
66 0.43
67 0.38
68 0.36
69 0.36
70 0.37
71 0.38
72 0.42
73 0.5
74 0.52
75 0.53
76 0.51
77 0.49
78 0.46
79 0.46
80 0.45
81 0.43
82 0.41
83 0.41
84 0.41
85 0.37
86 0.38
87 0.4
88 0.37
89 0.32
90 0.34
91 0.33
92 0.35
93 0.34
94 0.32
95 0.3
96 0.29
97 0.29
98 0.3
99 0.29
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.31
105 0.39
106 0.38
107 0.44
108 0.46
109 0.5
110 0.58
111 0.64
112 0.66
113 0.66
114 0.67
115 0.63
116 0.69
117 0.71
118 0.68
119 0.65
120 0.63
121 0.57
122 0.56
123 0.52
124 0.44
125 0.36
126 0.31
127 0.24
128 0.15
129 0.14
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.16
134 0.23
135 0.31
136 0.35
137 0.39
138 0.42
139 0.42
140 0.46
141 0.48
142 0.44
143 0.46
144 0.45
145 0.4
146 0.4
147 0.43
148 0.42
149 0.41
150 0.43
151 0.38
152 0.43
153 0.5
154 0.5
155 0.46
156 0.49
157 0.52
158 0.51
159 0.54
160 0.55
161 0.49
162 0.48
163 0.47
164 0.42
165 0.35
166 0.32
167 0.26
168 0.19
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.15
173 0.13
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.19
187 0.2
188 0.21
189 0.25
190 0.24
191 0.22
192 0.22
193 0.24
194 0.27
195 0.28
196 0.26
197 0.25
198 0.24
199 0.22
200 0.21
201 0.18
202 0.13
203 0.17
204 0.19
205 0.19
206 0.21
207 0.23
208 0.24
209 0.31
210 0.32
211 0.29
212 0.3
213 0.28
214 0.27
215 0.28
216 0.27
217 0.24
218 0.23
219 0.2
220 0.17
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.18
226 0.18
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.21
246 0.31
247 0.39
248 0.47
249 0.55
250 0.6
251 0.66
252 0.74
253 0.78
254 0.74
255 0.69
256 0.63
257 0.56
258 0.49
259 0.41
260 0.32
261 0.24
262 0.18
263 0.14
264 0.13
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.18
276 0.19
277 0.2
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.25
282 0.27
283 0.29
284 0.31
285 0.3
286 0.3
287 0.36
288 0.44
289 0.5
290 0.54
291 0.54
292 0.54
293 0.56
294 0.58
295 0.57
296 0.49
297 0.42
298 0.34
299 0.34
300 0.32
301 0.29
302 0.27
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.21
307 0.18
308 0.21
309 0.25
310 0.26
311 0.28
312 0.27
313 0.27
314 0.29
315 0.31
316 0.33
317 0.3
318 0.32
319 0.33
320 0.39
321 0.42
322 0.39
323 0.38
324 0.35
325 0.37
326 0.35
327 0.38
328 0.34
329 0.34
330 0.39
331 0.43
332 0.46
333 0.46
334 0.48
335 0.49
336 0.54
337 0.56
338 0.56
339 0.54
340 0.52
341 0.54
342 0.59
343 0.55
344 0.51
345 0.47
346 0.46
347 0.43
348 0.48
349 0.45
350 0.4
351 0.45
352 0.51
353 0.58
354 0.61
355 0.66
356 0.63
357 0.68
358 0.75
359 0.75
360 0.74
361 0.7
362 0.69
363 0.64
364 0.64
365 0.66
366 0.64
367 0.66
368 0.68
369 0.74
370 0.74
371 0.81
372 0.87
373 0.86
374 0.85
375 0.85
376 0.86
377 0.86
378 0.89
379 0.82
380 0.74
381 0.66
382 0.58
383 0.48
384 0.37
385 0.33
386 0.26
387 0.23
388 0.2
389 0.19
390 0.2
391 0.25
392 0.27
393 0.26
394 0.24
395 0.26
396 0.33
397 0.37
398 0.38
399 0.37
400 0.38
401 0.33
402 0.32
403 0.32
404 0.24
405 0.22
406 0.21
407 0.17
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.11
419 0.12
420 0.15
421 0.17
422 0.19
423 0.2
424 0.27
425 0.33
426 0.36
427 0.41
428 0.45
429 0.5
430 0.52
431 0.54
432 0.5
433 0.45
434 0.43
435 0.39
436 0.38
437 0.36
438 0.36
439 0.34
440 0.36
441 0.37
442 0.37
443 0.4
444 0.46
445 0.53
446 0.6
447 0.69
448 0.74
449 0.81
450 0.89
451 0.93
452 0.93
453 0.93