Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M5V1

Protein Details
Accession A0A5C3M5V1    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
333-356DPDSSPLRPAKKVKKSKISSSSDDHydrophilic
372-391GSGGVKRGTKQPIKRGGKRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-349AKKVKKSK
362-391RKRRVMQLKVGSGGVKRGTKQPIKRGGKRF
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MEEFNEEHSKLLFGKEWLTKIDTAKNTPYLFKFYSSTVDLSCCILITDTKHVWAEVLTSQQFARRWRSCNANSPSPLSEGDEEAWRISCFELLSKSHSIGGILELSFEVIESYYADFAFELECETFKWRWETCSLGHTTSAELISKHLIFPLISVNHLAFSSPEAVGEISDTDLEKAVDKVGRTARRTVDTHMKNALSKPRFATTVRRMTAMFNFLPDLPQINSTADEPDLHFDFQVPTTDKGKGKELSSKGLPASQTSATKQKTPSPEDSLKPPVRVDSATESDQDELLHDQVQSRVSPVTSQSSKHRRAETPQSIGSTSQPPGPAKDQESDPDSSPLRPAKKVKKSKISSSSDDDSEAERKRRVMQLKVGSGGVKRGTKQPIKRGGKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.28
3 0.29
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.42
9 0.41
10 0.41
11 0.44
12 0.48
13 0.46
14 0.48
15 0.47
16 0.45
17 0.41
18 0.39
19 0.36
20 0.31
21 0.34
22 0.31
23 0.3
24 0.24
25 0.24
26 0.22
27 0.22
28 0.2
29 0.15
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.14
34 0.2
35 0.2
36 0.22
37 0.23
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.14
43 0.19
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.36
51 0.36
52 0.39
53 0.44
54 0.53
55 0.54
56 0.61
57 0.64
58 0.63
59 0.59
60 0.59
61 0.56
62 0.48
63 0.43
64 0.36
65 0.3
66 0.23
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.17
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.09
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.19
81 0.21
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.15
87 0.15
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.11
112 0.12
113 0.14
114 0.19
115 0.18
116 0.2
117 0.22
118 0.25
119 0.22
120 0.28
121 0.28
122 0.24
123 0.24
124 0.22
125 0.2
126 0.18
127 0.17
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.14
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.12
168 0.19
169 0.24
170 0.26
171 0.29
172 0.3
173 0.34
174 0.35
175 0.34
176 0.38
177 0.35
178 0.35
179 0.35
180 0.33
181 0.29
182 0.31
183 0.36
184 0.27
185 0.27
186 0.26
187 0.24
188 0.26
189 0.26
190 0.32
191 0.32
192 0.39
193 0.38
194 0.37
195 0.36
196 0.36
197 0.36
198 0.32
199 0.24
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.23
228 0.25
229 0.26
230 0.31
231 0.29
232 0.29
233 0.34
234 0.34
235 0.35
236 0.34
237 0.34
238 0.29
239 0.29
240 0.27
241 0.2
242 0.21
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.28
247 0.26
248 0.3
249 0.32
250 0.35
251 0.39
252 0.43
253 0.46
254 0.46
255 0.5
256 0.48
257 0.52
258 0.55
259 0.51
260 0.46
261 0.41
262 0.35
263 0.32
264 0.3
265 0.28
266 0.24
267 0.25
268 0.25
269 0.25
270 0.24
271 0.22
272 0.22
273 0.19
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.21
289 0.22
290 0.24
291 0.33
292 0.42
293 0.5
294 0.55
295 0.59
296 0.55
297 0.61
298 0.69
299 0.68
300 0.65
301 0.6
302 0.56
303 0.5
304 0.47
305 0.42
306 0.35
307 0.28
308 0.24
309 0.26
310 0.24
311 0.28
312 0.31
313 0.33
314 0.32
315 0.35
316 0.34
317 0.34
318 0.37
319 0.36
320 0.33
321 0.33
322 0.31
323 0.28
324 0.31
325 0.34
326 0.34
327 0.39
328 0.47
329 0.53
330 0.62
331 0.72
332 0.77
333 0.8
334 0.83
335 0.86
336 0.87
337 0.84
338 0.79
339 0.76
340 0.7
341 0.61
342 0.55
343 0.46
344 0.39
345 0.39
346 0.39
347 0.37
348 0.35
349 0.36
350 0.4
351 0.47
352 0.51
353 0.52
354 0.56
355 0.6
356 0.63
357 0.63
358 0.58
359 0.53
360 0.46
361 0.44
362 0.4
363 0.35
364 0.31
365 0.37
366 0.45
367 0.52
368 0.59
369 0.64
370 0.69
371 0.75