Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FD50

Protein Details
Accession C5FD50    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49GHRGGRGRVSHRRGRGRGRGDBasic
64-93EGQPQPPQEQEQQRRPRRGRGRGRGASHAGHydrophilic
163-189PSSSTASTPKQPRRHHNKPTRSLTKSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-47RPHGGHRGGRGRVSHRRGRGRGR
77-90RRPRRGRGRGRGAS
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
Amino Acid Sequences MTSVDVPAPTTASSSVANTANGPLRPHGGHRGGRGRVSHRRGRGRGRGDGVAVVDGAQQQQQPEGQPQPPQEQEQQRRPRRGRGRGRGASHAGRSEVVTTRTFRGRLTRPNEPASPSSAHGSTSNHTSQGQKHSDGAESSSLRPDASVFVPGRRHQALHPAPPSSSTASTPKQPRRHHNKPTRSLTKSVADNITTRIHEDISNGLYECPICTSELGPKSKVWSCRQCWTVFHLHCIKKWSTNEGSVHTRPRDQEQQDDSQLPPARQWRCPGCNLPQDTLPSGYTCWCEKEVDIRSLPGLPPHSCGQSCSRSREGCPHPCDSVCHAGPCAPCQAMGPVQSCYCGRHEAQKKCVDTDYTSGWSCRETCEEVLPCLQHTCQRACHEGLCGECEELVPARCYCGKVSNKILCNLKEEERESRNQKESWIGSFTCPDICGRLYDCGIHQCEKLCHPQELQPSHCPTAPDMISYCTCGKTKLADMDTEPRKTCTGPVPNCQKSCDKLLKCGHTCPKACHTGPCPPCFVTTDISCMCGRSTSKTLCHQGKLEPPSCMRVCKAALNCGRHVCGERCCTGERKAIDRLATKKKLKSMNVRQADETDIEAEHICTRVCGRLLKCGTHECQELCHRGPCARCPEAIFHEITCNCGRSVLYPPLPCGTGPPPCNFNCGRAKRCGHPQTPHNCHTDDEACPKCPFLTEKRCLCGKKVLKNQPCWLVDGRCGLVCGQELQCGSHTCKKECHRPGDCEDSTTGCQQPCGKVKKQCSHICTEPCHAPFPCPEKTPCQSKIIITCQCGRMKQEKRCGASKDKDRQGHEAPSSLPCDEECGRIQRNRAIASAFGLCVDPSASSNAAASEPLTLENLPYSKGTLDMYMELASSSSLSAIETCESKLYDLALSMTDRSARFPPARANFRAFVHSLAEDWGFTSESFDPEPHRHVVVYKAGGWLPPSLAGPGIGIRGMSVADCAKFRDRERMKERVAKREAAAERTRLEAVLKDASSASANDGWAQVVSRKRPGTSSSPIEASPYAFGTTTPNDLKGKLVLRSGIGAGRNIGSNSRFGALGMTDADEGVVEDWEEEVAREEREMEEKMDMQHDGSSPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.19
4 0.19
5 0.18
6 0.22
7 0.26
8 0.27
9 0.27
10 0.25
11 0.28
12 0.29
13 0.33
14 0.38
15 0.41
16 0.44
17 0.5
18 0.57
19 0.56
20 0.6
21 0.61
22 0.61
23 0.63
24 0.66
25 0.66
26 0.67
27 0.73
28 0.77
29 0.81
30 0.82
31 0.79
32 0.8
33 0.76
34 0.7
35 0.61
36 0.55
37 0.45
38 0.36
39 0.28
40 0.2
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.15
48 0.17
49 0.19
50 0.24
51 0.3
52 0.31
53 0.36
54 0.4
55 0.45
56 0.47
57 0.49
58 0.52
59 0.56
60 0.63
61 0.67
62 0.74
63 0.76
64 0.83
65 0.83
66 0.84
67 0.84
68 0.85
69 0.86
70 0.86
71 0.88
72 0.85
73 0.85
74 0.82
75 0.79
76 0.74
77 0.68
78 0.59
79 0.5
80 0.42
81 0.38
82 0.33
83 0.3
84 0.27
85 0.26
86 0.26
87 0.29
88 0.34
89 0.34
90 0.32
91 0.37
92 0.42
93 0.48
94 0.53
95 0.58
96 0.59
97 0.64
98 0.65
99 0.61
100 0.56
101 0.51
102 0.46
103 0.38
104 0.36
105 0.3
106 0.28
107 0.25
108 0.26
109 0.24
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.26
114 0.29
115 0.33
116 0.39
117 0.42
118 0.37
119 0.39
120 0.38
121 0.39
122 0.36
123 0.32
124 0.29
125 0.26
126 0.26
127 0.27
128 0.26
129 0.23
130 0.22
131 0.2
132 0.17
133 0.16
134 0.21
135 0.19
136 0.23
137 0.29
138 0.31
139 0.37
140 0.36
141 0.37
142 0.31
143 0.41
144 0.43
145 0.46
146 0.48
147 0.44
148 0.42
149 0.42
150 0.43
151 0.37
152 0.31
153 0.26
154 0.28
155 0.29
156 0.37
157 0.45
158 0.52
159 0.58
160 0.64
161 0.72
162 0.76
163 0.84
164 0.87
165 0.88
166 0.89
167 0.9
168 0.92
169 0.91
170 0.85
171 0.79
172 0.73
173 0.68
174 0.61
175 0.56
176 0.49
177 0.41
178 0.37
179 0.36
180 0.35
181 0.29
182 0.27
183 0.22
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.18
201 0.25
202 0.29
203 0.29
204 0.29
205 0.34
206 0.38
207 0.45
208 0.46
209 0.49
210 0.5
211 0.57
212 0.6
213 0.57
214 0.55
215 0.53
216 0.55
217 0.45
218 0.48
219 0.49
220 0.47
221 0.47
222 0.51
223 0.47
224 0.44
225 0.46
226 0.46
227 0.41
228 0.45
229 0.45
230 0.44
231 0.5
232 0.46
233 0.51
234 0.46
235 0.46
236 0.41
237 0.45
238 0.49
239 0.45
240 0.49
241 0.47
242 0.51
243 0.5
244 0.51
245 0.44
246 0.42
247 0.42
248 0.34
249 0.32
250 0.34
251 0.35
252 0.35
253 0.42
254 0.43
255 0.45
256 0.51
257 0.52
258 0.53
259 0.57
260 0.57
261 0.52
262 0.47
263 0.45
264 0.41
265 0.37
266 0.29
267 0.22
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.25
277 0.28
278 0.3
279 0.3
280 0.28
281 0.27
282 0.28
283 0.28
284 0.23
285 0.23
286 0.18
287 0.21
288 0.22
289 0.25
290 0.23
291 0.26
292 0.28
293 0.33
294 0.36
295 0.39
296 0.43
297 0.42
298 0.44
299 0.51
300 0.53
301 0.54
302 0.54
303 0.51
304 0.48
305 0.46
306 0.47
307 0.42
308 0.41
309 0.33
310 0.3
311 0.27
312 0.28
313 0.27
314 0.26
315 0.24
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.17
320 0.15
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.17
331 0.26
332 0.35
333 0.4
334 0.48
335 0.53
336 0.52
337 0.51
338 0.52
339 0.45
340 0.38
341 0.34
342 0.29
343 0.25
344 0.25
345 0.23
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.17
353 0.23
354 0.23
355 0.23
356 0.25
357 0.24
358 0.21
359 0.19
360 0.19
361 0.16
362 0.19
363 0.21
364 0.24
365 0.27
366 0.3
367 0.3
368 0.31
369 0.29
370 0.27
371 0.25
372 0.21
373 0.18
374 0.14
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.22
387 0.25
388 0.28
389 0.37
390 0.42
391 0.43
392 0.47
393 0.51
394 0.43
395 0.44
396 0.41
397 0.37
398 0.35
399 0.35
400 0.36
401 0.35
402 0.4
403 0.41
404 0.44
405 0.44
406 0.4
407 0.39
408 0.38
409 0.36
410 0.32
411 0.31
412 0.25
413 0.22
414 0.22
415 0.21
416 0.16
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.16
428 0.18
429 0.19
430 0.18
431 0.18
432 0.2
433 0.22
434 0.29
435 0.27
436 0.26
437 0.26
438 0.3
439 0.36
440 0.38
441 0.4
442 0.37
443 0.39
444 0.38
445 0.38
446 0.34
447 0.27
448 0.28
449 0.24
450 0.19
451 0.16
452 0.17
453 0.16
454 0.18
455 0.18
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.17
462 0.2
463 0.2
464 0.19
465 0.21
466 0.29
467 0.32
468 0.33
469 0.31
470 0.26
471 0.26
472 0.25
473 0.26
474 0.25
475 0.3
476 0.31
477 0.39
478 0.47
479 0.52
480 0.53
481 0.53
482 0.48
483 0.41
484 0.44
485 0.45
486 0.36
487 0.39
488 0.44
489 0.49
490 0.48
491 0.53
492 0.53
493 0.51
494 0.52
495 0.47
496 0.46
497 0.45
498 0.44
499 0.42
500 0.38
501 0.4
502 0.43
503 0.41
504 0.39
505 0.32
506 0.33
507 0.3
508 0.28
509 0.21
510 0.17
511 0.19
512 0.17
513 0.18
514 0.17
515 0.16
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.13
520 0.18
521 0.18
522 0.22
523 0.27
524 0.34
525 0.35
526 0.36
527 0.34
528 0.33
529 0.37
530 0.39
531 0.36
532 0.31
533 0.29
534 0.33
535 0.32
536 0.3
537 0.23
538 0.2
539 0.19
540 0.22
541 0.22
542 0.25
543 0.29
544 0.31
545 0.33
546 0.31
547 0.31
548 0.27
549 0.29
550 0.23
551 0.22
552 0.22
553 0.21
554 0.22
555 0.23
556 0.25
557 0.25
558 0.28
559 0.25
560 0.26
561 0.29
562 0.29
563 0.3
564 0.32
565 0.36
566 0.4
567 0.46
568 0.47
569 0.46
570 0.5
571 0.54
572 0.56
573 0.59
574 0.61
575 0.63
576 0.65
577 0.64
578 0.58
579 0.52
580 0.48
581 0.37
582 0.27
583 0.18
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.08
588 0.07
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.08
594 0.09
595 0.14
596 0.14
597 0.23
598 0.25
599 0.26
600 0.28
601 0.3
602 0.31
603 0.29
604 0.3
605 0.22
606 0.24
607 0.27
608 0.28
609 0.26
610 0.26
611 0.24
612 0.25
613 0.27
614 0.28
615 0.31
616 0.28
617 0.28
618 0.27
619 0.29
620 0.3
621 0.31
622 0.26
623 0.19
624 0.23
625 0.22
626 0.23
627 0.21
628 0.17
629 0.15
630 0.15
631 0.15
632 0.12
633 0.18
634 0.21
635 0.24
636 0.24
637 0.25
638 0.25
639 0.26
640 0.23
641 0.21
642 0.19
643 0.21
644 0.22
645 0.23
646 0.27
647 0.26
648 0.31
649 0.28
650 0.31
651 0.34
652 0.39
653 0.41
654 0.45
655 0.48
656 0.48
657 0.57
658 0.6
659 0.57
660 0.55
661 0.61
662 0.63
663 0.67
664 0.67
665 0.6
666 0.52
667 0.46
668 0.44
669 0.38
670 0.31
671 0.31
672 0.29
673 0.29
674 0.28
675 0.28
676 0.23
677 0.22
678 0.23
679 0.25
680 0.32
681 0.38
682 0.42
683 0.45
684 0.51
685 0.5
686 0.49
687 0.5
688 0.48
689 0.49
690 0.56
691 0.62
692 0.64
693 0.69
694 0.71
695 0.7
696 0.63
697 0.57
698 0.5
699 0.41
700 0.36
701 0.32
702 0.28
703 0.2
704 0.2
705 0.16
706 0.14
707 0.12
708 0.13
709 0.1
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.14
714 0.16
715 0.2
716 0.24
717 0.27
718 0.27
719 0.34
720 0.39
721 0.48
722 0.53
723 0.59
724 0.59
725 0.61
726 0.65
727 0.66
728 0.6
729 0.52
730 0.45
731 0.39
732 0.34
733 0.31
734 0.29
735 0.19
736 0.21
737 0.21
738 0.27
739 0.31
740 0.36
741 0.4
742 0.45
743 0.54
744 0.6
745 0.68
746 0.68
747 0.64
748 0.65
749 0.65
750 0.63
751 0.58
752 0.54
753 0.51
754 0.45
755 0.46
756 0.39
757 0.34
758 0.34
759 0.35
760 0.35
761 0.33
762 0.34
763 0.36
764 0.41
765 0.47
766 0.45
767 0.44
768 0.41
769 0.41
770 0.45
771 0.47
772 0.46
773 0.41
774 0.42
775 0.43
776 0.44
777 0.43
778 0.41
779 0.43
780 0.47
781 0.53
782 0.59
783 0.6
784 0.62
785 0.66
786 0.67
787 0.66
788 0.67
789 0.68
790 0.68
791 0.69
792 0.71
793 0.68
794 0.69
795 0.65
796 0.63
797 0.54
798 0.46
799 0.39
800 0.36
801 0.35
802 0.28
803 0.23
804 0.16
805 0.2
806 0.18
807 0.2
808 0.19
809 0.23
810 0.28
811 0.31
812 0.34
813 0.34
814 0.38
815 0.36
816 0.35
817 0.3
818 0.26
819 0.25
820 0.23
821 0.18
822 0.14
823 0.12
824 0.1
825 0.1
826 0.09
827 0.07
828 0.07
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.1
835 0.1
836 0.09
837 0.07
838 0.07
839 0.08
840 0.09
841 0.08
842 0.08
843 0.1
844 0.1
845 0.11
846 0.1
847 0.11
848 0.1
849 0.11
850 0.12
851 0.11
852 0.12
853 0.11
854 0.12
855 0.11
856 0.11
857 0.1
858 0.09
859 0.08
860 0.06
861 0.06
862 0.05
863 0.04
864 0.05
865 0.05
866 0.06
867 0.07
868 0.08
869 0.09
870 0.1
871 0.11
872 0.11
873 0.11
874 0.11
875 0.11
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.14
883 0.14
884 0.17
885 0.18
886 0.23
887 0.24
888 0.27
889 0.36
890 0.41
891 0.48
892 0.49
893 0.52
894 0.5
895 0.49
896 0.5
897 0.42
898 0.34
899 0.3
900 0.26
901 0.21
902 0.19
903 0.18
904 0.13
905 0.13
906 0.12
907 0.1
908 0.1
909 0.13
910 0.12
911 0.14
912 0.15
913 0.15
914 0.19
915 0.22
916 0.26
917 0.25
918 0.25
919 0.23
920 0.24
921 0.28
922 0.3
923 0.29
924 0.27
925 0.27
926 0.27
927 0.27
928 0.26
929 0.23
930 0.17
931 0.15
932 0.14
933 0.12
934 0.12
935 0.11
936 0.1
937 0.1
938 0.1
939 0.08
940 0.08
941 0.07
942 0.07
943 0.07
944 0.06
945 0.07
946 0.09
947 0.1
948 0.11
949 0.15
950 0.2
951 0.26
952 0.28
953 0.37
954 0.42
955 0.51
956 0.57
957 0.63
958 0.64
959 0.69
960 0.73
961 0.73
962 0.72
963 0.66
964 0.6
965 0.61
966 0.57
967 0.55
968 0.54
969 0.47
970 0.43
971 0.41
972 0.41
973 0.32
974 0.29
975 0.23
976 0.22
977 0.24
978 0.23
979 0.21
980 0.2
981 0.21
982 0.21
983 0.19
984 0.18
985 0.14
986 0.15
987 0.15
988 0.15
989 0.14
990 0.13
991 0.14
992 0.16
993 0.21
994 0.25
995 0.32
996 0.35
997 0.36
998 0.39
999 0.43
1000 0.46
1001 0.47
1002 0.49
1003 0.46
1004 0.45
1005 0.44
1006 0.44
1007 0.39
1008 0.33
1009 0.26
1010 0.2
1011 0.17
1012 0.15
1013 0.15
1014 0.17
1015 0.19
1016 0.23
1017 0.23
1018 0.27
1019 0.27
1020 0.28
1021 0.3
1022 0.3
1023 0.33
1024 0.3
1025 0.31
1026 0.28
1027 0.28
1028 0.29
1029 0.29
1030 0.27
1031 0.24
1032 0.22
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.21
1036 0.19
1037 0.22
1038 0.19
1039 0.19
1040 0.2
1041 0.19
1042 0.18
1043 0.16
1044 0.17
1045 0.13
1046 0.14
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.11
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.08
1055 0.07
1056 0.05
1057 0.05
1058 0.06
1059 0.06
1060 0.07
1061 0.06
1062 0.1
1063 0.12
1064 0.12
1065 0.12
1066 0.14
1067 0.15
1068 0.19
1069 0.21
1070 0.19
1071 0.21
1072 0.23
1073 0.25
1074 0.26
1075 0.25
1076 0.22
1077 0.23
1078 0.22