Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FGT1

Protein Details
Accession C5FGT1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MKTRREKKKKKKDKIYREDQAMANBasic
862-889LHLDTIKQRNKPKEAPKKPKKAPFFLPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14TRREKKKKKKDK
869-883QRNKPKEAPKKPKKA
Subcellular Location(s) plas 10, nucl 8, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MKTRREKKKKKKDKIYREDQAMANEAFDLPLAKRQKVVTEKTSYSGAPEGSRIFTPFRMLILRSQTLGLVSSTSVPFTCIPLGKTTFQITTSVGHCLQTYDLRRGLSLVFLTRPQTPALITATYAWKDRVFAAWGGQSSAQQRGVWVFKRGKRVAELEMPAIAPGAAAQSIERLVVFGSWIVGCCSNCILVWKSTDYSHYTTLTPAATKEFTKLLPSTLCTMPTYLNKVFVGRSNGCVDIWNVSTGKLVYSILPTVPGAGAVSALQPSPALSLLAIAHASGALVIHNVQTDKPVLYLRKPGAANSSPITSISFRTDRIGAGEDGRKDGVMATANADGGDIVMWDLNDGGRVTGVVRNAHEPSGEDRGVQINKIEFLAGQPVMVSTGSDNALRTWIFDETPFSPTPRPLHVRSGHSAPITKVMFVPSGSDGSEVVGKWLLSAGQDRSLFGLSLRKDSQNSELSQGNVKSRSKKIGISSTLSGQQVIRYEELKAPEITCLACSLNRDGGMGTAVGGPVWANAKASSAENTNMTGWESIVTGHKGDKFARTWIWGKKKAGRWALETGDSTEVKSVAISQCGTFAFVGSDGGSLVMYNLQSGLRRQSFPPRITPAQVKKARLQRLVDAKSNQLDTKAPTKHTKAITGIVVDSLNTTVVSCGLDGKVKLLDELDWNPMCAITGLRFSSTSDLLALSCDDLSIRVIDIQTKKLVRELWGCVGQVNDFTISNDGRWIVAASMDSVIRVWDLPTGHLIDAFKLKNTCVALTFSSTGEFLATAHADGVGINIWNNKSLFTHVPTRHLEEDSVAVVATPTASGEGGVVMIEAAFDDNDISGGEKPPVLTPDQLSHNMMTLSMTPKTRWQTLLHLDTIKQRNKPKEAPKKPKKAPFFLPSLESNSTSELTRLDKAAADQDEDEKKALHAERSRIARIQRMSGSGGQFSQFTTLLHSSGQTNDFTPFIEYLKLLSPANTDLEIRSLDPRSQEGQDNELALFVRALTERLRQKRDFELVNTWMAVFLRVHNDAVEAAVGFQSDGSNGSMFVTNVALQQALREWKVEQESETKRLADLVSYCRGIVGFLRSAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.97
2 0.96
3 0.94
4 0.91
5 0.86
6 0.77
7 0.7
8 0.63
9 0.52
10 0.41
11 0.32
12 0.25
13 0.18
14 0.15
15 0.13
16 0.09
17 0.17
18 0.21
19 0.22
20 0.25
21 0.27
22 0.36
23 0.43
24 0.5
25 0.5
26 0.54
27 0.55
28 0.54
29 0.55
30 0.46
31 0.4
32 0.36
33 0.3
34 0.23
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.26
43 0.23
44 0.24
45 0.25
46 0.25
47 0.29
48 0.34
49 0.34
50 0.31
51 0.3
52 0.28
53 0.25
54 0.24
55 0.19
56 0.12
57 0.11
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.2
66 0.19
67 0.2
68 0.25
69 0.3
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.3
74 0.28
75 0.29
76 0.24
77 0.23
78 0.23
79 0.25
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.19
84 0.21
85 0.25
86 0.28
87 0.29
88 0.31
89 0.31
90 0.31
91 0.31
92 0.29
93 0.24
94 0.22
95 0.19
96 0.18
97 0.2
98 0.22
99 0.24
100 0.25
101 0.22
102 0.21
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.18
107 0.16
108 0.18
109 0.22
110 0.23
111 0.24
112 0.23
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.22
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.25
127 0.24
128 0.2
129 0.21
130 0.24
131 0.3
132 0.3
133 0.36
134 0.4
135 0.43
136 0.53
137 0.55
138 0.54
139 0.53
140 0.53
141 0.51
142 0.5
143 0.48
144 0.39
145 0.37
146 0.33
147 0.27
148 0.24
149 0.17
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.2
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.26
183 0.26
184 0.27
185 0.28
186 0.27
187 0.25
188 0.24
189 0.25
190 0.23
191 0.19
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.19
198 0.18
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.21
203 0.22
204 0.25
205 0.24
206 0.25
207 0.21
208 0.22
209 0.22
210 0.24
211 0.29
212 0.25
213 0.27
214 0.26
215 0.27
216 0.27
217 0.28
218 0.32
219 0.26
220 0.29
221 0.28
222 0.28
223 0.27
224 0.27
225 0.23
226 0.18
227 0.18
228 0.17
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.11
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.15
281 0.17
282 0.19
283 0.26
284 0.26
285 0.31
286 0.31
287 0.31
288 0.34
289 0.33
290 0.34
291 0.28
292 0.28
293 0.22
294 0.22
295 0.23
296 0.16
297 0.16
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.2
302 0.2
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.16
307 0.18
308 0.22
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.18
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.05
338 0.06
339 0.08
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.16
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.21
350 0.2
351 0.17
352 0.17
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.19
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.08
362 0.08
363 0.12
364 0.1
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.04
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.13
385 0.13
386 0.17
387 0.17
388 0.17
389 0.17
390 0.2
391 0.23
392 0.26
393 0.29
394 0.29
395 0.37
396 0.4
397 0.44
398 0.43
399 0.44
400 0.41
401 0.37
402 0.36
403 0.27
404 0.29
405 0.24
406 0.22
407 0.19
408 0.17
409 0.16
410 0.15
411 0.16
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.09
428 0.09
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.12
436 0.16
437 0.12
438 0.17
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.21
443 0.26
444 0.25
445 0.26
446 0.24
447 0.24
448 0.23
449 0.26
450 0.25
451 0.23
452 0.23
453 0.25
454 0.28
455 0.29
456 0.33
457 0.32
458 0.34
459 0.36
460 0.38
461 0.39
462 0.37
463 0.35
464 0.31
465 0.33
466 0.29
467 0.25
468 0.18
469 0.16
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.11
474 0.13
475 0.15
476 0.16
477 0.17
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.1
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.07
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.1
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.09
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.15
531 0.15
532 0.17
533 0.17
534 0.19
535 0.23
536 0.29
537 0.37
538 0.4
539 0.42
540 0.47
541 0.52
542 0.56
543 0.58
544 0.52
545 0.48
546 0.46
547 0.44
548 0.39
549 0.33
550 0.27
551 0.23
552 0.21
553 0.17
554 0.13
555 0.11
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.08
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.05
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.06
584 0.07
585 0.13
586 0.14
587 0.16
588 0.18
589 0.27
590 0.34
591 0.36
592 0.4
593 0.41
594 0.4
595 0.42
596 0.49
597 0.45
598 0.48
599 0.51
600 0.48
601 0.48
602 0.55
603 0.58
604 0.55
605 0.51
606 0.47
607 0.52
608 0.53
609 0.51
610 0.44
611 0.4
612 0.37
613 0.36
614 0.3
615 0.22
616 0.19
617 0.17
618 0.23
619 0.24
620 0.26
621 0.29
622 0.33
623 0.38
624 0.38
625 0.39
626 0.33
627 0.33
628 0.3
629 0.26
630 0.22
631 0.17
632 0.15
633 0.11
634 0.1
635 0.07
636 0.06
637 0.05
638 0.05
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.04
643 0.05
644 0.06
645 0.07
646 0.07
647 0.09
648 0.1
649 0.09
650 0.1
651 0.09
652 0.09
653 0.11
654 0.12
655 0.17
656 0.15
657 0.15
658 0.15
659 0.14
660 0.14
661 0.11
662 0.1
663 0.06
664 0.09
665 0.09
666 0.1
667 0.11
668 0.11
669 0.13
670 0.13
671 0.12
672 0.09
673 0.09
674 0.08
675 0.09
676 0.08
677 0.06
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.12
688 0.14
689 0.16
690 0.2
691 0.21
692 0.21
693 0.23
694 0.24
695 0.23
696 0.26
697 0.27
698 0.27
699 0.28
700 0.28
701 0.25
702 0.24
703 0.2
704 0.16
705 0.14
706 0.1
707 0.08
708 0.08
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.06
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.05
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.1
733 0.12
734 0.12
735 0.13
736 0.13
737 0.12
738 0.17
739 0.17
740 0.17
741 0.17
742 0.17
743 0.19
744 0.2
745 0.19
746 0.15
747 0.18
748 0.16
749 0.18
750 0.19
751 0.15
752 0.15
753 0.14
754 0.13
755 0.1
756 0.09
757 0.06
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.08
770 0.08
771 0.11
772 0.11
773 0.12
774 0.12
775 0.16
776 0.18
777 0.19
778 0.29
779 0.28
780 0.34
781 0.36
782 0.41
783 0.39
784 0.38
785 0.34
786 0.26
787 0.25
788 0.19
789 0.17
790 0.11
791 0.08
792 0.07
793 0.06
794 0.05
795 0.04
796 0.03
797 0.04
798 0.04
799 0.04
800 0.04
801 0.04
802 0.04
803 0.04
804 0.04
805 0.03
806 0.03
807 0.03
808 0.03
809 0.03
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.03
814 0.04
815 0.04
816 0.06
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.1
822 0.12
823 0.14
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.2
828 0.25
829 0.26
830 0.27
831 0.25
832 0.24
833 0.22
834 0.2
835 0.16
836 0.14
837 0.15
838 0.16
839 0.17
840 0.17
841 0.24
842 0.28
843 0.31
844 0.31
845 0.31
846 0.36
847 0.43
848 0.47
849 0.44
850 0.41
851 0.4
852 0.46
853 0.51
854 0.49
855 0.47
856 0.51
857 0.56
858 0.62
859 0.7
860 0.72
861 0.75
862 0.8
863 0.85
864 0.87
865 0.9
866 0.91
867 0.91
868 0.89
869 0.85
870 0.83
871 0.78
872 0.73
873 0.65
874 0.59
875 0.53
876 0.5
877 0.44
878 0.37
879 0.32
880 0.27
881 0.26
882 0.22
883 0.2
884 0.16
885 0.17
886 0.17
887 0.17
888 0.16
889 0.16
890 0.16
891 0.22
892 0.21
893 0.2
894 0.2
895 0.25
896 0.27
897 0.28
898 0.27
899 0.21
900 0.2
901 0.24
902 0.26
903 0.28
904 0.3
905 0.34
906 0.4
907 0.45
908 0.49
909 0.47
910 0.48
911 0.47
912 0.45
913 0.46
914 0.42
915 0.39
916 0.39
917 0.39
918 0.38
919 0.32
920 0.3
921 0.24
922 0.22
923 0.19
924 0.19
925 0.14
926 0.12
927 0.16
928 0.16
929 0.16
930 0.16
931 0.17
932 0.16
933 0.19
934 0.21
935 0.17
936 0.17
937 0.17
938 0.17
939 0.17
940 0.18
941 0.15
942 0.14
943 0.14
944 0.13
945 0.14
946 0.17
947 0.18
948 0.16
949 0.16
950 0.17
951 0.18
952 0.2
953 0.19
954 0.17
955 0.15
956 0.17
957 0.17
958 0.17
959 0.2
960 0.2
961 0.21
962 0.22
963 0.26
964 0.27
965 0.3
966 0.35
967 0.32
968 0.34
969 0.34
970 0.33
971 0.29
972 0.26
973 0.23
974 0.16
975 0.14
976 0.1
977 0.1
978 0.09
979 0.11
980 0.13
981 0.2
982 0.29
983 0.38
984 0.47
985 0.47
986 0.52
987 0.58
988 0.63
989 0.6
990 0.55
991 0.53
992 0.49
993 0.48
994 0.44
995 0.35
996 0.29
997 0.25
998 0.22
999 0.15
1000 0.15
1001 0.18
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.18
1005 0.19
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.15
1009 0.09
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.07
1014 0.07
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.08
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.09
1021 0.11
1022 0.12
1023 0.12
1024 0.12
1025 0.12
1026 0.12
1027 0.13
1028 0.13
1029 0.12
1030 0.1
1031 0.12
1032 0.16
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.2
1036 0.21
1037 0.26
1038 0.32
1039 0.32
1040 0.3
1041 0.34
1042 0.4
1043 0.43
1044 0.45
1045 0.39
1046 0.34
1047 0.35
1048 0.32
1049 0.28
1050 0.26
1051 0.27
1052 0.3
1053 0.3
1054 0.3
1055 0.28
1056 0.27
1057 0.24
1058 0.22
1059 0.22