FuNGI

A0A5C3MDJ3

Protein Details

Accession

A0A5C3MDJ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-31	SMSLLFHPKKTAKKEQPAPARNPSSP	Hydrophilic
81-102	DISKWTPPIKLNRKDLRRDEPS	Hydrophilic
153-175	KAAANNAKKRFQKKTKQVFLVSD	Hydrophilic
228-247	VPAHRWYKFQKKLKHDFPTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
151-166	KGKAAANNAKKRFQKK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKASMSLLFHPKKTAKKEQPAPARNPSSPSPRPASTPAKEDEDELKLPDGPYQEFRLLSSALNGWKYDVMKFESRKPVDISKWTPPIKLNRKDLRRDEPSGAGAPEAVKPMVGLDGKPVIGADGRVVMVDAENRPIHSTDGAASGSKDKGKAAANNAKKRFQKKTKQVFLVSDETRQLRREERYPWVMEDSSQEQNELWIGQMEEVKKAETHAFFMPAANDIFKFVPAHRWYKFQKKLKHDFPTDTANVESLYTLSQKRDPQAFLTSRKGTVSAATAAMFKAEAEGRTISIGSSLVHNAGQSLGPGGRKLKTVDSGVDGLFDDDEDGDAKRRREKEYGGEGDMDEQLYEEEFADDDEAMQVDDNDEEAKEVEERLKKEYRAANKQGDTGVDDDEDEEPDTGVTKQEKAMQKLIRNREGNDAYESDEEKNPYASSDEEEEEELPVPTGPAIQPQPESRSQTPKAPTPRPQVNGGTDSRATSPAASPSLGGHSVLAKRATSPKPPKPKTSNGSRANSPLGSRASSPVAGSRATSPMGTVSNGARAESPGIQKVNNKRKAEESPSSTNVSHAPNGGNQAPKVKKRKATAHDSSPLSSAELEAMLVGWLMNTPNATTRDCIHHFTRYLTDAEKKSEFSNLVKKVAQLKGGVLVLRQQTAESSPAPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.65
4	0.65
5	0.72
6	0.8
7	0.83
8	0.87
9	0.87
10	0.86
11	0.85
12	0.81
13	0.73
14	0.69
15	0.65
16	0.64
17	0.6
18	0.6
19	0.56
20	0.51
21	0.53
22	0.56
23	0.59
24	0.54
25	0.54
26	0.52
27	0.51
28	0.5
29	0.48
30	0.45
31	0.4
32	0.37
33	0.33
34	0.31
35	0.26
36	0.26
37	0.26
38	0.24
39	0.22
40	0.25
41	0.27
42	0.29
43	0.27
44	0.27
45	0.27
46	0.25
47	0.22
48	0.21
49	0.2
50	0.21
51	0.22
52	0.22
53	0.2
54	0.23
55	0.24
56	0.23
57	0.24
58	0.25
59	0.32
60	0.35
61	0.42
62	0.48
63	0.49
64	0.51
65	0.52
66	0.54
67	0.52
68	0.58
69	0.55
70	0.53
71	0.61
72	0.59
73	0.57
74	0.56
75	0.6
76	0.62
77	0.65
78	0.67
79	0.68
80	0.74
81	0.81
82	0.83
83	0.82
84	0.79
85	0.75
86	0.69
87	0.63
88	0.57
89	0.5
90	0.42
91	0.32
92	0.26
93	0.21
94	0.19
95	0.17
96	0.13
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.14
101	0.13
102	0.12
103	0.13
104	0.15
105	0.15
106	0.15
107	0.14
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.07
117	0.08
118	0.11
119	0.11
120	0.14
121	0.14
122	0.15
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.16
127	0.16
128	0.12
129	0.14
130	0.14
131	0.13
132	0.13
133	0.15
134	0.17
135	0.18
136	0.17
137	0.15
138	0.19
139	0.23
140	0.27
141	0.33
142	0.4
143	0.48
144	0.57
145	0.62
146	0.65
147	0.67
148	0.7
149	0.72
150	0.72
151	0.74
152	0.75
153	0.82
154	0.84
155	0.84
156	0.81
157	0.74
158	0.69
159	0.65
160	0.55
161	0.47
162	0.41
163	0.36
164	0.34
165	0.32
166	0.29
167	0.28
168	0.31
169	0.34
170	0.35
171	0.4
172	0.44
173	0.44
174	0.44
175	0.42
176	0.37
177	0.33
178	0.32
179	0.28
180	0.26
181	0.24
182	0.23
183	0.18
184	0.18
185	0.18
186	0.14
187	0.1
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.14
198	0.17
199	0.15
200	0.17
201	0.16
202	0.18
203	0.17
204	0.18
205	0.17
206	0.14
207	0.14
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.1
215	0.18
216	0.22
217	0.28
218	0.27
219	0.34
220	0.39
221	0.48
222	0.58
223	0.57
224	0.62
225	0.66
226	0.75
227	0.77
228	0.8
229	0.74
230	0.68
231	0.63
232	0.61
233	0.52
234	0.43
235	0.34
236	0.25
237	0.21
238	0.17
239	0.14
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.1
244	0.11
245	0.15
246	0.18
247	0.21
248	0.25
249	0.25
250	0.26
251	0.32
252	0.35
253	0.35
254	0.39
255	0.37
256	0.34
257	0.33
258	0.31
259	0.24
260	0.2
261	0.17
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.09
268	0.08
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.18
305	0.16
306	0.15
307	0.13
308	0.1
309	0.08
310	0.07
311	0.05
312	0.03
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.08
317	0.11
318	0.13
319	0.18
320	0.22
321	0.26
322	0.29
323	0.31
324	0.35
325	0.41
326	0.43
327	0.38
328	0.35
329	0.31
330	0.29
331	0.26
332	0.19
333	0.09
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.1
361	0.14
362	0.15
363	0.2
364	0.24
365	0.24
366	0.3
367	0.35
368	0.39
369	0.45
370	0.5
371	0.52
372	0.49
373	0.5
374	0.45
375	0.4
376	0.32
377	0.24
378	0.18
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.06
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.11
394	0.18
395	0.23
396	0.26
397	0.33
398	0.35
399	0.41
400	0.48
401	0.54
402	0.56
403	0.53
404	0.51
405	0.52
406	0.49
407	0.45
408	0.39
409	0.33
410	0.26
411	0.26
412	0.26
413	0.2
414	0.2
415	0.19
416	0.17
417	0.17
418	0.14
419	0.13
420	0.13
421	0.11
422	0.11
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.14
427	0.13
428	0.13
429	0.13
430	0.11
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.07
436	0.06
437	0.1
438	0.11
439	0.13
440	0.15
441	0.17
442	0.22
443	0.26
444	0.33
445	0.32
446	0.39
447	0.4
448	0.44
449	0.46
450	0.49
451	0.53
452	0.54
453	0.58
454	0.59
455	0.64
456	0.6
457	0.62
458	0.59
459	0.54
460	0.51
461	0.44
462	0.4
463	0.32
464	0.3
465	0.27
466	0.23
467	0.2
468	0.16
469	0.16
470	0.15
471	0.16
472	0.14
473	0.13
474	0.13
475	0.16
476	0.15
477	0.14
478	0.11
479	0.13
480	0.15
481	0.17
482	0.18
483	0.15
484	0.17
485	0.26
486	0.29
487	0.36
488	0.44
489	0.51
490	0.61
491	0.66
492	0.74
493	0.73
494	0.79
495	0.76
496	0.77
497	0.78
498	0.76
499	0.76
500	0.69
501	0.65
502	0.59
503	0.53
504	0.43
505	0.37
506	0.3
507	0.27
508	0.25
509	0.24
510	0.22
511	0.21
512	0.21
513	0.19
514	0.19
515	0.18
516	0.18
517	0.17
518	0.17
519	0.17
520	0.16
521	0.13
522	0.14
523	0.15
524	0.14
525	0.14
526	0.12
527	0.17
528	0.18
529	0.18
530	0.16
531	0.16
532	0.18
533	0.2
534	0.23
535	0.22
536	0.23
537	0.25
538	0.32
539	0.42
540	0.5
541	0.55
542	0.54
543	0.52
544	0.57
545	0.63
546	0.65
547	0.63
548	0.59
549	0.58
550	0.58
551	0.6
552	0.53
553	0.46
554	0.42
555	0.36
556	0.31
557	0.26
558	0.24
559	0.22
560	0.26
561	0.29
562	0.29
563	0.26
564	0.34
565	0.39
566	0.47
567	0.54
568	0.57
569	0.61
570	0.66
571	0.75
572	0.75
573	0.77
574	0.77
575	0.77
576	0.77
577	0.72
578	0.65
579	0.56
580	0.48
581	0.39
582	0.3
583	0.22
584	0.14
585	0.11
586	0.09
587	0.07
588	0.07
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.04
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.13
599	0.17
600	0.18
601	0.2
602	0.22
603	0.3
604	0.33
605	0.38
606	0.36
607	0.4
608	0.41
609	0.42
610	0.44
611	0.38
612	0.38
613	0.37
614	0.42
615	0.38
616	0.42
617	0.41
618	0.38
619	0.36
620	0.39
621	0.38
622	0.36
623	0.42
624	0.41
625	0.43
626	0.43
627	0.46
628	0.49
629	0.5
630	0.47
631	0.39
632	0.36
633	0.36
634	0.37
635	0.33
636	0.25
637	0.27
638	0.26
639	0.26
640	0.25
641	0.2
642	0.19
643	0.21
644	0.24

A0A5C3MDJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer