FuNGI

A0A5C3MDS8

Protein Details

Accession

A0A5C3MDS8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
790-811	LKALLQKEKQRKDKVADSNRTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 8.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MDSDQDWTLLLKDHPIFSLPKNLTGPTTSAQSALELSTNTLPRFKQVDSENDGPTPSGRRQAMILKDADLIVAAGKELRMTSLGDAKLSRSTRKSYKTLHTPNIQFEIHQIALNPSGKLLAVAGAFQIAVVVLPRSGFARLVPDAIDCKSVQIGQFFHATGNSAPIAKIDWHPWGEAGATLLVMTVDGKLREYDISVDTEEPQQVLSFVPERKFKSFVAEDQSEREVASFTLGKGRADWGPLTIYAVMKSGDIYSICPYMPQNASIPSSYVHSLECFVAAKQEFLAQGTSIATKNLSTLYDYQHKYITSLIKQLPPGTVFPAPSRSVLMHPPTTIKSQPMRQGPFLLQPSPRSLEYSEGGDATDITYLAFGTDDEDSEDGGAETEHLGVMMVAYQDGKVDVFLDVEKVEARWDIKHVSNRDLPMLAVYETIDLGLVSTLRGISTTPDESPILSLLDGNHPVFLTDPIHDDTLYVYHAFGVHSLHIGPLLQSLAVALREDDDEAETSLDSTLQKSAGTVVQPILTTFSVERRCSNPVVAVAIPNDVYLTYSIFIVTSAMRIEVFPLSLRSDSPRIQPKQIEINGTAVSSVEPSTWLLPMEGLKSYVSLLGTEAYKPPPVLSRTTGLPSNPKLSLPKDASGSKEFMLTPDTLRFIGTIVGKISSQIHEIQLAQKAAEARATLQQQELVRLCGKCKEMDDQIQQMKNVKATAMETRFKKIQEQQKSLLSRLDRTLQGLMEKASPELSEHETKWFEELKRMKEEIAGSTKYDEGSLAARTKLLEHEYERLLPGLKALLQKEKQRKDKVADSNRTLGFSQAFELGERSNLERTKISNIEKELSKLAAKVDLTLTRPPPALPAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.27
4	0.26
5	0.36
6	0.31
7	0.35
8	0.36
9	0.36
10	0.36
11	0.34
12	0.35
13	0.27
14	0.3
15	0.24
16	0.23
17	0.22
18	0.2
19	0.19
20	0.16
21	0.16
22	0.12
23	0.14
24	0.19
25	0.23
26	0.23
27	0.26
28	0.25
29	0.29
30	0.33
31	0.31
32	0.32
33	0.34
34	0.41
35	0.45
36	0.5
37	0.46
38	0.43
39	0.43
40	0.36
41	0.33
42	0.3
43	0.26
44	0.29
45	0.27
46	0.27
47	0.31
48	0.38
49	0.41
50	0.42
51	0.4
52	0.33
53	0.34
54	0.32
55	0.29
56	0.21
57	0.15
58	0.1
59	0.08
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.08
67	0.09
68	0.12
69	0.18
70	0.19
71	0.2
72	0.21
73	0.22
74	0.29
75	0.31
76	0.35
77	0.32
78	0.4
79	0.47
80	0.53
81	0.59
82	0.59
83	0.66
84	0.71
85	0.75
86	0.76
87	0.76
88	0.73
89	0.71
90	0.69
91	0.59
92	0.48
93	0.4
94	0.38
95	0.3
96	0.26
97	0.22
98	0.18
99	0.24
100	0.26
101	0.23
102	0.17
103	0.17
104	0.16
105	0.15
106	0.13
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.06
122	0.07
123	0.08
124	0.09
125	0.09
126	0.14
127	0.14
128	0.15
129	0.16
130	0.16
131	0.18
132	0.18
133	0.2
134	0.14
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.16
139	0.18
140	0.18
141	0.17
142	0.2
143	0.19
144	0.18
145	0.16
146	0.16
147	0.13
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.12
154	0.13
155	0.15
156	0.15
157	0.2
158	0.2
159	0.21
160	0.21
161	0.19
162	0.17
163	0.15
164	0.13
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.06
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.1
178	0.1
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.14
183	0.14
184	0.15
185	0.15
186	0.17
187	0.17
188	0.14
189	0.13
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.13
195	0.16
196	0.2
197	0.26
198	0.3
199	0.33
200	0.36
201	0.33
202	0.37
203	0.36
204	0.37
205	0.39
206	0.38
207	0.36
208	0.36
209	0.37
210	0.29
211	0.26
212	0.22
213	0.14
214	0.11
215	0.12
216	0.1
217	0.09
218	0.16
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.19
223	0.17
224	0.19
225	0.18
226	0.13
227	0.14
228	0.13
229	0.15
230	0.13
231	0.13
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.09
236	0.1
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.12
246	0.16
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.18
251	0.2
252	0.19
253	0.19
254	0.14
255	0.16
256	0.15
257	0.14
258	0.11
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.13
266	0.13
267	0.12
268	0.11
269	0.13
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.11
286	0.15
287	0.23
288	0.24
289	0.25
290	0.26
291	0.26
292	0.24
293	0.27
294	0.27
295	0.21
296	0.26
297	0.28
298	0.28
299	0.3
300	0.3
301	0.28
302	0.24
303	0.23
304	0.2
305	0.19
306	0.17
307	0.17
308	0.2
309	0.19
310	0.19
311	0.19
312	0.17
313	0.17
314	0.21
315	0.24
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.23
320	0.25
321	0.24
322	0.24
323	0.24
324	0.28
325	0.34
326	0.39
327	0.41
328	0.38
329	0.4
330	0.37
331	0.39
332	0.36
333	0.32
334	0.26
335	0.25
336	0.27
337	0.27
338	0.25
339	0.21
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.19
344	0.16
345	0.13
346	0.13
347	0.11
348	0.1
349	0.07
350	0.06
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.03
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.11
401	0.15
402	0.21
403	0.22
404	0.26
405	0.28
406	0.28
407	0.28
408	0.25
409	0.21
410	0.16
411	0.14
412	0.1
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.02
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.07
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.1
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.07
452	0.09
453	0.1
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.08
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.11
510	0.09
511	0.1
512	0.09
513	0.15
514	0.19
515	0.2
516	0.22
517	0.22
518	0.25
519	0.26
520	0.26
521	0.22
522	0.18
523	0.2
524	0.18
525	0.16
526	0.14
527	0.13
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.1
553	0.1
554	0.11
555	0.13
556	0.17
557	0.19
558	0.25
559	0.34
560	0.35
561	0.39
562	0.41
563	0.41
564	0.46
565	0.47
566	0.43
567	0.35
568	0.34
569	0.3
570	0.28
571	0.24
572	0.14
573	0.12
574	0.09
575	0.08
576	0.05
577	0.06
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.07
583	0.08
584	0.09
585	0.1
586	0.09
587	0.1
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.1
598	0.12
599	0.12
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.18
604	0.19
605	0.22
606	0.23
607	0.24
608	0.25
609	0.28
610	0.29
611	0.25
612	0.3
613	0.29
614	0.3
615	0.28
616	0.28
617	0.29
618	0.29
619	0.36
620	0.33
621	0.33
622	0.33
623	0.34
624	0.37
625	0.35
626	0.35
627	0.27
628	0.26
629	0.23
630	0.19
631	0.2
632	0.16
633	0.16
634	0.16
635	0.17
636	0.15
637	0.15
638	0.14
639	0.12
640	0.15
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.13
645	0.12
646	0.14
647	0.15
648	0.13
649	0.14
650	0.14
651	0.14
652	0.15
653	0.16
654	0.19
655	0.22
656	0.21
657	0.18
658	0.19
659	0.19
660	0.18
661	0.19
662	0.16
663	0.12
664	0.18
665	0.2
666	0.19
667	0.18
668	0.22
669	0.21
670	0.27
671	0.26
672	0.23
673	0.26
674	0.26
675	0.27
676	0.28
677	0.29
678	0.26
679	0.27
680	0.3
681	0.32
682	0.39
683	0.43
684	0.45
685	0.51
686	0.51
687	0.5
688	0.49
689	0.45
690	0.39
691	0.34
692	0.26
693	0.21
694	0.21
695	0.28
696	0.29
697	0.34
698	0.33
699	0.39
700	0.42
701	0.41
702	0.46
703	0.46
704	0.5
705	0.54
706	0.59
707	0.58
708	0.63
709	0.65
710	0.6
711	0.57
712	0.49
713	0.42
714	0.39
715	0.4
716	0.33
717	0.32
718	0.33
719	0.28
720	0.28
721	0.25
722	0.23
723	0.2
724	0.19
725	0.17
726	0.15
727	0.14
728	0.14
729	0.16
730	0.2
731	0.22
732	0.22
733	0.28
734	0.28
735	0.28
736	0.31
737	0.34
738	0.29
739	0.34
740	0.4
741	0.41
742	0.47
743	0.47
744	0.44
745	0.42
746	0.43
747	0.41
748	0.4
749	0.36
750	0.3
751	0.31
752	0.31
753	0.27
754	0.25
755	0.18
756	0.12
757	0.13
758	0.16
759	0.17
760	0.16
761	0.17
762	0.17
763	0.18
764	0.22
765	0.22
766	0.23
767	0.24
768	0.29
769	0.31
770	0.33
771	0.32
772	0.29
773	0.28
774	0.22
775	0.2
776	0.18
777	0.18
778	0.21
779	0.24
780	0.32
781	0.36
782	0.46
783	0.55
784	0.63
785	0.69
786	0.73
787	0.78
788	0.76
789	0.8
790	0.82
791	0.82
792	0.81
793	0.77
794	0.76
795	0.7
796	0.65
797	0.55
798	0.47
799	0.38
800	0.29
801	0.25
802	0.2
803	0.19
804	0.16
805	0.18
806	0.16
807	0.16
808	0.18
809	0.19
810	0.23
811	0.24
812	0.26
813	0.28
814	0.3
815	0.36
816	0.41
817	0.44
818	0.44
819	0.47
820	0.5
821	0.5
822	0.5
823	0.44
824	0.4
825	0.36
826	0.31
827	0.28
828	0.27
829	0.25
830	0.24
831	0.26
832	0.28
833	0.3
834	0.35
835	0.36
836	0.34
837	0.35
838	0.33

A0A5C3MDS8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer